More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1129 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1129  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 597 aa  1170    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28860  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  45.87 
 
 		 612 aa  505  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1953  AMP-dependent synthetase and ligase  48.17 
 
 		 613 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.163962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2259  AMP-dependent synthetase and ligase  48.09 
 
 		 616 aa  505  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000572274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4370  AMP-dependent synthetase and ligase  49.49 
 
 		 601 aa  476  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5953  AMP-dependent synthetase and ligase  46.09 
 
 		 612 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664785  normal  0.0418717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7362  AMP-dependent synthetase and ligase  43.77 
 
 		 624 aa  452  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.942718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3617  AMP-dependent synthetase and ligase  43.6 
 
 		 608 aa  432  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0692269  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3508  AMP-dependent synthetase and ligase  41.68 
 
 		 607 aa  389  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2941  AMP-dependent synthetase and ligase  38.72 
 
 		 773 aa  351  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2937  AMP-dependent synthetase and ligase  38.68 
 
 		 610 aa  340  5e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  33.12 
 
 		 603 aa  330  3e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  33.11 
 
 		 603 aa  323  4e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  33 
 
 		 603 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  34.27 
 
 		 596 aa  314  3.9999999999999997e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  32.7 
 
 		 594 aa  313  6.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  37.9 
 
 		 599 aa  310  4e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  29.87 
 
 		 607 aa  310  5.9999999999999995e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  37.04 
 
 		 599 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  37.74 
 
 		 599 aa  307  3e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  31 
 
 		 607 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6820  AMP-dependent synthetase and ligase  37.2 
 
 		 653 aa  303  5.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3503  AMP-dependent synthetase and ligase  31.2 
 
 		 618 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129901  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  31.85 
 
 		 626 aa  303  7.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  36.2 
 
 		 615 aa  301  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  37.4 
 
 		 597 aa  299  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  33.56 
 
 		 633 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  33.78 
 
 		 601 aa  298  2e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11582  fatty-acid-CoA ligase fadD11  39.69 
 
 		 571 aa  297  4e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0949  AMP-binding enzyme  32.99 
 
 		 603 aa  296  7e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  37.04 
 
 		 597 aa  295  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  36.05 
 
 		 597 aa  295  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.21 
 
 		 597 aa  295  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  32.56 
 
 		 623 aa  295  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  36.42 
 
 		 599 aa  294  3e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  33 
 
 		 590 aa  292  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  30.43 
 
 		 609 aa  291  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  35.16 
 
 		 593 aa  291  3e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  35.7 
 
 		 592 aa  291  3e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3623  AMP-dependent synthetase and ligase  36.23 
 
 		 596 aa  290  5.0000000000000004e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  35.68 
 
 		 617 aa  290  6e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  29.93 
 
 		 610 aa  289  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  34.13 
 
 		 600 aa  288  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  29.91 
 
 		 610 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  33.55 
 
 		 609 aa  287  5e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  34.72 
 
 		 604 aa  286  8e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  35.96 
 
 		 622 aa  286  8e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  29.04 
 
 		 610 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  32.53 
 
 		 598 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  30.28 
 
 		 610 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  35.75 
 
 		 600 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  35.07 
 
 		 616 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  34.44 
 
 		 611 aa  284  4.0000000000000003e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  29.35 
 
 		 610 aa  283  6.000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  35.45 
 
 		 602 aa  280  5e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  33.62 
 
 		 607 aa  280  6e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  36.03 
 
 		 612 aa  280  7e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 		 595 aa  280  7e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 		 591 aa  279  9e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  32 
 
 		 633 aa  278  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0191  AMP-dependent synthetase and ligase  32.9 
 
 		 605 aa  277  4e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353972  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  35.48 
 
 		 622 aa  277  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 612 aa  276  5e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0592  long-chain acyl-CoA synthetase  32.16 
 
 		 677 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1122  AMP-dependent synthetase and ligase  34.94 
 
 		 606 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 611 aa  275  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2355  AMP-dependent synthetase and ligase  30.91 
 
 		 610 aa  274  3e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4067  AMP-dependent synthetase and ligase  32.42 
 
 		 603 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.675218  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  32.22 
 
 		 599 aa  273  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  35.43 
 
 		 615 aa  273  6e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  34.09 
 
 		 601 aa  273  9e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  33.11 
 
 		 602 aa  272  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1388  AMP-dependent synthetase and ligase  31.69 
 
 		 602 aa  271  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  31.01 
 
 		 592 aa  271  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  34.45 
 
 		 597 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  34.88 
 
 		 608 aa  271  2.9999999999999997e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0595  AMP-dependent synthetase and ligase  31.94 
 
 		 601 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  34.45 
 
 		 597 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  34.45 
 
 		 597 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  36.12 
 
 		 599 aa  270  4e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0860  AMP-binding enzyme  31.48 
 
 		 682 aa  269  8e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  32.25 
 
 		 604 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.73 
 
 		 601 aa  268  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  35.09 
 
 		 606 aa  268  2.9999999999999995e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  33.72 
 
 		 605 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2949  AMP-dependent synthetase and ligase  32.51 
 
 		 591 aa  267  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179874  normal  0.0506355 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  34.52 
 
 		 606 aa  266  7e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  30.65 
 
 		 592 aa  266  8e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1204  AMP-dependent synthetase and ligase  35.61 
 
 		 609 aa  266  8e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110372  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  34.58 
 
 		 632 aa  266  8.999999999999999e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  34.52 
 
 		 606 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  32.57 
 
 		 604 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  32.73 
 
 		 604 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  34.52 
 
 		 606 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01120  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  32.52 
 
 		 606 aa  265  2e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  34.54 
 
 		 603 aa  264  3e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  32.14 
 
 		 605 aa  264  4e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  35.57 
 
 		 606 aa  264  4e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  30.81 
 
 		 587 aa  264  4e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.18 
 
 		 598 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>