More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2318 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10102  peptide synthetase nrp  51.28 
 
 
2512 aa  640    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12610  fatty-acid-CoA ligase fadD9  67.91 
 
 
1168 aa  1555    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.945549  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1373  thioester reductase domain protein  47.06 
 
 
1105 aa  907    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2271  thioester reductase  100 
 
 
1174 aa  2357    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3148  thioester reductase domain-containing protein  52.39 
 
 
1165 aa  1080    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.209957 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2310  thioester reductase domain-containing protein  98.13 
 
 
1174 aa  2310    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.992099 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2318  thioester reductase domain-containing protein  100 
 
 
1174 aa  2357    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.662408 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2578  thioester reductase domain-containing protein  70 
 
 
1162 aa  1608    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.615079 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26758  predicted protein  29.53 
 
 
630 aa  239  2e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0405652 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  24.25 
 
 
1454 aa  189  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17720  precursor of ligase long chain acyl-coa ligase  30.34 
 
 
678 aa  188  4e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00660  long-chain-fatty-acid-CoA ligase, putative  27.8 
 
 
727 aa  175  3.9999999999999995e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.665335  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08280  AMP-binding enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04270)  25.88 
 
 
708 aa  163  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1805  amino acid adenylation domain-containing protein  27.01 
 
 
1413 aa  162  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.323791  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  25.93 
 
 
587 aa  161  8e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89450  long-chain-fatty-acid CoA ligase  24.66 
 
 
720 aa  160  1e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.67886  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58181  long-chain fatty acid CoA ligase  24.44 
 
 
753 aa  160  1e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3502  AMP-dependent synthetase and ligase  25.14 
 
 
551 aa  157  9e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35069  long-chain fatty acid CoA ligase  27.11 
 
 
718 aa  157  1e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.193785  normal  0.930837 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24496  predicted protein  26.31 
 
 
667 aa  157  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0331  AMP-dependent synthetase and ligase  25.23 
 
 
555 aa  156  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.167581 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0631  putative AMP-binding acetyl-CoA synthetase  26.76 
 
 
558 aa  155  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.365879  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2212  AMP-dependent synthetase and ligase  28.14 
 
 
685 aa  154  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.169636 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3437  AMP-dependent synthetase and ligase  25.65 
 
 
555 aa  153  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.915272  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  27.85 
 
 
1067 aa  152  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  27.18 
 
 
594 aa  150  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  27.33 
 
 
633 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4587  AMP-dependent synthetase and ligase  24.78 
 
 
551 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000231553  unclonable  0.0000000387525 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1920  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.53 
 
 
563 aa  149  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.022094  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2479  AMP-dependent synthetase and ligase  27.27 
 
 
559 aa  150  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06014  fatty acid activator Faa4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09910)  24.02 
 
 
698 aa  149  4.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.547026 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65071  long-chain fatty acid--CoA ligase and synthetase 4  27.53 
 
 
699 aa  149  4.0000000000000006e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.418644  normal  0.491736 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3814  AMP-dependent synthetase and ligase  25.63 
 
 
554 aa  148  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.354824  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0326  AMP-dependent synthetase and ligase  25.45 
 
 
554 aa  148  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  0.942531 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3617  AMP-dependent synthetase and ligase  25.45 
 
 
554 aa  147  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  25.87 
 
 
649 aa  146  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  26.8 
 
 
612 aa  145  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2120  AMP-dependent synthetase and ligase  26.27 
 
 
672 aa  145  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342483  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  26.75 
 
 
607 aa  145  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0261  AMP-dependent synthetase and ligase  25.27 
 
 
551 aa  145  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000998406  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0355  AMP-binding protein  24.73 
 
 
554 aa  145  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  26.57 
 
 
592 aa  145  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00710  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase, putative  26.25 
 
 
706 aa  144  9.999999999999999e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  24.73 
 
 
547 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0475  AMP-dependent synthetase and ligase  26.31 
 
