More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_24496 on replicon NC_009359
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009359  OSTLU_24496  predicted protein  100 
 
 
667 aa  1377    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06014  fatty acid activator Faa4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09910)  35.03 
 
 
698 aa  355  1e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.547026 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00710  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase, putative  33.49 
 
 
706 aa  322  9.999999999999999e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20143  long chain acyl-coa synthetase  31.72 
 
 
721 aa  317  5e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65071  long-chain fatty acid--CoA ligase and synthetase 4  33.14 
 
 
699 aa  317  6e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.418644  normal  0.491736 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17720  precursor of ligase long chain acyl-coa ligase  32.07 
 
 
678 aa  309  1.0000000000000001e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26758  predicted protein  32.42 
 
 
630 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0405652 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08280  AMP-binding enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04270)  31.2 
 
 
708 aa  260  6e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00660  long-chain-fatty-acid-CoA ligase, putative  31.81 
 
 
727 aa  249  9e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.665335  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  28.62 
 
 
604 aa  239  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  27.6 
 
 
592 aa  224  6e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58181  long-chain fatty acid CoA ligase  27.53 
 
 
753 aa  221  3.9999999999999997e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89450  long-chain-fatty-acid CoA ligase  27.22 
 
 
720 aa  218  2e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.67886  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  27.56 
 
 
612 aa  217  5e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  26.66 
 
 
610 aa  214  4.9999999999999996e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35069  long-chain fatty acid CoA ligase  26.92 
 
 
718 aa  212  2e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.193785  normal  0.930837 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  27.1 
 
 
607 aa  210  7e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  27.94 
 
 
598 aa  203  9e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  26.59 
 
 
633 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49655  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 2 (Long-chain acyl-CoA synthetase 2) (Fatty acid activator 2)  26.99 
 
 
751 aa  202  1.9999999999999998e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  27.97 
 
 
598 aa  201  5e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0075  AMP-binding family protein  27.5 
 
 
568 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  26.73 
 
 
597 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  27.02 
 
 
596 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  26.73 
 
 
597 aa  198  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  28.42 
 
 
649 aa  198  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  26.73 
 
 
597 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  25.85 
 
 
605 aa  196  8.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  27.75 
 
 
660 aa  196  9e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.83669 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  26.09 
 
 
609 aa  195  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0075  AMP-dependent synthetase and ligase  27.99 
 
 
601 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0077  AMP-dependent synthetase and ligase  27.54 
 
 
601 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  26.72 
 
 
652 aa  194  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4274  AMP-dependent synthetase and ligase  27.54 
 
 
601 aa  194  6e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  27.04 
 
 
601 aa  192  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  27.54 
 
 
601 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  27.92 
 
 
598 aa  192  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  26.22 
 
 
601 aa  192  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  28.9 
 
 
599 aa  191  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  27.07 
 
 
598 aa  191  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  28.41 
 
 
607 aa  190  8e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  28.03 
 
 
592 aa  189  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  26.57 
 
 
669 aa  189  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  28.89 
 
 
597 aa  189  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2212  AMP-dependent synthetase and ligase  27.54 
 
 
685 aa  189  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.169636 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  27.23 
 
 
592 aa  189  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55002  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.89 
 
 
752 aa  188  3e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538226  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0595  AMP-dependent synthetase and ligase  26.77 
 
 
601 aa  187  4e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0747  AMP-dependent synthetase and ligase  25.81 
 
 
602 aa  187  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1168  AMP-dependent synthetase and ligase  26.84 
 
 
616 aa  187  6e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.549582  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  24.96 
 
 
610 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  25.61 
 
 
610 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  24.91 
 
 
610 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  26.86 
 
 
594 aa  186  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  25.6 
 
 
602 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  28.16 
 
 
606 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3532  AMP-dependent synthetase and ligase  25.16 
 
 
601 aa  183  8.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3402  AMP binding protein  25.16 
 
 
601 aa  183  8.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54151  long chain acyl-CoA synthetase  27.24 
 
 
702 aa  183  8.000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  27.55 
 
 
603 aa  183  8.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2933  AMP binding protein  25.16 
 
 
588 aa  183  8.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.617922  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  25.21 
 
 
610 aa  183  9.000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  27.83 
 
 
590 aa  183  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  26.35 
 
 
620 aa  182  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  26.61 
 
 
598 aa  182  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  26.59 
 
 
603 aa  182  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  26.34 
 
 
612 aa  182  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  27.55 
 
 
606 aa  181  4e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  27.54 
 
 
603 aa  181  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  26.42 
 
 
587 aa  180  5.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0633  AMP-dependent synthetase and ligase  27 
 
 
601 aa  180  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178096  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0191  AMP-dependent synthetase and ligase  26.74 
 
 
605 aa  179  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353972  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2120  AMP-dependent synthetase and ligase  26.19 
 
 
672 aa  177  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342483  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  25.12 
 
 
590 aa  177  5e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2259  AMP-dependent synthetase and ligase  25.53 
 
 
616 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000572274  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0072  AMP-dependent synthetase and ligase  26.31 
 
 
597 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1388  AMP-dependent synthetase and ligase  25.42 
 
 
602 aa  174  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  26.67 
 
 
617 aa  174  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4186  AMP-dependent synthetase and ligase  26.74 
 
 
598 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3973  AMP-dependent synthetase and ligase  25.94 
 
 
597 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  27.39 
 
 
606 aa  173  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  25.39 
 
 
605 aa  172  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  26.56 
 
 
610 aa  171  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0825  AMP-dependent synthetase and ligase  26.28 
 
 
601 aa  171  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28860  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  26.35 
 
 
612 aa  171  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  27.1 
 
 
601 aa  170  9e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  27.52 
 
 
602 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3675  AMP-dependent synthetase and ligase  27.52 
 
 
602 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.438737  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  26.52 
 
 
602 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0592  long-chain acyl-CoA synthetase  27.66 
 
 
677 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0779  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.57 
 
 
614 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  hitchhiker  0.00265448 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  25.49 
 
 
602 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  28.31 
 
 
612 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.583601  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  26.51 
 
 
599 aa  168  2.9999999999999998e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  26.59 
 
 
607 aa  168  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  26.12 
 
 
605 aa  168  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  27.36 
 
 
602 aa  167  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  27.04 
 
 
623 aa  167  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  27.4 
 
 
607 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  27.36 
 
 
602 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12071  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>