30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1181 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1181  acetyltransferase or hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  100 
 
 
268 aa  558  1e-158  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.899858  normal  0.618473 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0450  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  48.29 
 
 
275 aa  270  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0628  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  48.67 
 
 
270 aa  258  8e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1567  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  44.66 
 
 
275 aa  240  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  26.89 
 
 
217 aa  55.8  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0189  PGAP1 family protein  28.66 
 
 
784 aa  54.7  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  28.57 
 
 
225 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06571  lipase family protein  30.58 
 
 
197 aa  49.3  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  26.32 
 
 
342 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  29.51 
 
 
203 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.92 
 
 
286 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0592  lipase family protein  30.83 
 
 
197 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.320367  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06181  lipase family protein  29.41 
 
 
203 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  25.89 
 
 
281 aa  46.2  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18471  lipase family protein  26.96 
 
 
206 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.812999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7836  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 
300 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  31.36 
 
 
294 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5737  hypothetical protein  28.07 
 
 
245 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310215  normal  0.993413 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  25.2 
 
 
302 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  26.72 
 
 
313 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1162  lipase, class 2  27.64 
 
 
281 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128789  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0028  alpha/beta fold family lipase  27.64 
 
 
200 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  24.55 
 
 
311 aa  42.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  25.37 
 
 
2169 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06481  lipase family protein  27.64 
 
 
200 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.15202  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  24.78 
 
 
276 aa  42.7  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  30.69 
 
 
344 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  25.64 
 
 
223 aa  42.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  27.46 
 
 
298 aa  42.4  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  25.95 
 
 
222 aa  42.7  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>