More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3148 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3148  thioester reductase domain-containing protein  100 
 
 
1165 aa  2318    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.209957 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2310  thioester reductase domain-containing protein  52.41 
 
 
1174 aa  1125    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.992099 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1373  thioester reductase domain protein  45.91 
 
 
1105 aa  886    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2271  thioester reductase  52.41 
 
 
1174 aa  1118    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2318  thioester reductase domain-containing protein  52.41 
 
 
1174 aa  1118    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.662408 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12610  fatty-acid-CoA ligase fadD9  52.58 
 
 
1168 aa  1118    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.945549  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2578  thioester reductase domain-containing protein  52.42 
 
 
1162 aa  1121    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.615079 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10102  peptide synthetase nrp  40.56 
 
 
2512 aa  457  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26758  predicted protein  27.68 
 
 
630 aa  195  4e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0405652 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  24.91 
 
 
1067 aa  170  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17720  precursor of ligase long chain acyl-coa ligase  27.41 
 
 
678 aa  169  2.9999999999999998e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  24.13 
 
 
1454 aa  164  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4292  amino acid adenylation domain-containing protein  32.16 
 
 
1188 aa  159  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375384  normal  0.670751 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08280  AMP-binding enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04270)  24.76 
 
 
708 aa  157  9e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00660  long-chain-fatty-acid-CoA ligase, putative  30.73 
 
 
727 aa  154  5.9999999999999996e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.665335  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4973  amino acid adenylation  31.18 
 
 
1188 aa  153  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432296  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4890  amino acid adenylation domain-containing protein  27.79 
 
 
1500 aa  153  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.365672 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3187  amino acid adenylation domain-containing protein  31.18 
 
 
1188 aa  153  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  25.89 
 
 
1270 aa  147  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4416  amino acid adenylation domain-containing protein  26.81 
 
 
1485 aa  147  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  26.1 
 
 
1449 aa  147  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3751  AMP-dependent synthetase and ligase  28.32 
 
 
647 aa  146  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.673702 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2479  AMP-dependent synthetase and ligase  31.02 
 
 
559 aa  144  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0331  AMP-dependent synthetase and ligase  26.19 
 
 
555 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.167581 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2104  thioester reductase domain-containing protein  30.09 
 
 
523 aa  138  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1805  amino acid adenylation domain-containing protein  24.8 
 
 
1413 aa  135  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.323791  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11140  putative nonribosomal peptide synthetase  28.82 
 
 
991 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7306  peptide synthetase  28.17 
 
 
1506 aa  133  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.370247  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3912  thioester reductase domain-containing protein  27.17 
 
 
505 aa  132  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501975  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3502  AMP-dependent synthetase and ligase  26.19 
 
 
551 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43610  putative AMP-binding protein  27.67 
 
 
555 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297438  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  26.15 
 
 
610 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4587  AMP-dependent synthetase and ligase  25.35 
 
 
551 aa  130  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000231553  unclonable  0.0000000387525 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3656  putative AMP-binding protein  27.75 
 
 
555 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.330411  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2595  thioester reductase  27.65 
 
 
506 aa  129  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.410224  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  26.68 
 
 
610 aa  128  5e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58181  long-chain fatty acid CoA ligase  24.72 
 
 
753 aa  128  6e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  24.92 
 
 
669 aa  127  9e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  25.35 
 
 
551 aa  127  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000026311  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2186  non-ribosomal peptide synthase MxaA  28.44 
 
 
1436 aa  127  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026407  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  24.55 
 
 
610 aa  127  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  26.84 
 
 
652 aa  126  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  26.22 
 
 
633 aa  127  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  26.01 
 
 
587 aa  127  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0261  AMP-dependent synthetase and ligase  25.95 
 
 
551 aa  125  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000998406  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00710  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase, putative  25.09 
 
 
706 aa  125  4e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0355  AMP-binding protein  24.7 
 
 
554 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00170  aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase, putative  23.82 
 
 
1409 aa  124  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.682323  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  25.53 
 
 
622 aa  124  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  26.05 
 
 
592 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0077  AMP-dependent synthetase and ligase  24.29 
 
 
601 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  25.41 
 
 
610 aa  123  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10861  hypothetical protein  23.33 
 
 
2199 aa  124  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  25.71 
 
 
605 aa  122  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  25.91 
 
 
599 aa  122  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  25.62 
 
 
600 aa  122  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1168  AMP-dependent synthetase and ligase  28.5 
 
 
616 aa  122  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.549582  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4274  AMP-dependent synthetase and ligase  24.29 
 
 
601 aa  122  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35069  long-chain fatty acid CoA ligase  23.94 
 
 
718 aa  122  4.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.193785  normal  0.930837 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  27.43 
 
 
605 aa  121  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0075  AMP-dependent synthetase and ligase  24.09 
 
 
601 aa  121  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  24.16 
 
 
601 aa  121  9e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06014  fatty acid activator Faa4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09910)  24.78 
 
 
698 aa  120  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.547026 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24496  predicted protein  24.58 
 
 
667 aa  120  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0126  amino acid adenylation:thioester reductase  25.1 
 
 
1129 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.488136  normal  0.545759 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  25.27 
 
 
598 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1023  amino acid adenylation domain-containing protein  28.76 
 
 
992 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  25.65 
 
 
605 aa  120  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  24.32 
 
 
596 aa  120  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2120  AMP-dependent synthetase and ligase  25 
 
 
672 aa  120  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342483  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  24.34 
 
 
607 aa  119  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  25.84 
 
 
599 aa  119  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2556  AMP-dependent synthetase and ligase  26.46 
 
 
660 aa  118  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  26 
 
 
622 aa  118  6.9999999999999995e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  24.74 
 
 
604 aa  117  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5388  amino acid adenylation domain-containing protein  27.63 
 
 
997 aa  118  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82388  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68020  L-aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase, large subunit  23.91 
 
 
1394 aa  117  8.999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224506  normal  0.0608631 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  26.16 
 
 
597 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  24.74 
 
 
604 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  27.35 
 
 
604 aa  117  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3617  AMP-dependent synthetase and ligase  24.53 
 
 
554 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0326  AMP-dependent synthetase and ligase  24.53 
 
 
554 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  0.942531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  26.74 
 
 
601 aa  116  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  24.87 
 
 
604 aa  117  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  25.53 
 
 
607 aa  117  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0351  AMP-dependent synthetase and ligase  24.53 
 
 
554 aa  117  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.597598  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  25.21 
 
 
597 aa  115  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  24.61 
 
 
554 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00109176  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2970  AMP-dependent synthetase and ligase  28.07 
 
 
546 aa  115  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383632  normal  0.0772174 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  25.13 
 
 
610 aa  115  5e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  25.28 
 
 
637 aa  115  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2212  AMP-dependent synthetase and ligase  25.83 
 
 
685 aa  114  7.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.169636 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  23.79 
 
 
649 aa  115  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  24.68 
 
 
606 aa  114  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1451.1  hypothetical protein  30.3 
 
 
4580 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  27.05 
 
 
602 aa  114  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01120  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  26.93 
 
 
606 aa  114  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  25.99 
 
 
609 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  25.34 
 
 
597 aa  114  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  25.34 
 
 
597 aa  114  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>