More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1373 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3148  thioester reductase domain-containing protein  45.99 
 
 		 1165 aa  851    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.209957 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1373  thioester reductase domain protein  100 
 
 		 1105 aa  2194    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2271  thioester reductase  47.06 
 
 		 1174 aa  895    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12610  fatty-acid-CoA ligase fadD9  46.56 
 
 		 1168 aa  886    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.945549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2310  thioester reductase domain-containing protein  47.41 
 
 		 1174 aa  906    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.992099 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2318  thioester reductase domain-containing protein  47.06 
 
 		 1174 aa  895    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.662408 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2578  thioester reductase domain-containing protein  45.76 
 
 		 1162 aa  884    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615079 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10102  peptide synthetase nrp  35.03 
 
 		 2512 aa  388  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26758  predicted protein  29.27 
 
 		 630 aa  204  6e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0405652 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  24.21 
 
 		 1454 aa  169  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17720  precursor of ligase long chain acyl-coa ligase  28.92 
 
 		 678 aa  159  3e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08280  AMP-binding enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04270)  29.41 
 
 		 708 aa  158  6e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4416  amino acid adenylation domain-containing protein  27.68 
 
 		 1485 aa  154  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4890  amino acid adenylation domain-containing protein  27.43 
 
 		 1500 aa  152  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.365672 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00660  long-chain-fatty-acid-CoA ligase, putative  30.24 
 
 		 727 aa  152  4e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.665335  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  29.87 
 
 		 1067 aa  150  9e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2595  thioester reductase  29.2 
 
 		 506 aa  142  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.410224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  27.88 
 
 		 602 aa  141  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1805  amino acid adenylation domain-containing protein  24.61 
 
 		 1413 aa  141  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.323791  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  25.95 
 
 		 607 aa  140  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  25.78 
 
 		 610 aa  138  7.000000000000001e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  26.41 
 
 		 609 aa  137  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  25.28 
 
 		 610 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00710  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase, putative  26.75 
 
 		 706 aa  135  3e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3912  thioester reductase domain-containing protein  27.79 
 
 		 505 aa  135  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501975  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2104  thioester reductase domain-containing protein  28.04 
 
 		 523 aa  134  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35069  long-chain fatty acid CoA ligase  26.88 
 
 		 718 aa  133  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.193785  normal  0.930837 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58181  long-chain fatty acid CoA ligase  24.95 
 
 		 753 aa  132  3e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06014  fatty acid activator Faa4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09910)  26.34 
 
 		 698 aa  131  6e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.547026 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  27.04 
 
 		 633 aa  131  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49655  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 2 (Long-chain acyl-CoA synthetase 2) (Fatty acid activator 2)  24.83 
 
 		 751 aa  129  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  26.19 
 
 		 592 aa  130  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0368  amino acid adenylation domain-containing protein  21.76 
 
 		 1194 aa  129  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  27.29 
 
 		 2374 aa  128  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  29.6 
 
 		 1270 aa  127  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  23.99 
 
 		 637 aa  127  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  27.21 
 
 		 605 aa  126  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  28.05 
 
 		 2376 aa  125  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2949  AMP-dependent synthetase and ligase  28.69 
 
 		 591 aa  126  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179874  normal  0.0506355 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  24.92 
 
 		 610 aa  125  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  23.99 
 
 		 587 aa  125  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7306  peptide synthetase  30.54 
 
 		 1506 aa  125  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.370247  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4292  amino acid adenylation domain-containing protein  29.71 
 
 		 1188 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375384  normal  0.670751 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  32.08 
 
 		 2107 aa  123  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4973  amino acid adenylation  29.8 
 
 		 1188 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432296  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3187  amino acid adenylation domain-containing protein  29.8 
 
 		 1188 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89450  long-chain-fatty-acid CoA ligase  22.76 
 
 		 720 aa  122  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.67886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  25.46 
 
 		 604 aa  122  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  24.5 
 
 		 610 aa  121  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05610  aminoadipate reductase large subunit (Eurofung)  30.21 
 
 		 1421 aa  121  7e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0476531 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  24 
 
 		 603 aa  121  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0072  AMP-dependent synthetase and ligase  24.77 
 
 		 597 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  24.59 
 
 		 1449 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2479  AMP-dependent synthetase and ligase  27.91 
 
 		 559 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3751  AMP-dependent synthetase and ligase  26.37 
 
 		 647 aa  120  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.673702 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00170  aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase, putative  29.12 
 
 		 1409 aa  119  3e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.682323  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  25.13 
 
 		 598 aa  119  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65071  long-chain fatty acid--CoA ligase and synthetase 4  24.14 
 
 		 699 aa  119  3e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.418644  normal  0.491736 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47104  non ribosomal peptide synthase  27.3 
 
 		 1367 aa  119  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0845  hypothetical protein  28.04 
 
 		 4101 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2161  hypothetical protein  28.04 
 
 		 4098 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1451.1  hypothetical protein  28.04 
 
 		 4580 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10861  hypothetical protein  24.45 
 
 		 2199 aa  117  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  27.87 
 
 		 617 aa  117  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3702  thioester reductase domain protein  27.13 
 
 		 398 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002639  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.58 
 
 		 563 aa  116  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.409821  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  28.52 
 
 		 509 aa  115  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.429001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1856  polyketide non-ribosomal peptide synthase  26.79 
 
 		 4123 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0530  putative polyketide synthase PksM  28.29 
 
 		 4122 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0434  polyketide synthase  28.29 
 
 		 4157 aa  115  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2093  polyketide synthase, putative  29.88 
 
 		 4048 aa  115  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5489  amino acid adenylation domain-containing protein  22.2 
 
 		 2439 aa  115  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934581 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  26.22 
 
 		 598 aa  115  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  25.26 
 
 		 679 aa  115  5e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  27.49 
 
 		 620 aa  115  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  27.86 
 
 		 599 aa  114  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20143  long chain acyl-coa synthetase  25.33 
 
 		 721 aa  114  7.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  23.86 
 
 		 597 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  24.76 
 
 		 610 aa  114  9e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0982  hypothetical protein  23.89 
 
 		 555 aa  114  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  27.01 
 
 		 630 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  27.43 
 
 		 1549 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.750359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1920  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.36 
 
 		 563 aa  114  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.022094  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03363  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.48 
 
 		 563 aa  113  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3755  thioester reductase domain protein  26.86 
 
 		 398 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.801599 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1168  AMP-dependent synthetase and ligase  26.6 
 
 		 616 aa  113  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.549582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  26.34 
 
 		 612 aa  112  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  24.88 
 
 		 603 aa  112  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  25.58 
 
 		 594 aa  112  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3973  AMP-dependent synthetase and ligase  24.37 
 
 		 597 aa  111  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  27.04 
 
 		 602 aa  111  8.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1015  hypothetical protein  23.89 
 
 		 555 aa  111  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4205  AMP-dependent synthetase and ligase  24.21 
 
 		 551 aa  110  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  26.33 
 
 		 600 aa  110  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55002  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.37 
 
 		 752 aa  110  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  22.75 
 
 		 602 aa  110  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0261  AMP-dependent synthetase and ligase  25.47 
 
 		 551 aa  110  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000998406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  22.01 
 
 		 601 aa  109  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  24.23 
 
 		 597 aa  110  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0475  AMP-dependent synthetase and ligase  26.07 
 
 		 567 aa  110  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.958743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>