More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2578 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3148  thioester reductase domain-containing protein  52.44 
 
 
1165 aa  1083    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.209957 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1373  thioester reductase domain protein  45.85 
 
 
1105 aa  892    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2271  thioester reductase  70 
 
 
1174 aa  1606    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2310  thioester reductase domain-containing protein  70.08 
 
 
1174 aa  1610    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.992099 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12610  fatty-acid-CoA ligase fadD9  66.89 
 
 
1168 aa  1535    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.945549  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2318  thioester reductase domain-containing protein  70 
 
 
1174 aa  1606    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.662408 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2578  thioester reductase domain-containing protein  100 
 
 
1162 aa  2325    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.615079 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10102  peptide synthetase nrp  48.22 
 
 
2512 aa  614  9.999999999999999e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26758  predicted protein  30.71 
 
 
630 aa  245  3e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0405652 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00660  long-chain-fatty-acid-CoA ligase, putative  28.5 
 
 
727 aa  201  7.999999999999999e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.665335  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17720  precursor of ligase long chain acyl-coa ligase  29.57 
 
 
678 aa  185  4.0000000000000006e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  25.55 
 
 
1454 aa  177  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08280  AMP-binding enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04270)  26.08 
 
 
708 aa  169  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1805  amino acid adenylation domain-containing protein  24.98 
 
 
1413 aa  167  9e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.323791  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89450  long-chain-fatty-acid CoA ligase  24.7 
 
 
720 aa  164  8.000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.67886  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3751  AMP-dependent synthetase and ligase  29.46 
 
 
647 aa  163  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.673702 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  28.01 
 
 
633 aa  163  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  27.99 
 
 
597 aa  162  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24496  predicted protein  25.46 
 
 
667 aa  162  5e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  25.25 
 
 
679 aa  158  6e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06014  fatty acid activator Faa4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09910)  24.25 
 
 
698 aa  157  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.547026 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  26.48 
 
 
594 aa  157  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  24.96 
 
 
610 aa  157  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00710  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase, putative  26.32 
 
 
706 aa  156  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35069  long-chain fatty acid CoA ligase  26.29 
 
 
718 aa  157  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.193785  normal  0.930837 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  25.33 
 
 
610 aa  155  4e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  27.59 
 
 
599 aa  155  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58181  long-chain fatty acid CoA ligase  26.42 
 
 
753 aa  154  5.9999999999999996e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2556  AMP-dependent synthetase and ligase  26.48 
 
 
660 aa  154  7e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3502  AMP-dependent synthetase and ligase  25.14 
 
 
551 aa  152  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2212  AMP-dependent synthetase and ligase  27.53 
 
 
685 aa  151  9e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.169636 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65071  long-chain fatty acid--CoA ligase and synthetase 4  25.76 
 
 
699 aa  150  1.0000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.418644  normal  0.491736 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  25.61 
 
 
610 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2479  AMP-dependent synthetase and ligase  31.58 
 
 
559 aa  150  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4186  AMP-dependent synthetase and ligase  26.54 
 
 
598 aa  149  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1168  AMP-dependent synthetase and ligase  29.14 
 
 
616 aa  148  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.549582  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  26.02 
 
 
604 aa  148  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  26.81 
 
 
600 aa  147  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  26.62 
 
 
1067 aa  147  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08105  NRPS-like enzyme, putative (JCVI)  25.88 
 
 
1077 aa  147  9e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.250944 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  24.62 
 
 
597 aa  147  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0631  putative AMP-binding acetyl-CoA synthetase  25.43 
 
 
558 aa  147  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.365879  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  25.91 
 
 
599 aa  146  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01022  AMP-binding protein  25.43 
 
 
559 aa  146  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4890  amino acid adenylation domain-containing protein  27.68 
 
 
1500 aa  146  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.365672 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1090  AMP-dependent synthetase and ligase  28.12 
 
 
555 aa  146  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0779  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.21 
 
 
614 aa  146  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  hitchhiker  0.00265448 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4416  amino acid adenylation domain-containing protein  28.07 
 
 
1485 aa  145  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0331  AMP-dependent synthetase and ligase  25.22 
 
 
555 aa  145  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.167581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  24.2 
 
 
590 aa  145  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  26.2 
 
 
607 aa  145  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  25.29 
 
 
607 aa  145  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03363  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.38 
 
 
563 aa  145  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  26.25 
 
 
620 aa  145  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  24.96 
 
 
598 aa  145  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0072  AMP-dependent synthetase and ligase  25.33 
 
 
597 aa  145  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  24.67 
 
 
649 aa  145  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  24.46 
 
 
607 aa  144  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47104  non ribosomal peptide synthase  24.97 
 
 
1367 aa  142  3.9999999999999997e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2970  AMP-dependent synthetase and ligase  28.03 
 
 
546 aa  142  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383632  normal  0.0772174 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  25.83 
 
 
601 aa  142  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  27.12 
 
 
622 aa  141  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  24.28 
 
 
610 aa  141  7.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2423  AMP-dependent synthetase and ligase  29.75 
 
 
1549 aa  141  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  26.77 
 
 
604 aa  140  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1417  AMP-dependent synthetase and ligase  26.25 
 
 
645 aa  140  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000978143  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002639  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.46 
 
 
563 aa  140  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.409821  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  24.87 
 
 
587 aa  140  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2510  AMP-dependent synthetase and ligase  29.14 
 
 
1549 aa  140  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  24.86 
 
 
551 aa  140  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000026311  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  25.17 
 
 
598 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  28.3 
 
 
602 aa  139  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  26.36 
 
 
609 aa  139  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  27.47 
 
 
630 aa  138  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  24.71 
 
 
597 aa  138  5e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2120  AMP-dependent synthetase and ligase  24.38 
 
 
672 aa  138  6.0000000000000005e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342483  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  25.17 
 
 
610 aa  138  6.0000000000000005e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1437  AMP-dependent synthetase and ligase  29.55 
 
 
1460 aa  138  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4587  AMP-dependent synthetase and ligase  24.91 
 
 
551 aa  138  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000231553  unclonable  0.0000000387525 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  26.92 
 
 
592 aa  138  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  24.2 
 
 
547 aa  138  7.000000000000001e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  25.04 
 
 
611 aa  137  8e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  26.96 
 
 
605 aa  137  8e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4067  AMP-dependent synthetase and ligase  26.64 
 
 
603 aa  137  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.675218  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  24.55 
 
 
597 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  24.55 
 
 
597 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0261  AMP-dependent synthetase and ligase  25.27 
 
 
551 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000998406  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4292  amino acid adenylation domain-containing protein  30.28 
 
 
1188 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375384  normal  0.670751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  24.88 
 
 
596 aa  137  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0592  long-chain acyl-CoA synthetase  25.85 
 
 
677 aa  137  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  26.22 
 
 
599 aa  136  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  25.71 
 
 
604 aa  136  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0075  AMP-dependent synthetase and ligase  25.21 
 
 
601 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  25.62 
 
 
622 aa  137  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  24.83 
 
 
598 aa  136  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3973  AMP-dependent synthetase and ligase  24.87 
 
 
597 aa  135  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  25.52 
 
 
598 aa  135  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4973  amino acid adenylation  30.33 
 
 
1188 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432296  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3187  amino acid adenylation domain-containing protein  30.33 
 
 
1188 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2464  AMP-dependent synthetase and ligase  28.35 
 
 
555 aa  135  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105323  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>