173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1059 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1059  RTX protein  100 
 
 		 2648 aa  5439    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1026  vgrG protein  60.76 
 
 		 1095 aa  514  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0824  putative phage minor structural protein  32.78 
 
 		 3104 aa  134  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0145  putative phage minor structural protein  32.37 
 
 		 3104 aa  130  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.520123  decreased coverage  0.0000000741368 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0825  virulence determinant  32.37 
 
 		 3110 aa  130  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3502  phospholipase/Carboxylesterase  35.11 
 
 		 307 aa  85.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2614  phospholipase/Carboxylesterase  35.11 
 
 		 307 aa  83.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4214  phospholipase/carboxylesterase  37.5 
 
 		 295 aa  79.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  42.42 
 
 		 290 aa  79  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  34.53 
 
 		 282 aa  76.6  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  43.48 
 
 		 271 aa  75.9  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  34.68 
 
 		 285 aa  73.2  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03668  putative hemolysin-type protein  25.86 
 
 		 692 aa  70.9  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  32.26 
 
 		 282 aa  69.7  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  32.59 
 
 		 276 aa  69.7  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  39.58 
 
 		 306 aa  69.7  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2532  hypothetical protein  30 
 
 		 292 aa  68.2  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  36.78 
 
 		 275 aa  67.8  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  31.97 
 
 		 287 aa  67.4  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  34.96 
 
 		 4334 aa  65.9  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  38.95 
 
 		 282 aa  64.7  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5076  hypothetical protein  30.36 
 
 		 736 aa  63.9  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3572  hypothetical protein  40.91 
 
 		 314 aa  63.2  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455992  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2535  hypothetical protein  32.46 
 
 		 274 aa  62.8  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.851232  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0262  Hemolysin-type calcium-binding region  31.62 
 
 		 729 aa  62.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  40.91 
 
 		 296 aa  62.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47043  predicted protein  27.73 
 
 		 281 aa  62.4  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.33463  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1252  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  36.52 
 
 		 294 aa  62.4  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696042  normal  0.518884 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2657  hypothetical protein  28.68 
 
 		 265 aa  62  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  29.59 
 
 		 245 aa  61.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2032  hypothetical protein  35.83 
 
 		 294 aa  62  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287773  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2527  hypothetical protein  29.17 
 
 		 265 aa  60.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  31.86 
 
 		 285 aa  60.5  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5537  Lysophospholipase-like protein  27.2 
 
 		 266 aa  60.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.738502  normal  0.85419 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3210  hypothetical protein  35.16 
 
 		 285 aa  60.1  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2864  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  31.77 
 
 		 728 aa  59.7  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  32.14 
 
 		 1844 aa  58.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.95 
 
 		 1236 aa  58.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2421  hypothetical protein  25.71 
 
 		 315 aa  58.9  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  29.86 
 
 		 1197 aa  59.3  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  30.7 
 
 		 277 aa  58.9  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3869  hypothetical protein  33.7 
 
 		 287 aa  59.3  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02210  conserved hypothetical protein  21.43 
 
 		 358 aa  58.2  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1951  hypothetical protein  31.33 
 
 		 314 aa  58.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.16 
 
 		 1963 aa  58.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  27.42 
 
 		 298 aa  57.4  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  31.21 
 
 		 281 aa  57.8  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  26.37 
 
 		 741 aa  57.8  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  26.42 
 
 		 639 aa  57.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  28.5 
 
 		 2667 aa  57  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  34.73 
 
 		 3619 aa  57  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03757  BEM46 family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G04660)  31.9 
 
 		 303 aa  56.6  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.913854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  30.63 
 
 		 742 aa  56.6  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40120  predicted protein  25.45 
 
 		 304 aa  56.6  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.98867  normal  0.767485 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1023  hypothetical protein  33.91 
 
 		 274 aa  56.6  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.0462853 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  31.48 
 
 		 298 aa  56.2  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.55 
 
 		 3427 aa  56.6  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3277  hemolysin-type calcium-binding region  28.35 
 
 		 371 aa  56.2  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.477972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  34.13 
 
 		 3619 aa  56.2  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4727  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.56 
 
 		 1027 aa  55.5  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  28.35 
 
 		 278 aa  55.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.3 
 
 		 2668 aa  55.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2300  hypothetical protein  30.12 
 
 		 739 aa  55.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.259939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0633  hypothetical protein  34.44 
 
 		 297 aa  55.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  28.26 
 
 		 795 aa  55.5  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  33.61 
 
 		 294 aa  55.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10362  predicted protein  27.34 
 
 		 299 aa  55.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203022  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  29.75 
 
 		 297 aa  54.7  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  30.52 
 
 		 5171 aa  54.7  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5147  hypothetical protein  35.42 
 
 		 336 aa  55.5  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252623 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0443  hypothetical protein  32.2 
 
 		 293 aa  54.7  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3451  hypothetical protein  29.84 
 
 		 275 aa  54.3  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  32.77 
 
 		 306 aa  54.3  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3467  hypothetical protein  33.61 
 
 		 332 aa  54.7  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  30.1 
 
 		 475 aa  54.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1156  hypothetical protein  36.27 
 
 		 294 aa  54.3  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  27.76 
 
 		 727 aa  53.9  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2116  hypothetical protein  36.14 
 
 		 286 aa  53.5  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.537851  normal  0.60451 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1297  hypothetical protein  33.33 
 
 		 324 aa  53.1  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12258  normal  0.997754 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2695  hypothetical protein  33.33 
 
 		 294 aa  53.5  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2656  hypothetical protein  28.03 
 
 		 276 aa  53.1  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  29.88 
 
 		 2107 aa  52.8  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2384  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  28.09 
 
 		 297 aa  52.8  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4726  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.91 
 
 		 826 aa  52.8  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 		 302 aa  52.8  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0104  putative hemolysin-type calcium-binding protein  29.07 
 
 		 960 aa  52.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  28.57 
 
 		 1883 aa  52  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  30.85 
 
 		 2105 aa  52.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4306  hemolysin-type calcium-binding region  33.53 
 
 		 682 aa  52.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0651981 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03833  conserved hypothetical protein  30.65 
 
 		 417 aa  51.6  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.028827  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1384  putative substrate of the Dot/Icm system  28.57 
 
 		 417 aa  51.6  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  30.26 
 
 		 2689 aa  51.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0004  hypothetical protein  34.55 
 
 		 414 aa  51.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28215  predicted protein  32.58 
 
 		 297 aa  51.6  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  31.56 
 
 		 2954 aa  51.6  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3343  putative lipoprotein  27.83 
 
 		 267 aa  51.6  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911253  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  29.61 
 
 		 475 aa  50.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4310  Hemolysin-type calcium-binding region  25.58 
 
 		 620 aa  51.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39340  AB-hydrolase-lipoprotein  28.45 
 
 		 295 aa  51.2  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 		 302 aa  50.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>