33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3728 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3728  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 249 aa  494  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.322506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3801  alpha/beta hydrolase fold  99.6 
 
 		 247 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0108659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3740  alpha/beta hydrolase fold  98.79 
 
 		 247 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5155  alpha/beta hydrolase fold  71.66 
 
 		 247 aa  315  3e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.811296  normal  0.168548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1175  alpha/beta hydrolase fold  67.21 
 
 		 248 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.634466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3876  alpha/beta hydrolase fold protein  66.12 
 
 		 249 aa  296  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.226038  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  41.83 
 
 		 249 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0446  alpha/beta hydrolase fold  38.8 
 
 		 252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.352973  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6047  alpha/beta family hydrolase  39.84 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  31.84 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1240  alpha/beta hydrolase fold protein  30.64 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0795  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  0.361628 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2355  alpha/beta fold family hydrolase  44.05 
 
 		 345 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.110523  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.12 
 
 		 285 aa  48.5  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  39.6 
 
 		 315 aa  48.5  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000261715  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  20.76 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  35.87 
 
 		 344 aa  45.8  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  40.51 
 
 		 592 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  27.63 
 
 		 462 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2350  hypothetical protein  33.33 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000109829  hitchhiker  0.000000775471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.59 
 
 		 602 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1047  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.975256  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3859  alpha/beta hydrolase fold  35.05 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  41.56 
 
 		 590 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3055  Alpha/beta hydrolase fold  24.53 
 
 		 281 aa  42.4  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610584 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  26.54 
 
 		 462 aa  42.4  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 		 268 aa  42.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5099  haloalkane dehalogenase  26.88 
 
 		 295 aa  42  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548735  normal  0.0388419 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  24.32 
 
 		 345 aa  42  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  34.44 
 
 		 281 aa  42  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>