More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3187 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5457  ornithine acetyl transferase inhibitor  41.42 
 
 
1149 aa  693    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2109  nonribosomal peptide synthetase  41.91 
 
 
1145 aa  771    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5011  amino acid adenylation:thioester reductase  39.78 
 
 
1148 aa  718    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0126  amino acid adenylation:thioester reductase  40.7 
 
 
1129 aa  661    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.488136  normal  0.545759 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4973  amino acid adenylation  100 
 
 
1188 aa  2345    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432296  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4292  amino acid adenylation domain-containing protein  98.48 
 
 
1188 aa  2311    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375384  normal  0.670751 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3187  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 
1188 aa  2345    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  37.29 
 
 
1498 aa  504  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  32.29 
 
 
1454 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10861  hypothetical protein  33.08 
 
 
2199 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7306  peptide synthetase  35.53 
 
 
1506 aa  466  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.370247  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  28.32 
 
 
2054 aa  433  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  36.12 
 
 
1449 aa  433  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4890  amino acid adenylation domain-containing protein  35.69 
 
 
1500 aa  424  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.365672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4416  amino acid adenylation domain-containing protein  35.52 
 
 
1485 aa  422  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2186  non-ribosomal peptide synthase MxaA  33.64 
 
 
1436 aa  388  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026407  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0368  amino acid adenylation domain-containing protein  28.02 
 
 
1194 aa  385  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5489  amino acid adenylation domain-containing protein  27.62 
 
 
2439 aa  373  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934581 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0443  linear gramicidin synthetase subunit C  28.23 
 
 
1193 aa  370  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1805  amino acid adenylation domain-containing protein  32.45 
 
 
1413 aa  366  2e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.323791  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4881  linear gramicidin synthetase subunit C  28.15 
 
 
1193 aa  363  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3516  amino acid adenylation domain-containing protein  34.06 
 
 
995 aa  358  3.9999999999999996e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10102  peptide synthetase nrp  33.02 
 
 
2512 aa  357  8.999999999999999e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  37.86 
 
 
6889 aa  347  8e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5388  amino acid adenylation domain-containing protein  32.74 
 
 
997 aa  341  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82388  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2095  amino acid adenylation domain-containing protein  32.72 
 
 
3395 aa  340  9.999999999999999e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.800691  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00170  aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase, putative  28.8 
 
 
1409 aa  336  2e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.682323  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11140  putative nonribosomal peptide synthetase  32.14 
 
 
991 aa  333  9e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  33.99 
 
 
5738 aa  333  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  35.36 
 
 
2033 aa  333  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  39.27 
 
 
7785 aa  332  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1088  hypothetical protein  41.16 
 
 
2187 aa  331  4e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9641  peptide synthetase  37.95 
 
 
3761 aa  330  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  31.88 
 
 
1550 aa  328  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2086  linear gramicidin synthetase subunit D  32.18 
 
 
1002 aa  328  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1875  amino acid adenylation domain-containing protein  34.81 
 
 
1990 aa  328  5e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  36.57 
 
 
2386 aa  327  6e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  43.46 
 
 
8211 aa  327  8.000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  31.5 
 
 
2138 aa  327  1e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  39.26 
 
 
8646 aa  325  4e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  32.46 
 
 
3308 aa  325  4e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2968  amino acid adenylation domain-containing protein  31.62 
 
 
1331 aa  324  7e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  35.25 
 
 
9175 aa  323  8e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  35.08 
 
 
6202 aa  323  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000018726 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  39.77 
 
 
2370 aa  323  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  37.07 
 
 
9498 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  36.38 
 
 
6676 aa  322  3e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5064  amino acid adenylation domain protein  37.76 
 
 
4449 aa  320  9e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  37.34 
 
 
13537 aa  320  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  37.78 
 
 
4531 aa  319  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2054  amino acid adenylation  36.14 
 
 
3102 aa  319  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.17 
 
 
2385 aa  318  4e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1023  amino acid adenylation domain-containing protein  31.83 
 
 
992 aa  318  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2384  amino acid adenylation domain protein  31.07 
 
 
2508 aa  318  5e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2386  amino acid adenylation domain protein  33.28 
 
 
1893 aa  317  7e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.01 
 
 
2385 aa  317  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0164  thioester reductase domain-containing protein  25.68 
 
 
2391 aa  316  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0169  thioester reductase domain-containing protein  25.68 
 
 
2391 aa  316  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  36.55 
 
 
5422 aa  316  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68020  L-aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase, large subunit  27.31 
 
 
1394 aa  316  1.9999999999999998e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224506  normal  0.0608631 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.71 
 
 
2385 aa  315  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  35.57 
 
 
5213 aa  314  4.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  35.28 
 
 
5953 aa  313  9e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  38.17 
 
 
2614 aa  313  9e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  29.74 
 
 
1270 aa  313  1e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  33.54 
 
 
2386 aa  313  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  36 
 
 
4468 aa  313  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  36.72 
 
 
4383 aa  313  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  35.86 
 
 
4572 aa  312  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.39 
 
 
2385 aa  311  4e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  35.47 
 
 
4882 aa  311  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  32.09 
 
 
2176 aa  311  5e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  33.71 
 
 
1786 aa  311  5e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1084  non-ribosomal peptide synthetase modules and related proteins-like protein  27.99 
 
 
2638 aa  310  9e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  35.59 
 
 
6661 aa  310  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  36.71 
 
 
3291 aa  310  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4085  amino acid adenylation domain-containing protein  34.73 
 
 
2606 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  36.02 
 
 
8915 aa  310  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  35.73 
 
 
1753 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1971  amino acid adenylation domain-containing protein  38.47 
 
 
1109 aa  309  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.353817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2088  amino acid adenylation domain-containing protein  30.63 
 
 
2894 aa  309  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.64 
 
 
2385 aa  308  3e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.64 
 
 
2385 aa  308  3e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25560  Non-ribosomal peptide synthase, PvdD-like protein  35.49 
 
 
2878 aa  308  4.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.65 
 
 
2385 aa  308  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  37.34 
 
 
1769 aa  308  5.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54920  putative non-ribosomal peptide synthetase  31.2 
 
 
1487 aa  308  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0523722  unclonable  4.46113e-20 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  34.09 
 
 
8914 aa  308  5.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  32.95 
 
 
2581 aa  307  7e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  33.65 
 
 
2385 aa  307  8.000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  36.39 
 
 
3348 aa  307  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  33.49 
 
 
2385 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  34.99 
 
 
5372 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  30.08 
 
 
3498 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1938  putative peptide synthetase  36.54 
 
 
1520 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  36.69 
 
 
6006 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0618  putative peptide synthetase  36.54 
 
 
1483 aa  306  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.099304  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1646  putative peptide synthetase  36.54 
 
 
1483 aa  306  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5752  amino acid adenylation domain protein  32.9 
 
 
1069 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1733  putative peptide synthetase  36.54 
 
 
1528 aa  306  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>