 
567 aa  144  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.958743 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  27.15 
 
 
610 aa  144  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  26.88 
 
 
605 aa  144  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002639  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.91 
 
 
563 aa  143  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.409821  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  24.86 
 
 
554 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00109176  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  25 
 
 
679 aa  143  1.9999999999999998e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  28.24 
 
 
609 aa  142  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3751  AMP-dependent synthetase and ligase  28.55 
 
 
647 aa  142  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.673702 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  24.09 
 
 
551 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000026311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  27.38 
 
 
604 aa  141  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_002950  PG1145  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  26.09 
 
 
607 aa  141  7.999999999999999e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0351  AMP-dependent synthetase and ligase  24.96 
 
 
554 aa  141  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.597598  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4292  amino acid adenylation domain-containing protein  27.54 
 
 
1188 aa  140  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375384  normal  0.670751 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  25.19 
 
 
1270 aa  140  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0359  AMP-dependent synthetase and ligase  24.96 
 
 
554 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00409412  decreased coverage  0.000000000100216 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2556  AMP-dependent synthetase and ligase  28.1 
 
 
660 aa  140  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  27.63 
 
 
606 aa  139  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0349  AMP-dependent synthetase and ligase  24.86 
 
 
554 aa  139  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000814911  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2941  AMP-dependent synthetase and ligase  26.94 
 
 
773 aa  138  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227779  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4973  amino acid adenylation  27.78 
 
 
1188 aa  139  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432296  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3187  amino acid adenylation domain-containing protein  27.78 
 
 
1188 aa  139  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  26.36 
 
 
617 aa  138  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  25.18 
 
 
596 aa  138  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1847  AMP-dependent synthetase and ligase  27.96 
 
 
609 aa  138  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  25.72 
 
 
611 aa  138  8e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08105  NRPS-like enzyme, putative (JCVI)  26.42 
 
 
1077 aa  137  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.250944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  26.32 
 
 
622 aa  137  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01022  AMP-binding protein  24.26 
 
 
559 aa  137  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0356  AMP-dependent synthetase and ligase  24.78 
 
 
554 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000116911  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03363  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.28 
 
 
563 aa  137  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  27.85 
 
 
605 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  25.93 
 
 
622 aa  136  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43610  putative AMP-binding protein  26.06 
 
 
555 aa  137  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297438  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3656  putative AMP-binding protein  26.24 
 
 
555 aa  135  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.330411  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2970  AMP-dependent synthetase and ligase  28.16 
 
 
546 aa  135  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383632  normal  0.0772174 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  27.13 
 
 
652 aa  135  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4416  amino acid adenylation domain-containing protein  26.91 
 
 
1485 aa  135  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0982  hypothetical protein  24.55 
 
 
555 aa  135  6e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  26.83 
 
 
596 aa  135  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  26.35 
 
 
606 aa  135  6e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  28.05 
 
 
602 aa  135  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  28.86 
 
 
599 aa  134  7.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  25.98 
 
 
607 aa  134  7.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  25.93 
 
 
630 aa  134  7.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  24.18 
 
 
604 aa  134  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  24.96 
 
 
602 aa  134  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  23.45 
 
 
590 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  25.38 
 
 
601 aa  134  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7306  peptide synthetase  26.85 
 
 
1506 aa  134  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.370247  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49655  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 2 (Long-chain acyl-CoA synthetase 2) (Fatty acid activator 2)  22.97 
 
 
751 aa  133  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2464  AMP-dependent synthetase and ligase  25.66 
 
 
555 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105323  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  23.79 
 
 
612 aa  133  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05610  aminoadipate reductase large subunit (Eurofung)  28.66 
 
 
1421 aa  132  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0476531 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4205  AMP-dependent synthetase and ligase  24.74 
 
 
551 aa  132  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  23.71 
 
 
637 aa  132  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47104  non ribosomal peptide synthase  24.9 
 
 
1367 aa  132  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>