More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12610 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2271  thioester reductase  67.91 
 
 		 1174 aa  1558    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1373  thioester reductase domain protein  46.56 
 
 		 1105 aa  904    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12610  fatty-acid-CoA ligase fadD9  100 
 
 		 1168 aa  2369    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.945549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2310  thioester reductase domain-containing protein  67.91 
 
 		 1174 aa  1561    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.992099 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2318  thioester reductase domain-containing protein  67.91 
 
 		 1174 aa  1558    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.662408 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2578  thioester reductase domain-containing protein  66.89 
 
 		 1162 aa  1543    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615079 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3148  thioester reductase domain-containing protein  52.51 
 
 		 1165 aa  1090    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.209957 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10102  peptide synthetase nrp  39.02 
 
 		 2512 aa  615  9.999999999999999e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26758  predicted protein  30.05 
 
 		 630 aa  239  2e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0405652 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  23.8 
 
 		 1454 aa  185  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17720  precursor of ligase long chain acyl-coa ligase  25.49 
 
 		 678 aa  173  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00660  long-chain-fatty-acid-CoA ligase, putative  26.64 
 
 		 727 aa  167  1.0000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.665335  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06014  fatty acid activator Faa4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09910)  27.68 
 
 		 698 aa  164  9e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.547026 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1805  amino acid adenylation domain-containing protein  25.9 
 
 		 1413 aa  163  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.323791  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00710  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase, putative  26.88 
 
 		 706 aa  162  3e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35069  long-chain fatty acid CoA ligase  26.95 
 
 		 718 aa  160  1e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.193785  normal  0.930837 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24496  predicted protein  24.25 
 
 		 667 aa  157  9e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  26.32 
 
 		 633 aa  154  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58181  long-chain fatty acid CoA ligase  26.21 
 
 		 753 aa  154  8.999999999999999e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  25.53 
 
 		 1067 aa  154  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  25.13 
 
 		 610 aa  154  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  26.62 
 
 		 587 aa  153  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89450  long-chain-fatty-acid CoA ligase  23.51 
 
 		 720 aa  150  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.67886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  25.63 
 
 		 610 aa  150  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4890  amino acid adenylation domain-containing protein  28.4 
 
 		 1500 aa  149  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.365672 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  23.92 
 
 		 610 aa  148  5e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0331  AMP-dependent synthetase and ligase  25.13 
 
 		 555 aa  148  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167581 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0326  AMP-dependent synthetase and ligase  25.83 
 
 		 554 aa  148  6e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  0.942531 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3617  AMP-dependent synthetase and ligase  25.83 
 
 		 554 aa  147  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3751  AMP-dependent synthetase and ligase  26.86 
 
 		 647 aa  146  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.673702 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  26.77 
 
 		 1270 aa  145  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4186  AMP-dependent synthetase and ligase  26.01 
 
 		 598 aa  145  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65071  long-chain fatty acid--CoA ligase and synthetase 4  27.23 
 
 		 699 aa  145  5e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.418644  normal  0.491736 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08280  AMP-binding enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04270)  26.33 
 
 		 708 aa  145  6e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3814  AMP-dependent synthetase and ligase  25.65 
 
 		 554 aa  144  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.354824  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1145  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  25 
 
 		 607 aa  143  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05330  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  27.41 
 
 		 612 aa  144  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0779  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.4 
 
 		 614 aa  143  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  hitchhiker  0.00265448 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  26.63 
 
 		 598 aa  142  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  26.38 
 
 		 597 aa  142  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  26.15 
 
 		 604 aa  142  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3437  AMP-dependent synthetase and ligase  26.67 
 
 		 555 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.915272  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  25.38 
 
 		 598 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  26.61 
 
 		 612 aa  141  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0355  AMP-binding protein  25.31 
 
 		 554 aa  141  7e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  24.75 
 
 		 610 aa  141  7e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3973  AMP-dependent synthetase and ligase  27.02 
 
