175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3124 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3124  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 247 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0321729  normal  0.028375 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0524  Alpha/beta hydrolase  57.5 
 
 		 246 aa  256  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0610982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1914  alpha/beta fold family hydrolase  54.51 
 
 		 243 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5167  alpha/beta hydrolase fold  56.25 
 
 		 246 aa  248  7e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3254  alpha/beta hydrolase fold  56.25 
 
 		 246 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5114  alpha/beta hydrolase fold  56.25 
 
 		 246 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5050  alpha/beta hydrolase fold  53.11 
 
 		 243 aa  238  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03059  putative esterase protein  46.61 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.71029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1962  alpha/beta hydrolase fold  42.74 
 
 		 246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  38.1 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1074  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1767  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963183 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0638  alpha/beta hydrolase fold  23.55 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0653  alpha/beta hydrolase fold  23.55 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.748775  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  29.34 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  36.11 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1153  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 307 aa  57  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2174  alpha/beta hydrolase fold protein  23.73 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.633996  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1542  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  32.17 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2699  alpha/beta hydrolase  26.17 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03173  hypothetical protein  31.3 
 
 		 272 aa  53.1  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.188182 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1920  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  unclonable  0.00000223856 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6597  haloalkane dehalogenase  34 
 
 		 296 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000200949 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3502  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 		 268 aa  52  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0503333  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  27.83 
 
 		 315 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1589  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 		 343 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1100  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  26.48 
 
 		 264 aa  50.1  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  24.21 
 
 		 263 aa  50.4  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  36.11 
 
 		 264 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.754545  normal  0.278795 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2772  putative hydrolase protein  30.69 
 
 		 312 aa  49.3  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.97 
 
 		 264 aa  49.7  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.31361 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2065  alpha/beta hydrolase fold protein  32.79 
 
 		 252 aa  49.7  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0179548  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1540  putative hydrolase  38.61 
 
 		 264 aa  48.9  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153847  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 271 aa  48.9  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  31.11 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 		 305 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37 
 
 		 343 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  36.08 
 
 		 581 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3950  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 		 474 aa  47.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  25.51 
 
 		 305 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  29.84 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  33.67 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1773  alpha/beta hydrolase fold  28.7 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000223645  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2024  alpha/beta hydrolase fold  35.51 
 
 		 329 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1879  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 270 aa  47  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  38.55 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0616  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  24.51 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  33.63 
 
 		 278 aa  46.6  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1915  homoserine O-acetyltransferase  35.05 
 
 		 340 aa  47  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.17337  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.76 
 
 		 371 aa  47  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1986  homoserine O-acetyltransferase  35.05 
 
 		 340 aa  47  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.689313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3368  hydrolase, alpha/beta fold family  31.73 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000257055  hitchhiker  3.4538199999999996e-20 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 		 309 aa  46.6  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  27.1 
 
 		 390 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4878  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 		 281 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345435  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 270 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  32.41 
 
 		 275 aa  46.2  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  36.99 
 
 		 302 aa  46.6  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5281  alpha/beta hydrolase  24.7 
 
 		 272 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  33.98 
 
 		 306 aa  46.2  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  37.29 
 
 		 268 aa  46.2  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  35.85 
 
 		 270 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  32.35 
 
 		 280 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1960  hydrolase, alpha/beta fold family  30.77 
 
 		 254 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000316355  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 257 aa  45.8  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3775  alpha/beta hydrolase fold protein  35.19 
 
 		 309 aa  45.8  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0109  alpha/beta hydrolase fold  32.63 
 
 		 296 aa  45.8  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  31.5 
 
 		 275 aa  45.4  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 		 287 aa  45.4  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 		 361 aa  45.4  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2516  hydrolase, alpha/beta fold family  29.17 
 
 		 242 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018154  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  36.08 
 
 		 260 aa  45.4  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  24.69 
 
 		 254 aa  45.4  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2038  alpha/beta fold family hydrolase  30.77 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0252314  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2449  alpha/beta fold family hydrolase  29.17 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00496811  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4294  alpha/beta hydrolase fold protein  32.14 
 
 		 286 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  36.49 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3773  PGAP1 family protein  32.29 
 
 		 393 aa  44.7  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3691  putative hydrolase  36.73 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1900  alpha/beta fold family hydrolase  27.7 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1822  alpha/beta hydrolase fold  31.73 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.230718  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2217  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  36.84 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2171  alpha/beta fold family hydrolase  29.17 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0619801  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1870  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  32.99 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5458  alpha/beta hydrolase fold  26.51 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  21.72 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1800  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 		 260 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155348 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1923  alpha/beta hydrolase fold protein  32.65 
 
 		 304 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  29.82 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  31.63 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  24.08 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1445  alpha/beta hydrolase fold  34.58 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.55 
 
 		 368 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3669  alpha/beta hydrolase fold  38.78 
 
 		 306 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  29.82 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1764  alpha/beta hydrolase fold  36.45 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112264  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1121  alpha/beta hydrolase fold protein  35.58 
 
 		 322 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>