More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_89450 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_35069  long-chain fatty acid CoA ligase  47.16 
 
 		 718 aa  653    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.193785  normal  0.930837 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89450  long-chain-fatty-acid CoA ligase  100 
 
 		 720 aa  1492    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.67886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58181  long-chain fatty acid CoA ligase  49.65 
 
 		 753 aa  686    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49655  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 2 (Long-chain acyl-CoA synthetase 2) (Fatty acid activator 2)  43.01 
 
 		 751 aa  547  1e-154  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55002  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.09 
 
 		 752 aa  533  1e-150  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538226  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08280  AMP-binding enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04270)  36.98 
 
 		 708 aa  437  1e-121  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26758  predicted protein  33.28 
 
 		 630 aa  327  5e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0405652 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00660  long-chain-fatty-acid-CoA ligase, putative  30.38 
 
 		 727 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.665335  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17720  precursor of ligase long chain acyl-coa ligase  29.86 
 
 		 678 aa  259  2e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06014  fatty acid activator Faa4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09910)  27.9 
 
 		 698 aa  221  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.547026 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24496  predicted protein  27.22 
 
 		 667 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00710  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase, putative  27.18 
 
 		 706 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20143  long chain acyl-coa synthetase  26.23 
 
 		 721 aa  197  6e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  27.18 
 
 		 610 aa  188  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  27.52 
 
 		 613 aa  186  9e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  26.28 
 
 		 622 aa  185  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  26.9 
 
 		 606 aa  183  7e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  27.56 
 
 		 594 aa  180  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  27.07 
 
 		 606 aa  180  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  26.88 
 
 		 610 aa  180  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0164  AMP-dependent synthetase and ligase  26.46 
 
 		 658 aa  179  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  27.65 
 
 		 605 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  25.64 
 
 		 611 aa  179  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  26.9 
 
 		 606 aa  179  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3503  AMP-dependent synthetase and ligase  28.28 
 
 		 618 aa  178  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129901  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1543  AMP-dependent synthetase and ligase  25.36 
 
 		 651 aa  179  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00460036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  27.73 
 
 		 597 aa  179  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65071  long-chain fatty acid--CoA ligase and synthetase 4  27.4 
 
 		 699 aa  178  3e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.418644  normal  0.491736 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  27.43 
 
 		 623 aa  178  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2937  AMP-dependent synthetase and ligase  27.35 
 
 		 610 aa  177  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  26.56 
 
 		 607 aa  176  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  26.36 
 
 		 596 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  26.67 
 
 		 626 aa  176  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  27.69 
 
 		 610 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  26.33 
 
 		 617 aa  176  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  29.48 
 
 		 663 aa  174  7.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  26.22 
 
 		 602 aa  173  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  25.97 
 
 		 612 aa  173  9e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  26.86 
 
 		 660 aa  173  9e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.83669 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  25.56 
 
 		 609 aa  173  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  26.8 
 
 		 602 aa  172  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2212  AMP-dependent synthetase and ligase  26.9 
 
 		 685 aa  171  4e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.169636 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0998  AMP-dependent synthetase and ligase  28.67 
 
 		 546 aa  171  5e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231761  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  28.2 
 
 		 587 aa  170  9e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  26.96 
 
 		 595 aa  170  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  26.73 
 
 		 607 aa  169  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1417  AMP-dependent synthetase and ligase  25.64 
 
 		 645 aa  169  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000978143  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  26.48 
 
 		 591 aa  169  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2355  AMP-dependent synthetase and ligase  25.04 
 
 		 610 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  26.88 
 
 		 610 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2259  AMP-dependent synthetase and ligase  25.99 
 
 		 616 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000572274  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  26.32 
 
 		 637 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  25.98 
 
 		 607 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  25.77 
 
 		 649 aa  167  5e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  27.62 
 
 		 592 aa  167  5e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  26.92 
 
 		 633 aa  167  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  27.51 
 
 		 610 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1129  AMP-dependent synthetase and ligase  25.79 
 
 		 597 aa  167  8e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0633  AMP-dependent synthetase and ligase  26.12 
 
 		 601 aa  167  8e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178096  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  26.43 
 
 		 620 aa  167  8e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  26.37 
 
 		 601 aa  167  9e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  26.62 
 
 		 602 aa  166  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  27.12 
 
 		 601 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2310  thioester reductase domain-containing protein  24.96 
 
 		 1174 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.992099 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  26.66 
 
 		 602 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  26.72 
 
 		 610 aa  165  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  27.57 
 
 		 597 aa  165  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  27.57 
 
 		 597 aa  165  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3508  AMP-dependent synthetase and ligase  26.35 
 
 		 607 aa  164  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28860  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  26.32 
 
 		 612 aa  164  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  27.57 
 
 		 597 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  28.3 
 
 		 603 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  26.94 
 
 		 590 aa  163  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  24.96 
 
 		 599 aa  163  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  27.63 
 
 		 607 aa  163  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  27.59 
 
 		 606 aa  162  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  24.57 
 
 		 598 aa  162  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2120  AMP-dependent synthetase and ligase  25.99 
 
 		 672 aa  161  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342483  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  26.33 
 
 		 597 aa  161  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2578  thioester reductase domain-containing protein  24.35 
 
 		 1162 aa  161  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615079 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1090  AMP-dependent synthetase and ligase  25.13 
 
 		 555 aa  161  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.26 
 
 		 602 aa  160  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  29.07 
 
 		 609 aa  160  6e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2271  thioester reductase  24.66 
 
 		 1174 aa  160  7e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2318  thioester reductase domain-containing protein  24.66 
 
 		 1174 aa  160  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.662408 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  26.96 
 
 		 590 aa  160  8e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  26.37 
 
 		 601 aa  160  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0136  AMP-dependent synthetase and ligase  25.85 
 
 		 646 aa  160  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4067  AMP-dependent synthetase and ligase  24.81 
 
 		 603 aa  159  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.675218  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  24.53 
 
 		 602 aa  159  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  25.45 
 
 		 547 aa  159  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  24.24 
 
 		 598 aa  159  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  24.79 
 
 		 669 aa  158  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  28.11 
 
 		 600 aa  158  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  24.36 
 
 		 602 aa  158  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3675  AMP-dependent synthetase and ligase  24.36 
 
 		 602 aa  158  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.438737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  27.81 
 
 		 600 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  23.99 
 
 		 592 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  26.06 
 
 		 551 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000026311  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3751  AMP-dependent synthetase and ligase  28.88 
 
 		 647 aa  157  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.673702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>