More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4236 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4236  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 255 aa  504  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0388465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1653  alpha/beta hydrolase fold  53.39 
 
 		 274 aa  268  8.999999999999999e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0637812  hitchhiker  0.00860523 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  40.87 
 
 		 252 aa  139  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  28.46 
 
 		 296 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.84 
 
 		 285 aa  65.1  0.0000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5853  alpha/beta hydrolase fold protein  31.94 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3733  magnesium chelatase accessory protein  32.33 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229293  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3504  magnesium-chelatase 30 kDa subunit  30.39 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3199  magnesium chelatase accessory protein  31.71 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.825802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0635  alpha/beta hydrolase fold  24.65 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0650  alpha/beta hydrolase fold  24.65 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  28.97 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3767  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136912 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0314  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000332733  normal  0.010488 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  24.33 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3235  magnesium chelatase accessory protein  30.59 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25.88 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  40.71 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3010  magnesium chelatase accessory protein  30.08 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.219603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  27.56 
 
 		 311 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 		 292 aa  58.9  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 		 311 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  25 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0379  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.06 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  27.88 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  25.2 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  33.33 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  39.22 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  25.3 
 
 		 296 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  25.2 
 
 		 296 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  24.89 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  23.51 
 
 		 562 aa  57  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  29.74 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  29.82 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  25.89 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5281  alpha/beta hydrolase  27.38 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  26.2 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  29.39 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  27.04 
 
 		 390 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0348  magnesium chelatase accessory protein  32.56 
 
 		 322 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0558  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 		 338 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 		 342 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  25.69 
 
 		 425 aa  55.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  24.5 
 
 		 350 aa  55.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  25.36 
 
 		 295 aa  54.7  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  28.36 
 
 		 350 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1079  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.622662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 271 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1832  magnesium chelatase accessory protein  28.36 
 
 		 302 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  25.42 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 		 344 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3526  alpha/beta hydrolase fold  22.83 
 
 		 283 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  24.14 
 
 		 314 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 317 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2122  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.237751 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 		 226 aa  53.5  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1698  magnesium chelatase accessory protein  25.81 
 
 		 295 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 		 292 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  36.04 
 
 		 387 aa  53.9  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  26.52 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  26.51 
 
 		 275 aa  53.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  26.75 
 
 		 275 aa  53.1  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 		 271 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  39.77 
 
 		 272 aa  53.1  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1333  hypothetical protein  34.85 
 
 		 295 aa  53.1  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  29.84 
 
 		 266 aa  53.1  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 272 aa  53.1  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  29.34 
 
 		 282 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 		 367 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  30.74 
 
 		 396 aa  52.8  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  25.52 
 
 		 284 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 379 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  22.95 
 
 		 297 aa  52.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  26.33 
 
 		 333 aa  52.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 		 271 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  30.77 
 
 		 317 aa  52.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  38.24 
 
 		 330 aa  52.4  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  33.54 
 
 		 328 aa  52.4  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5689  alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 		 280 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0414771 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2252  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 		 242 aa  52  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0246146  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2417  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 		 242 aa  52  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.286524  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2065  magnesium chelatase accessory protein  41.11 
 
 		 384 aa  52  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>