17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6052 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6052  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 286 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.377269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5822  alpha/beta hydrolase fold  97.55 
 
 		 286 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1571  hypothetical protein  42.24 
 
 		 285 aa  218  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1653  hypothetical protein  42.24 
 
 		 285 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.57291  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1230  hypothetical protein  41.09 
 
 		 285 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.255068  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2590  alpha/beta hydrolase fold protein  30.26 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2609  Alpha/beta hydrolase fold  25.79 
 
 		 403 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.194987  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4708  coronamic acid synthetase CmaE  24.62 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.781162  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1067  Male sterility-like protein  22.58 
 
 		 685 aa  57.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0431  alpha/beta hydrolase fold-1 protein  27.66 
 
 		 271 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  22.63 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1106  alpha/beta hydrolase fold protein  25.11 
 
 		 283 aa  46.6  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.112481  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  21.32 
 
 		 275 aa  45.8  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4397  carboxylesterase  25.77 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00786026  normal  0.386096 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 		 300 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0431  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 325 aa  43.5  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0538885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  27.86 
 
 		 260 aa  42.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>