More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7306 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  38.1 
 
 		 3470 aa  646    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2415  amino acid adenylation domain-containing protein  39.96 
 
 		 1127 aa  728    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  36.35 
 
 		 2174 aa  639    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  37.08 
 
 		 2156 aa  659    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  39.07 
 
 		 6661 aa  653    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  40.5 
 
 		 5953 aa  668    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  41.25 
 
 		 6889 aa  725    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  42.04 
 
 		 6403 aa  712    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  36.45 
 
 		 2156 aa  652    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5489  amino acid adenylation domain-containing protein  30.74 
 
 		 2439 aa  639    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934581 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  39.16 
 
 		 2151 aa  673    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2413  amino acid adenylation domain-containing protein  38.29 
 
 		 1569 aa  667    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3740  amino acid adenylation domain protein  38.94 
 
 		 2395 aa  680    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.209532 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  38.24 
 
 		 3432 aa  641    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  39.31 
 
 		 4531 aa  656    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  37.17 
 
 		 2156 aa  663    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  34.4 
 
 		 2193 aa  652    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  39.08 
 
 		 2571 aa  716    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  34.96 
 
 		 1498 aa  689    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  40.96 
 
 		 3328 aa  652    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  40.35 
 
 		 4747 aa  706    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  40.08 
 
 		 5213 aa  672    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  37.57 
 
 		 2581 aa  668    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  37.81 
 
 		 4336 aa  639    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  38.11 
 
 		 3086 aa  730    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  39.75 
 
 		 4136 aa  649    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  40.39 
 
 		 2154 aa  659    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  37.66 
 
 		 4968 aa  710    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  38.8 
 
 		 5926 aa  644    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  38.01 
 
 		 4960 aa  700    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  39.64 
 
 		 13537 aa  667    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  41 
 
 		 6676 aa  680    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3972  amino acid adenylation domain-containing protein  40.13 
 
 		 1126 aa  644    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.47287  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  39.85 
 
 		 2867 aa  715    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  35.32 
 
 		 2791 aa  657    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  37.85 
 
 		 1142 aa  734    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  41.94 
 
 		 3308 aa  822    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  37.97 
 
 		 3498 aa  738    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  43.63 
 
 		 2033 aa  824    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3686  amino acid adenylation domain protein  38.94 
 
 		 2395 aa  681    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  36.67 
 
 		 1786 aa  649    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  39.77 
 
 		 8211 aa  643    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  37.75 
 
 		 7785 aa  640    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1675  amino acid adenylation domain-containing protein  39.22 
 
 		 1129 aa  650    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  41.05 
 
 		 6072 aa  654    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  39.49 
 
 		 4572 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  39.16 
 
 		 3942 aa  655    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  38.99 
 
 		 4502 aa  651    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  36.69 
 
 		 3639 aa  647    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  39.55 
 
 		 3002 aa  637    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  38.06 
 
 		 4332 aa  642    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  38.6 
 
 		 1816 aa  660    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  38.19 
 
 		 1556 aa  726    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1830  amino acid adenylation  38.04 
 
 		 1138 aa  647    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  39.08 
 
 		 2571 aa  716    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4416  amino acid adenylation domain-containing protein  36.07 
 
 		 1485 aa  755    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  37.26 
 
 		 5738 aa  648    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7306  peptide synthetase  100 
 
 		 1506 aa  3031    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.370247  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  40.75 
 
 		 4991 aa  654    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  40.69 
 
 		 7712 aa  660    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  39.6 
 
 		 2350 aa  639    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3683  amino acid adenylation domain protein  38.94 
 
 		 2664 aa  680    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3737  amino acid adenylation domain protein  38.94 
 
 		 3824 aa  679    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0118377 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  40.69 
 
 		 2125 aa  646    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  43.13 
 
 		 1550 aa  816    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  38.11 
 
 		 3086 aa  730    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  36.41 
 
 		 3235 aa  680    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  39.49 
 
 		 5149 aa  647    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  38.91 
 
 		 2189 aa  654    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  39.27 
 
 		 2448 aa  654    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  36.89 
 
 		 3291 aa  714    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10102  peptide synthetase nrp  34.84 
 
 		 2512 aa  652    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  38.38 
 
 		 1556 aa  730    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4890  amino acid adenylation domain-containing protein  36.41 
 
 		 1500 aa  754    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.365672 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  31.82 
 
 		 2054 aa  765    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  40 
 
 		 5596 aa  642    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0982  amino acid adenylation domain protein  35.13 
 
 		 2006 aa  678    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  40.87 
 
 		 1839 aa  672    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2186  non-ribosomal peptide synthase MxaA  38.52 
 
 		 1436 aa  770    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  42.51 
 
 		 2370 aa  696    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  40.19 
 
 		 8914 aa  641    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  40.96 
 
 		 3352 aa  652    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  42.75 
 
 		 4383 aa  684    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  37.33 
 
 		 4960 aa  704    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1749  amino acid adenylation domain protein  38.45 
 
 		 1199 aa  654    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.82306  normal  0.0351239 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  40.96 
 
 		 6006 aa  652    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  42 
 
 		 8646 aa  686    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  34.34 
 
 		 1454 aa  738    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5751  amino acid adenylation domain protein  38.87 
 
 		 1578 aa  671    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  38.81 
 
 		 6081 aa  654    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  39.32 
 
 		 4468 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  37.5 
 
 		 4336 aa  635  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  40.64 
 
 		 5929 aa  632  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  40 
 
 		 9498 aa  632  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  40.99 
 
 		 4882 aa  630  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  37.97 
 
 		 4037 aa  632  1e-179  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4838  amino acid adenylation  34.9 
 
 		 1436 aa  628  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0776089 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  38.16 
 
 		 3291 aa  628  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  37.19 
 
 		 1369 aa  628  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1965  amino acid adenylation domain-containing protein  38.63 
 
 		 2439 aa  629  1e-178  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>