More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0364 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0364  Male sterility domain protein  100 
 
 		 493 aa  1024    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2676  hypothetical protein  32.64 
 
 		 373 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0511814 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  32.99 
 
 		 937 aa  125  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4147  hypothetical protein  30.46 
 
 		 366 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3013  hypothetical protein  30.71 
 
 		 366 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0103839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4094  Male sterility domain protein  32.87 
 
 		 359 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.796216  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2778  male sterility domain protein  34.14 
 
 		 383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2871  Male sterility domain protein  34.14 
 
 		 381 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.79 
 
 		 383 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1667  hypothetical protein  34.29 
 
 		 358 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0262372  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1327  Male sterility domain protein  33.69 
 
 		 356 aa  113  8.000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38219  normal  0.51823 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1067  Male sterility-like protein  27.7 
 
 		 685 aa  106  9e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1104  Male sterility domain protein  30.91 
 
 		 701 aa  105  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972313  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  30.27 
 
 		 664 aa  105  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4933  Male sterility domain protein  35.38 
 
 		 437 aa  103  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  0.407936 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2917  short chain dehydrogenase  31.99 
 
 		 665 aa  103  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0126943  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2522  Male sterility domain protein  35.19 
 
 		 410 aa  103  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  28.77 
 
 		 661 aa  103  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4728  hypothetical protein  31.03 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0491  short chain dehydrogenase  30.41 
 
 		 668 aa  101  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442129 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5489  amino acid adenylation domain-containing protein  32.51 
 
 		 2439 aa  97.8  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934581 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  29.89 
 
 		 659 aa  96.7  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3608  Male sterility domain protein  27.6 
 
 		 637 aa  96.3  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.619777  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  28.38 
 
 		 671 aa  96.3  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  30.63 
 
 		 671 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3148  Male sterility domain protein  31.8 
 
 		 354 aa  94.4  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2595  thioester reductase  24.3 
 
 		 506 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.410224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2092  AMP-dependent synthetase and ligase  31.34 
 
 		 1406 aa  93.2  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261871  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2731  Male sterility domain protein  28.62 
 
 		 392 aa  90.9  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.885706  hitchhiker  0.00797999 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2551  hypothetical protein  28.61 
 
 		 351 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0234245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  33.17 
 
 		 1408 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7636  AMP-dependent synthetase and ligase  26.79 
 
 		 1444 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  28.72 
 
 		 665 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7306  peptide synthetase  28.72 
 
 		 1506 aa  83.2  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.370247  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  25 
 
 		 1454 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2104  thioester reductase domain-containing protein  25.6 
 
 		 523 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1527  short chain dehydrogenase  29.15 
 
 		 653 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1856  polyketide non-ribosomal peptide synthase  25.34 
 
 		 4123 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0434  polyketide synthase  25.34 
 
 		 4157 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1750  Male sterility domain protein  28.21 
 
 		 642 aa  77.8  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0845  hypothetical protein  25.34 
 
 		 4101 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1451.1  hypothetical protein  25.34 
 
 		 4580 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  31.27 
 
 		 2113 aa  78.2  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0530  putative polyketide synthase PksM  25.34 
 
 		 4122 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2161  hypothetical protein  25.34 
 
 		 4098 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05610  aminoadipate reductase large subunit (Eurofung)  28.26 
 
 		 1421 aa  77.4  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0476531 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3912  thioester reductase domain-containing protein  23.43 
 
 		 505 aa  76.3  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501975  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1084  non-ribosomal peptide synthetase modules and related proteins-like protein  33.87 
 
 		 2638 aa  74.7  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13425  short chain dehydrogenase  27.62 
 
 		 650 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2578  thioester reductase domain-containing protein  29 
 
 		 1162 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615079 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2553  dehydrogenase domain-containing protein  26.15 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10102  peptide synthetase nrp  30.94 
 
 		 2512 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  26.46 
 
 		 1067 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5128  Male sterility domain protein  31.4 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2093  polyketide synthase, putative  24.05 
 
 		 4048 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01034  polyketide synthase, putative (JCVI)  25.8 
 
 		 2793 aa  71.2  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.276801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  25.58 
 
 		 2374 aa  70.9  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  31.14 
 
 		 2107 aa  70.5  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03230  polyketide synthase, putative (JCVI)  26.59 
 
 		 2193 aa  70.1  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  25.25 
 
 		 1270 aa  69.3  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2232  amino acid adenylation domain protein  30.11 
 
 		 1395 aa  70.1  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.214627 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03386  polyketide synthase, putative (JCVI)  28.9 
 
 		 2493 aa  68.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4292  amino acid adenylation domain-containing protein  31.79 
 
 		 1188 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375384  normal  0.670751 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12610  fatty-acid-CoA ligase fadD9  24.77 
 
 		 1168 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.945549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  27.11 
 
 		 2376 aa  67.4  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2112  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 750 aa  66.6  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68020  L-aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase, large subunit  24.91 
 
 		 1394 aa  66.6  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224506  normal  0.0608631 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  24.66 
 
 		 1498 aa  66.6  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 		 306 aa  66.6  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0368  amino acid adenylation domain-containing protein  25.67 
 
 		 1194 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4890  amino acid adenylation domain-containing protein  27.76 
 
 		 1500 aa  65.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.365672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4416  amino acid adenylation domain-containing protein  28.41 
 
 		 1485 aa  65.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4973  amino acid adenylation  36.23 
 
 		 1188 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432296  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3187  amino acid adenylation domain-containing protein  36.23 
 
 		 1188 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00170  aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase, putative  28.51 
 
 		 1409 aa  65.1  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.682323  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  32.58 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3227  hypothetical protein  27.19 
 
 		 618 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0125277  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5457  ornithine acetyl transferase inhibitor  31.84 
 
 		 1149 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2086  linear gramicidin synthetase subunit D  27.87 
 
 		 1002 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0002  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.5 
 
 		 322 aa  62.4  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1805  amino acid adenylation domain-containing protein  23.18 
 
 		 1413 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.323791  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  23.47 
 
 		 2054 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.56 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0280203  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27140  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  30.35 
 
 		 768 aa  62  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3702  thioester reductase domain protein  25.99 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3755  thioester reductase domain protein  25.99 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.801599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3396  putative non-ribosomal peptide synthetase  27.54 
 
 		 809 aa  62  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5388  amino acid adenylation domain-containing protein  25.17 
 
 		 997 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1432  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  34.68 
 
 		 770 aa  61.2  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.438652  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4881  linear gramicidin synthetase subunit C  25.08 
 
 		 1193 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0443  linear gramicidin synthetase subunit C  24.07 
 
 		 1193 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1373  thioester reductase domain protein  26.99 
 
 		 1105 aa  60.8  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  23.31 
 
 		 1449 aa  60.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2271  thioester reductase  31.28 
 
 		 1174 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2318  thioester reductase domain-containing protein  31.28 
 
 		 1174 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.662408 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2310  thioester reductase domain-containing protein  31.28 
 
 		 1174 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.992099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2186  non-ribosomal peptide synthase MxaA  29.1 
 
 		 1436 aa  60.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026407  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02032  polyketide synthase, putative (JCVI)  25.74 
 
 		 2221 aa  59.7  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0972795  normal  0.27819 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3085  hypothetical protein  26.8 
 
 		 369 aa  59.7  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2045  mxaA domain protein  26.29 
 
 		 618 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>