88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2553 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2553  dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 		 369 aa  756    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0364  Male sterility domain protein  26.15 
 
 		 493 aa  73.6  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2551  hypothetical protein  29.61 
 
 		 351 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0234245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3148  Male sterility domain protein  26.85 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1667  hypothetical protein  28.4 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0262372  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4094  Male sterility domain protein  25.29 
 
 		 359 aa  62.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.796216  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3013  hypothetical protein  26.92 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0103839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5128  Male sterility domain protein  28.95 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4147  hypothetical protein  26.5 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2676  hypothetical protein  29.57 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0511814 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2522  Male sterility domain protein  27.72 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0491  short chain dehydrogenase  26.59 
 
 		 668 aa  58.2  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442129 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  23.21 
 
 		 937 aa  57.8  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  25.78 
 
 		 664 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2871  Male sterility domain protein  26.52 
 
 		 381 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4728  hypothetical protein  26.24 
 
 		 354 aa  57  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1327  Male sterility domain protein  26.17 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38219  normal  0.51823 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2778  male sterility domain protein  26.14 
 
 		 383 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.14 
 
 		 383 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3235  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.48 
 
 		 352 aa  54.3  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  23.55 
 
 		 661 aa  53.5  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4933  Male sterility domain protein  26.87 
 
 		 437 aa  53.9  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  0.407936 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  27.05 
 
 		 671 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2731  Male sterility domain protein  26.61 
 
 		 392 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.885706  hitchhiker  0.00797999 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3608  Male sterility domain protein  25.88 
 
 		 637 aa  51.6  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.619777  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  23.92 
 
 		 1067 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1067  Male sterility-like protein  26.39 
 
 		 685 aa  50.1  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0957  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.36 
 
 		 357 aa  50.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.177421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  38.46 
 
 		 4840 aa  50.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0186  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  22.71 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0824  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  23.39 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  24.08 
 
 		 665 aa  49.3  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2578  thioester reductase domain-containing protein  25.99 
 
 		 1162 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615079 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1198  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.99 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  29.19 
 
 		 340 aa  47.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  23.4 
 
 		 2113 aa  47.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1669  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.98 
 
 		 357 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2097  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.71 
 
 		 347 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0795  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  23.05 
 
 		 359 aa  46.6  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2404  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.1 
 
 		 323 aa  46.6  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1749  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.47 
 
 		 354 aa  46.6  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  24.36 
 
 		 671 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4170  HAD family hydrolase  28.28 
 
 		 787 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243579  normal  0.356217 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1104  Male sterility domain protein  23.98 
 
 		 701 aa  46.2  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972313  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1222  dTDP-glucose-4,6-dehydratase  30.93 
 
 		 348 aa  46.2  0.0009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.4 
 
 		 319 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2318  thioester reductase domain-containing protein  25.71 
 
 		 1174 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.662408 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2291  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.29 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.494545  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2104  thioester reductase domain-containing protein  23.88 
 
 		 523 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2182  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.32 
 
 		 340 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12610  fatty-acid-CoA ligase fadD9  25.55 
 
 		 1168 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.945549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2271  thioester reductase  25.71 
 
 		 1174 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1511  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.1 
 
 		 351 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2310  thioester reductase domain-containing protein  25.71 
 
 		 1174 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.992099 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0260  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.04 
 
 		 327 aa  45.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0512  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  19.61 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2209  hypothetical protein  24.57 
 
 		 514 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3229  Male sterility-like  29.01 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2075  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.59 
 
 		 366 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0864456  normal  0.131531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3296  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.04 
 
 		 332 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0222371  normal  0.147451 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03495  nonribosomal peptide synthase, putative (Eurofung)  23.85 
 
 		 1480 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1803  UDP-sugar epimerase  29.89 
 
 		 323 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.198516  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2639  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.67 
 
 		 356 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.997652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2735  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.03 
 
 		 354 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44311  hypothetical protein  24.15 
 
 		 385 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  19.61 
 
 		 352 aa  44.7  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1239  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.56 
 
 		 364 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.46 
 
 		 354 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.901656 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6255  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.13 
 
 		 353 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1217  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.26 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1394  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.61 
 
 		 325 aa  43.9  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.32 
 
 		 329 aa  43.9  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0216  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.47 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.240285  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0939  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  20.06 
 
 		 348 aa  43.5  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1685  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.98 
 
 		 342 aa  43.5  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  36.79 
 
 		 333 aa  43.5  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1723  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.28 
 
 		 341 aa  43.5  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000370368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1911  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25 
 
 		 355 aa  43.5  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259449 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0142  short chain dehydrogenase  35.56 
 
 		 266 aa  43.5  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3829  hypothetical protein  27.9 
 
 		 362 aa  43.1  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13118  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.47 
 
 		 350 aa  43.1  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.399683  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0141  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.75 
 
 		 340 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.215848 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1658  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.38 
 
 		 359 aa  43.1  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.548961  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2467  NmrA family protein  41.46 
 
 		 287 aa  42.7  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.311321 
 
 
-
 
NC_002936  DET0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.73 
 
 		 312 aa  42.7  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19450  phosphoserine phosphatase  25.18 
 
 		 778 aa  42.7  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13425  short chain dehydrogenase  25.57 
 
 		 650 aa  42.7  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3491  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25 
 
 		 354 aa  42.7  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.370229 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>