201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3788 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3788  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
330 aa  671    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2749  alpha/beta hydrolase fold  78.96 
 
 
330 aa  521  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3624  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
292 aa  95.5  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11863  hydrolase  29.06 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.905253 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
336 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0578  alpha/beta hydrolase fold protein  35.54 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3781  alpha/beta hydrolase fold  26 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0902  Alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3365  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3280  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  35.54 
 
 
334 aa  69.3  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2495  hydrolase, alpha/beta fold family  33.06 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2806  alpha/beta hydrolase fold protein  27.42 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645937  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19710  alpha/beta family hydrolase  25.87 
 
 
298 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1697  putative epoxide hydrolase  27.06 
 
 
298 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  32.37 
 
 
300 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  32.23 
 
 
303 aa  63.5  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 
275 aa  63.2  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0258  alpha/beta hydrolase fold protein  24.32 
 
 
283 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0266  alpha/beta hydrolase fold protein  29.51 
 
 
301 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  25.86 
 
 
274 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  35.71 
 
 
306 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 
321 aa  61.2  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 
293 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3479  alpha/beta hydrolase fold protein  28.69 
 
 
296 aa  59.7  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1895  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 
308 aa  59.7  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4484  alpha/beta hydrolase fold  25.49 
 
 
301 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4624  alpha/beta fold family hydrolase  25.1 
 
 
299 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.186809  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.84 
 
 
639 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 
311 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3323  alpha/beta hydrolase fold protein  28.69 
 
 
296 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3633  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
315 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0170844  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4608  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 
301 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.692037  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  31.71 
 
 
296 aa  57  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1031  alpha/beta hydrolase fold protein  27.39 
 
 
300 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  0.157173 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0178  alpha/beta hydrolase  29.27 
 
 
323 aa  57  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  35 
 
 
293 aa  56.6  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0814  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 
301 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  30.89 
 
 
323 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  31.67 
 
 
289 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5957  alpha/beta hydrolase fold  24.92 
 
 
296 aa  56.2  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0650876 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 
291 aa  56.2  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0771679  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6254  alpha/beta hydrolase fold protein  24.18 
 
 
277 aa  55.8  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  27.5 
 
 
303 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  29.51 
 
 
356 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0136  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 
289 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2769  alpha/beta hydrolase fold protein  26.28 
 
 
305 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2088  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 
297 aa  55.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0463  alpha/beta hydrolase fold protein  28.66 
 
 
296 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4177  alpha/beta hydrolase fold protein  36.84 
 
 
305 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1454  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
283 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  30.33 
 
 
409 aa  53.9  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3868  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 
305 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0873  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 
290 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0890  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 
290 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167811  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0879  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 
290 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7174  alpha/beta hydrolase fold  30.33 
 
 
284 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2886  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 
290 aa  53.1  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 
288 aa  52.8  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6597  alpha/beta hydrolase fold protein  30.93 
 
 
301 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446556  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  29.03 
 
 
329 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 
309 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  25.56 
 
 
284 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 
287 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 
296 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0956  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 
337 aa  52.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6462  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 
284 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.485183 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 
324 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0828  alpha/beta fold family hydrolase  28.93 
 
 
323 aa  51.6  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4275  putative hydrolase  30 
 
 
323 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0484838 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0129  alpha/beta hydrolase fold  37 
 
 
299 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3372  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 
287 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000420005  normal  0.0275463 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  31.63 
 
 
309 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 
298 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  26.45 
 
 
290 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4031  Alpha/beta hydrolase  29.9 
 
 
284 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 
289 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2524  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
271 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191212  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3137  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
271 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1418  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 
276 aa  50.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.961025  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 
321 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5689  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 
280 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0414771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  24.49 
 
 
335 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 
302 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3153  alpha/beta hydrolase fold  24.25 
 
 
271 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0769848 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 
297 aa  50.1  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26790  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.58 
 
 
290 aa  50.1  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.330263 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  28.44 
 
 
301 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  33.72 
 
 
297 aa  49.7  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  29.9 
 
 
301 aa  49.7  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5227  alpha/beta hydrolase fold protein  32.14 
 
 
233 aa  49.7  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.968895  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0481  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 
303 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838629  normal  0.605944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  31.96 
 
 
301 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  21.48 
 
 
504 aa  49.7  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
298 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
298 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
298 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 
298 aa  49.3  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0433  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 
296 aa  49.3  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  29.7 
 
 
316 aa  49.3  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>