233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01560 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_01560  alpha/beta hydrolase superfamily protein  100 
 
 
288 aa  588  1e-167  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3075  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  38.38 
 
 
328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.698779 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0244  alpha/beta hydrolase fold protein  33.04 
 
 
303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2494  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 
297 aa  116  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120593  normal  0.158717 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4921  alpha/beta hydrolase fold  29.91 
 
 
322 aa  85.9  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  24.46 
 
 
562 aa  67  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  30.23 
 
 
324 aa  59.7  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  32.28 
 
 
335 aa  59.3  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2475  alpha/beta hydrolase fold protein  22.71 
 
 
287 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  23.11 
 
 
307 aa  57  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  23.57 
 
 
320 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 
320 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  24.35 
 
 
255 aa  56.2  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  30.21 
 
 
275 aa  56.2  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47043  predicted protein  27.03 
 
 
281 aa  55.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.33463  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1418  alpha/beta hydrolase fold protein  22.95 
 
 
276 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.961025  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2740  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 
294 aa  55.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  24.79 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6469  haloalkane dehalogenase  33.67 
 
 
287 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805806  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 
315 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 
334 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  23.51 
 
 
328 aa  52.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3577  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 
358 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0351  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 
275 aa  52.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.347807 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3170  alpha/beta hydrolase fold protein  26.51 
 
 
291 aa  52.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.702233  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0445  triacylglycerol lipase  28.51 
 
 
265 aa  52  0.00001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.193973  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1448  Alpha/beta hydrolase fold  22.92 
 
 
286 aa  51.2  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  29.73 
 
 
278 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  29.37 
 
 
316 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1621  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
298 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  32.69 
 
 
319 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  29.91 
 
 
291 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5044  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  25.13 
 
 
271 aa  50.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0743  alpha/beta hydrolase fold protein  33.61 
 
 
282 aa  50.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00683299  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2899  alpha/beta hydrolase fold protein  32.67 
 
 
283 aa  50.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39941  predicted protein  31.96 
 
 
313 aa  50.1  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.454558  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6254  alpha/beta hydrolase fold protein  21.52 
 
 
277 aa  50.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  29.91 
 
 
331 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  22.92 
 
 
288 aa  50.1  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  29.91 
 
 
294 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 
310 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  19.48 
 
 
329 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7956  haloalkane dehalogenase  27.27 
 
 
292 aa  49.3  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0950  alpha/beta hydrolase fold  28.44 
 
 
284 aa  49.3  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3278  alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 
351 aa  49.3  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  27.2 
 
 
281 aa  48.9  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1763  hydrolase, alpha/beta fold family  28.81 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  24.52 
 
 
275 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  20.55 
 
 
322 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
317 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0990  alpha/beta hydrolase fold  23.37 
 
 
298 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2084  alpha/beta hydrolase fold protein  23.44 
 
 
275 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446473  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  21.77 
 
 
286 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  25.81 
 
 
310 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4179  alpha/beta hydrolase fold  24.21 
 
 
271 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1592  secreted protein  27.37 
 
 
392 aa  48.5  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.121607  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  20.38 
 
 
301 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  21.51 
 
 
332 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  22.7 
 
 
304 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  28.7 
 
 
325 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  19.92 
 
 
308 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 
327 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 
321 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
299 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 
327 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 
321 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
299 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 
286 aa  48.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1620  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
303 aa  47.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 
321 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
299 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 
341 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3579  hydrolase, alpha/beta fold family  31.36 
 
 
310 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 
504 aa  47  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2437  alpha/beta hydrolase fold  20.34 
 
 
251 aa  47.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  23.29 
 
 
274 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1059  RTX protein  33.33 
 
 
2648 aa  47.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03264  carboxylesterase of pimeloyl-CoA synthesis  31.03 
 
 
256 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0414554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1573  alpha/beta fold family hydrolase  29.41 
 
 
286 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0133  streptothricin acetyltransferase Sat-1  24.6 
 
 
359 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03216  hypothetical protein  31.03 
 
 
256 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0353415  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0832  alpha/beta hydrolase fold protein  23.96 
 
 
225 aa  46.6  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.488949  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0301  carboxylesterase BioH  31.03 
 
 
256 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0475202 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
333 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2450  hydrolase with alpha/beta fold  22.42 
 
 
267 aa  47  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.805173 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  21.76 
 
 
262 aa  47  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0068  streptothricin acetyltransferase Sat-1  24.6 
 
 
336 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.470432  normal  0.337184 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
295 aa  47  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  23.83 
 
 
240 aa  47  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3609  carboxylesterase BioH  31.03 
 
 
256 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0301  bioH protein  31.03 
 
 
256 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100907  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5099  haloalkane dehalogenase  28.46 
 
 
295 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548735  normal  0.0388419 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  25.93 
 
 
304 aa  46.6  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3887  carboxylesterase BioH  31.03 
 
 
256 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.840174  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  22.94 
 
 
257 aa  46.6  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 
283 aa  46.6  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  25.78 
 
 
286 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4719  carboxylesterase BioH  31.03 
 
 
256 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29430  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.42 
 
 
246 aa  46.2  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0217971  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>