 		 597 aa  141  7e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2212  AMP-dependent synthetase and ligase  27.17 
 
 		 685 aa  141  7e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.169636 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4416  amino acid adenylation domain-containing protein  27.94 
 
 		 1485 aa  141  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  25.89 
 
 		 598 aa  141  7.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2479  AMP-dependent synthetase and ligase  27.39 
 
 		 559 aa  140  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  24.29 
 
 		 607 aa  140  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7306  peptide synthetase  28.05 
 
 		 1506 aa  140  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.370247  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  26.28 
 
 		 660 aa  139  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.83669 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  26.49 
 
 		 547 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  24.74 
 
 		 598 aa  138  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  24.11 
 
 		 611 aa  138  5e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0349  AMP-dependent synthetase and ligase  25.83 
 
 		 554 aa  138  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000814911  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0351  AMP-dependent synthetase and ligase  26.22 
 
 		 554 aa  138  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.597598  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  25.08 
 
 		 609 aa  138  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0261  AMP-dependent synthetase and ligase  25.54 
 
 		 551 aa  138  7.000000000000001e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000998406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  24.41 
 
 		 610 aa  137  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3656  putative AMP-binding protein  27.08 
 
 		 555 aa  137  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.330411  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  26.19 
 
 		 622 aa  136  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  25.34 
 
 		 597 aa  137  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01022  AMP-binding protein  24.91 
 
 		 559 aa  136  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1168  AMP-dependent synthetase and ligase  27.82 
 
 		 616 aa  137  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.549582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10861  hypothetical protein  24.35 
 
 		 2199 aa  136  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  26.43 
 
 		 598 aa  135  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  25.13 
 
 		 601 aa  136  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  24.53 
 
 		 596 aa  136  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  24.13 
 
 		 590 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0631  putative AMP-binding acetyl-CoA synthetase  23.71 
 
 		 558 aa  135  5e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.365879  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  25.17 
 
 		 597 aa  135  5e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  25.17 
 
 		 597 aa  135  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3173  AMP-dependent synthetase and ligase  25.36 
 
 		 658 aa  135  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  25.88 
 
 		 599 aa  135  6e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0359  AMP-dependent synthetase and ligase  26.04 
 
 		 554 aa  135  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00409412  decreased coverage  0.000000000100216 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  26.61 
 
 		 610 aa  134  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  26.33 
 
 		 605 aa  134  7.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2888  AMP-dependent synthetase and ligase  26.57 
 
 		 560 aa  134  7.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0719534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  22.49 
 
 		 2054 aa  134  9e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  26.63 
 
 		 630 aa  134  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0075  AMP-binding family protein  25.04 
 
 		 568 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  26.07 
 
 		 633 aa  134  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3502  AMP-dependent synthetase and ligase  23.48 
 
 		 551 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4587  AMP-dependent synthetase and ligase  24.51 
 
 		 551 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000231553  unclonable  0.0000000387525 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0633  AMP-dependent synthetase and ligase  23.79 
 
 		 601 aa  133  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178096  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0595  AMP-dependent synthetase and ligase  25.09 
 
 		 601 aa  133  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  25.64 
 
 		 592 aa  133  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43610  putative AMP-binding protein  26.76 
 
 		 555 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  27.12 
 
 		 608 aa  133  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0356  AMP-dependent synthetase and ligase  25.48 
 
 		 554 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  24.79 
 
 		 602 aa  133  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  25.35 
 
 		 554 aa  132  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00109176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4881  linear gramicidin synthetase subunit C  22.21 
 
 		 1193 aa  133  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  25.88 
 
 		 599 aa  132  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08105  NRPS-like enzyme, putative (JCVI)  25.58 
 
 		 1077 aa  132  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.250944 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0077  AMP-dependent synthetase and ligase  24.87 
 
 		 601 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4205  AMP-dependent synthetase and ligase  25.29 
 
 		 551 aa  132  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>