98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6047 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6047  alpha/beta family hydrolase  100 
 
 		 244 aa  485  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0446  alpha/beta hydrolase fold  55.87 
 
 		 252 aa  262  4e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.352973  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5155  alpha/beta hydrolase fold  43.9 
 
 		 247 aa  135  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.811296  normal  0.168548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1175  alpha/beta hydrolase fold  41.2 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.634466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3876  alpha/beta hydrolase fold protein  39.84 
 
 		 249 aa  126  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.226038  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3740  alpha/beta hydrolase fold  40.24 
 
 		 247 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3801  alpha/beta hydrolase fold  39.84 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0108659 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3728  alpha/beta hydrolase fold  39.84 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.322506  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  36.4 
 
 		 249 aa  108  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  33.47 
 
 		 278 aa  99  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0795  alpha/beta hydrolase fold protein  35.12 
 
 		 267 aa  99  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  0.361628 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1240  alpha/beta hydrolase fold protein  31.91 
 
 		 295 aa  90.5  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4895  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0335992  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 		 291 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  29.21 
 
 		 302 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  24.28 
 
 		 288 aa  55.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 		 273 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.12 
 
 		 370 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  30.57 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3159  alpha/beta hydrolase  32.35 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  29.69 
 
 		 270 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5478  Alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 		 335 aa  50.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  27.39 
 
 		 278 aa  49.7  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2759  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 272 aa  49.3  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0191279  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2073  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 278 aa  49.3  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.944371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.85 
 
 		 370 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.67 
 
 		 371 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00059  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  32.5 
 
 		 238 aa  48.9  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 		 288 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3833  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 		 302 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.549204 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 274 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3781  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 		 279 aa  48.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2037  Alpha/beta hydrolase fold  25.66 
 
 		 302 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  25.1 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3635  alpha/beta hydrolase fold protein  28.39 
 
 		 281 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1748  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.77 
 
 		 371 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.572248  normal  0.0590997 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0534  alpha/beta hydrolase fold  27.32 
 
 		 336 aa  46.6  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3250  alpha/beta hydrolase fold protein  24.9 
 
 		 247 aa  46.6  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.176315 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.12 
 
 		 371 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  27.38 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.12 
 
 		 371 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  31.63 
 
 		 272 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  24.63 
 
 		 296 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4016  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 303 aa  46.2  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459613  normal  0.722956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5099  haloalkane dehalogenase  26.85 
 
 		 295 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548735  normal  0.0388419 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  22.98 
 
 		 278 aa  45.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 341 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  25.53 
 
 		 284 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4529  alpha/beta hydrolase fold  24.21 
 
 		 311 aa  45.8  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.190868 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 		 268 aa  45.8  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4071  alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 		 310 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 		 303 aa  45.8  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3884  alpha/beta hydrolase fold  24.16 
 
 		 286 aa  45.4  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.330831  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  26.4 
 
 		 302 aa  45.4  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1142  Alpha/beta hydrolase  23.81 
 
 		 307 aa  45.4  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6469  haloalkane dehalogenase  29.28 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805806  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  24.71 
 
 		 331 aa  44.7  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3527  alpha/beta hydrolase fold protein  30.99 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  27.46 
 
 		 311 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 		 273 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  25.82 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  24.36 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 462 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  27.1 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3170  alpha/beta hydrolase fold protein  40.79 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.702233  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1775  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.22 
 
 		 371 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  24 
 
 		 308 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 		 287 aa  43.9  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  26.34 
 
 		 301 aa  43.9  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 		 317 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  34.29 
 
 		 315 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000261715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  29.03 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  24.12 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  22.96 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  24.22 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  32.76 
 
 		 282 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4961  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  23.79 
 
 		 277 aa  43.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3691  alpha/beta hydrolase fold  24.1 
 
 		 312 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4677  alpha/beta hydrolase fold  24.1 
 
 		 312 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246976  normal  0.206505 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 		 273 aa  43.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  29.27 
 
 		 288 aa  42.7  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 		 270 aa  42.7  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 		 305 aa  42.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 		 288 aa  42.7  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8806  hydrolase  27.05 
 
 		 254 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.96 
 
 		 370 aa  42.7  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  24.18 
 
 		 260 aa  42.4  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5106  alpha/beta hydrolase fold protein  35.64 
 
 		 287 aa  42.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636822  normal  0.0262926 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3821  alpha/beta hydrolase fold  38.55 
 
 		 256 aa  42.4  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 333 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  26.53 
 
 		 321 aa  42.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5623  alpha/beta hydrolase fold  23.69 
 
 		 312 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0990  alpha/beta hydrolase fold  24.4 
 
 		 298 aa  42  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  29.01 
 
 		 304 aa  41.6  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>