More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI00710 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006694  CNI00710  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase, putative  100 
 
 
706 aa  1453    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06014  fatty acid activator Faa4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09910)  39.3 
 
 
698 aa  517  1.0000000000000001e-145  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.547026 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65071  long-chain fatty acid--CoA ligase and synthetase 4  39.52 
 
 
699 aa  458  1e-127  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.418644  normal  0.491736 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24496  predicted protein  33.49 
 
 
667 aa  322  9.999999999999999e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20143  long chain acyl-coa synthetase  31.96 
 
 
721 aa  308  3e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26758  predicted protein  33.46 
 
 
630 aa  295  2e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0405652 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17720  precursor of ligase long chain acyl-coa ligase  30.41 
 
 
678 aa  238  2e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08280  AMP-binding enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04270)  29.23 
 
 
708 aa  236  1.0000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00660  long-chain-fatty-acid-CoA ligase, putative  31.08 
 
 
727 aa  229  2e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.665335  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  27.79 
 
 
592 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2212  AMP-dependent synthetase and ligase  27.16 
 
 
685 aa  213  7.999999999999999e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.169636 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  27.32 
 
 
610 aa  209  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  26.71 
 
 
652 aa  207  7e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  27.68 
 
 
649 aa  207  7e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  30.15 
 
 
633 aa  206  9e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  29.09 
 
 
660 aa  206  2e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.83669 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  26.66 
 
 
669 aa  204  4e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  25.85 
 
 
612 aa  200  7e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35069  long-chain fatty acid CoA ligase  27.25 
 
 
718 aa  199  2.0000000000000003e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.193785  normal  0.930837 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  26.92 
 
 
610 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  26.02 
 
 
587 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89450  long-chain-fatty-acid CoA ligase  27.18 
 
 
720 aa  198  2.0000000000000003e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.67886  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  26.88 
 
 
610 aa  196  1e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  27.91 
 
 
606 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  28.87 
 
 
607 aa  196  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  26.32 
 
 
630 aa  196  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  26.45 
 
 
607 aa  195  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1547  AMP-dependent synthetase and ligase  28.45 
 
 
619 aa  194  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.174488  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  26.89 
 
 
613 aa  195  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  26.24 
 
 
596 aa  193  8e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  24.96 
 
 
612 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  28.22 
 
 
602 aa  192  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  26.38 
 
 
598 aa  192  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  29.94 
 
 
590 aa  192  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  26.52 
 
 
604 aa  190  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  28.02 
 
 
606 aa  191  5.999999999999999e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  25.4 
 
 
610 aa  190  7e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  29.29 
 
 
633 aa  189  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0439  AMP-dependent synthetase and ligase  25.08 
 
 
638 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58181  long-chain fatty acid CoA ligase  26.07 
 
 
753 aa  189  1e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  27.08 
 
 
606 aa  189  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3173  AMP-dependent synthetase and ligase  25.23 
 
 
658 aa  188  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4979  AMP-dependent synthetase and ligase  26.11 
 
 
684 aa  188  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  26.74 
 
 
599 aa  187  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  25.7 
 
 
622 aa  187  7e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  30.32 
 
 
594 aa  187  7e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3623  AMP-dependent synthetase and ligase  28.25 
 
 
596 aa  186  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  26.78 
 
 
606 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  29.4 
 
 
611 aa  185  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0660  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.68 
 
 
645 aa  184  5.0000000000000004e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.711243  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2120  AMP-dependent synthetase and ligase  26.78 
 
 
672 aa  184  7e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342483  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  30.82 
 
 
597 aa  184  7e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  26.77 
 
 
679 aa  182  2e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  27.1 
 
 
603 aa  182  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  29.61 
 
 
598 aa  182  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  26.05 
 
 
592 aa  181  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  25.08 
 
 
592 aa  181  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0072  AMP-dependent synthetase and ligase  31.18 
 
 
597 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  26.18 
 
 
603 aa  180  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  25.83 
 
 
602 aa  180  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0595  AMP-dependent synthetase and ligase  25.16 
 
 
601 aa  180  9e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01120  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  29.46 
 
 
606 aa  180  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  26.25 
 
 
610 aa  180  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1122  AMP-dependent synthetase and ligase  26.4 
 
 
606 aa  178  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  29.55 
 
 
602 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12071  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  26.92 
 
 
590 aa  179  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  29.55 
 
 
602 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482312  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  27.47 
 
 
611 aa  179  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  28.24 
 
 
615 aa  178  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3675  AMP-dependent synthetase and ligase  29.55 
 
 
602 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.438737  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  27.41 
 
 
617 aa  179  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.78 
 
 
601 aa  179  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  27.09 
 
 
603 aa  179  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2556  AMP-dependent synthetase and ligase  26.35 
 
 
660 aa  178  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  27.44 
 
 
661 aa  177  7e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  27.04 
 
 
600 aa  177  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16820  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  27.68 
 
 
603 aa  177  8e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.255817  normal  0.0373758 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  29.68 
 
 
598 aa  176  9e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.97 
 
 
602 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  31.4 
 
 
605 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2933  AMP binding protein  28.91 
 
 
588 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.617922  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3532  AMP-dependent synthetase and ligase  28.91 
 
 
601 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4186  AMP-dependent synthetase and ligase  28.14 
 
 
598 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3402  AMP binding protein  28.91 
 
 
601 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  27.83 
 
 
609 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0054  AMP-dependent synthetase and ligase  23.63 
 
 
625 aa  175  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.412311  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1204  AMP-dependent synthetase and ligase  26.88 
 
 
609 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110372  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  26.84 
 
 
592 aa  176  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  29.76 
 
 
598 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  32.27 
 
 
591 aa  174  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  25.2 
 
 
605 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05330  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  26.84 
 
 
612 aa  174  3.9999999999999995e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  29.61 
 
 
598 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  26.03 
 
 
610 aa  174  6.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  30.93 
 
 
615 aa  174  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  28.48 
 
 
602 aa  173  9e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  29 
 
 
637 aa  172  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1829  AMP-dependent synthetase and ligase  23.5 
 
 
657 aa  173  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170019  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  26.67 
 
 
595 aa  172  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0075  AMP-dependent synthetase and ligase  29.49 
 
 
601 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>