More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0631 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03363  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  72.06 
 
 
563 aa  864    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1920  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  73.53 
 
 
563 aa  874    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.022094  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002639  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  70.4 
 
 
563 aa  853    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.409821  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0631  putative AMP-binding acetyl-CoA synthetase  100 
 
 
558 aa  1152    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.365879  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0331  AMP-dependent synthetase and ligase  46.97 
 
 
555 aa  513  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.167581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0351  AMP-dependent synthetase and ligase  47.93 
 
 
554 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.597598  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0359  AMP-dependent synthetase and ligase  47.93 
 
 
554 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00409412  decreased coverage  0.000000000100216 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4587  AMP-dependent synthetase and ligase  46.97 
 
 
551 aa  513  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000231553  unclonable  0.0000000387525 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0355  AMP-binding protein  47.18 
 
 
554 aa  509  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3502  AMP-dependent synthetase and ligase  47.74 
 
 
551 aa  511  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0349  AMP-dependent synthetase and ligase  47.56 
 
 
554 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000814911  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3617  AMP-dependent synthetase and ligase  46.99 
 
 
554 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0326  AMP-dependent synthetase and ligase  46.8 
 
 
554 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  0.942531 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0356  AMP-dependent synthetase and ligase  47.37 
 
 
554 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000116911  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3814  AMP-dependent synthetase and ligase  46.99 
 
 
554 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.354824  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0261  AMP-dependent synthetase and ligase  45.32 
 
 
551 aa  504  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000998406  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  46.42 
 
 
551 aa  503  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000026311  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3437  AMP-dependent synthetase and ligase  44.44 
 
 
555 aa  486  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.915272  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  46.15 
 
 
554 aa  483  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00109176  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0998  AMP-dependent synthetase and ligase  44.69 
 
 
546 aa  481  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231761  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0361  AMP-dependent synthetase and ligase  45.18 
 
 
575 aa  481  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1090  AMP-dependent synthetase and ligase  40.97 
 
 
555 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  43.07 
 
 
547 aa  451  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2970  AMP-dependent synthetase and ligase  41.79 
 
 
546 aa  449  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383632  normal  0.0772174 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01022  AMP-binding protein  41.58 
 
 
559 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0675  AMP-binding protein  41.22 
 
 
547 aa  432  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3656  putative AMP-binding protein  39.56 
 
 
555 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.330411  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43610  putative AMP-binding protein  39.2 
 
 
555 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297438  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3811  AMP-dependent synthetase and ligase  40.52 
 
 
547 aa  411  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2464  AMP-dependent synthetase and ligase  38.91 
 
 
555 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105323  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2888  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 
560 aa  403  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0719534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4205  AMP-dependent synthetase and ligase  37.96 
 
 
551 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0267  AMP-dependent synthetase and ligase  36.99 
 
 
563 aa  382  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2479  AMP-dependent synthetase and ligase  38.89 
 
 
559 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5098  AMP-dependent synthetase and ligase  36.41 
 
 
566 aa  359  7e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.183916  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0982  hypothetical protein  36.33 
 
 
555 aa  352  1e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1015  hypothetical protein  35.92 
 
 
555 aa  348  1e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0284  long-chain-fatty-acid-CoA ligase, putative  35.79 
 
 
553 aa  341  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2935  AMP-binding domain-containing protein  34.89 
 
 
553 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1154  putative AMP-binding acetyl-CoA synthetase  34.71 
 
 
598 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2780  AMP-binding domain-containing protein  34.71 
 
 
598 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  29.05 
 
 
607 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  30.63 
 
 
596 aa  244  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 
590 aa  236  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  28.97 
 
 
615 aa  235  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  28.81 
 
 
609 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  28.55 
 
 
596 aa  233  5e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  31.38 
 
 
594 aa  233  5e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  29.76 
 
 
607 aa  233  5e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  31.83 
 
 
592 aa  233  6e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  30.07 
 
 
590 aa  231  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  27.95 
 
 
602 aa  231  4e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  30.07 
 
 
610 aa  230  5e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  29.95 
 
 
610 aa  230  5e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  27.24 
 
 
620 aa  230  7e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  29.41 
 
 
592 aa  229  8e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  28.77 
 
 
610 aa  228  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  29.76 
 
 
600 aa  228  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  29.14 
 
 
598 aa  228  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  27.87 
 
 
610 aa  227  4e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  27.71 
 
 
580 aa  225  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  29.57 
 
 
599 aa  224  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  29 
 
 
606 aa  224  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  29.15 
 
 
598 aa  224  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  27.71 
 
 
580 aa  224  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  28.23 
 
 
593 aa  224  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  28.65 
 
 
610 aa  224  4e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  27.32 
 
 
633 aa  223  6e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  27.84 
 
 
649 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  29.37 
 
 
597 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  29.45 
 
 
606 aa  221  3e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  31.05 
 
 
600 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432369  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  29.96 
 
 
617 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  28.5 
 
 
599 aa  219  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  29.05 
 
 
603 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.5 
 
 
597 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  29.15 
 
 
622 aa  218  2.9999999999999998e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  26.51 
 
 
607 aa  218  2.9999999999999998e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  28.32 
 
 
602 aa  217  5e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 
605 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  27.39 
 
 
597 aa  216  9e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  27.39 
 
 
597 aa  216  9e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  28.04 
 
 
592 aa  216  9e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3623  AMP-dependent synthetase and ligase  27.18 
 
 
596 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  29.05 
 
 
587 aa  215  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  27.39 
 
 
597 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2355  AMP-dependent synthetase and ligase  27.76 
 
 
610 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.09 
 
 
601 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  26.7 
 
 
605 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  25.95 
 
 
592 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26758  predicted protein  29.62 
 
 
630 aa  213  9e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0405652 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  28.19 
 
 
630 aa  212  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  26.49 
 
 
612 aa  212  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1388  AMP-dependent synthetase and ligase  29.63 
 
 
602 aa  212  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  27.47 
 
 
679 aa  212  2e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  28.44 
 
 
602 aa  211  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  28.31 
 
 
612 aa  211  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  29.14 
 
 
623 aa  211  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  27.61 
 
 
598 aa  211  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0191  AMP-dependent synthetase and ligase  29.19 
 
 
605 aa  210  6e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>