65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5553 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5553  Chitinase  100 
 
 		 709 aa  1458    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.122706 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1943  chitinase  38.48 
 
 		 464 aa  194  6e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0117537  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1101  chitinase  38.43 
 
 		 565 aa  128  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0255  endochitinase  35.4 
 
 		 587 aa  108  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.931196 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0271  endochitinase  35.4 
 
 		 587 aa  108  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.527688  normal  0.775272 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0260  basic endochitinase  35.4 
 
 		 553 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0274  endochitinase  35.4 
 
 		 587 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0255  endochitinase  35.4 
 
 		 587 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.942643 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2175  chitinase  35.56 
 
 		 431 aa  105  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000288646  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5452  Chitinase  36.36 
 
 		 296 aa  104  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0310454  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4884  Chitinase  36 
 
 		 245 aa  103  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1920  Chitinase  35.44 
 
 		 359 aa  101  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4405  chitinase  34.17 
 
 		 353 aa  99.8  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01081  hypothetical protein  26.57 
 
 		 566 aa  95.9  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5336  Chitinase  34.01 
 
 		 368 aa  95.5  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0262432  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004329  chitinase  30 
 
 		 567 aa  95.1  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1329  Chitinase  34.83 
 
 		 295 aa  94.4  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3417  chitinase  34.85 
 
 		 266 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3366  chitinase  34.85 
 
 		 266 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3355  chitinase  34.85 
 
 		 266 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0298  putative chitinase  36.81 
 
 		 574 aa  92.4  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  32.52 
 
 		 384 aa  86.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7196  Chitinase  31.66 
 
 		 367 aa  83.2  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3140  chitinase  34.09 
 
 		 284 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  30.23 
 
 		 1362 aa  70.9  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  32.08 
 
 		 634 aa  61.6  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1165  glycosy hydrolase family protein  35.85 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00309995  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0892  glycosy hydrolase family protein  35.85 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0799389  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1962  glycosy hydrolase family protein  35.85 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0268  glycosy hydrolase family protein  35.85 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224241  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1606  glycosy hydrolase family protein  35.85 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2109  glycosy hydrolase family protein  36.84 
 
 		 453 aa  56.2  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  27.72 
 
 		 623 aa  56.6  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  40.68 
 
 		 816 aa  56.2  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1946  glycosy hydrolase family protein  36.84 
 
 		 453 aa  56.2  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2402  glycosy hydrolase family protein  35.79 
 
 		 504 aa  55.8  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1588  lysozyme  35.79 
 
 		 451 aa  55.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421382  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1569  chitinase  35.79 
 
 		 451 aa  55.1  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873549  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4818  glycosyl hydrolase family chitinase  35.79 
 
 		 451 aa  53.9  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  34.74 
 
 		 451 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  34.95 
 
 		 675 aa  53.9  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  34.74 
 
 		 451 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  34.74 
 
 		 451 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  28.38 
 
 		 393 aa  52.4  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  30.58 
 
 		 868 aa  52  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  30.58 
 
 		 868 aa  52  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  33.06 
 
 		 481 aa  51.6  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  35.82 
 
 		 1057 aa  49.3  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1172  Pyocin R2_PP, lytic enzyme  30.14 
 
 		 187 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  29.03 
 
 		 183 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.18 
 
 		 699 aa  48.1  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1704  glycosyl hydrolase family chitinase  35.85 
 
 		 543 aa  48.1  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.861913 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  28.93 
 
 		 868 aa  47.8  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2924  PKD domain containing protein  25.74 
 
 		 521 aa  48.1  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  27.43 
 
 		 1242 aa  47.4  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  40.43 
 
 		 426 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  26.6 
 
 		 1577 aa  47  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  25.77 
 
 		 863 aa  47  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  24 
 
 		 985 aa  45.8  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3209  Chitinase  43.75 
 
 		 537 aa  45.8  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.00289702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  29.17 
 
 		 189 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  37.74 
 
 		 846 aa  45.8  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  33.96 
 
 		 1051 aa  45.4  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  32.91 
 
 		 964 aa  44.3  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2735  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.61 
 
 		 669 aa  43.9  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.637714 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>