More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1971 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  40.57 
 
 
3470 aa  639    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  42.31 
 
 
3639 aa  739    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  39.85 
 
 
4317 aa  647    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  39.58 
 
 
6661 aa  657    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  42.04 
 
 
5953 aa  686    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  41.67 
 
 
6889 aa  751    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  38.34 
 
 
2156 aa  692    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  35.04 
 
 
2164 aa  654    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1971  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 
1109 aa  2194    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.353817 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  38.2 
 
 
2156 aa  680    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  40.1 
 
 
5929 aa  646    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  41.38 
 
 
4747 aa  687    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  37.28 
 
 
3432 aa  668    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  39.13 
 
 
4531 aa  644    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  40.94 
 
 
4317 aa  667    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  35.45 
 
 
3235 aa  666    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2384  amino acid adenylation domain protein  36.92 
 
 
2508 aa  668    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  35.29 
 
 
2193 aa  652    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  38.86 
 
 
7122 aa  674    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  41.63 
 
 
4136 aa  650    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  41.31 
 
 
3328 aa  670    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  40.78 
 
 
2350 aa  652    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  40.48 
 
 
2154 aa  654    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0982  amino acid adenylation domain protein  36.52 
 
 
2006 aa  644    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  40.15 
 
 
5926 aa  645    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  38.95 
 
 
9498 aa  665    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  40.06 
 
 
5372 aa  639    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  40.54 
 
 
13537 aa  687    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  41.25 
 
 
6676 aa  690    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  37.76 
 
 
2419 aa  666    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  36.56 
 
 
2867 aa  640    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  36.05 
 
 
1142 aa  652    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  40.13 
 
 
3308 aa  755    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  38.73 
 
 
3498 aa  719    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  39.29 
 
 
2033 aa  691    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  41.72 
 
 
6403 aa  682    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  40.36 
 
 
4318 aa  637    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  41.44 
 
 
1839 aa  639    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4417  amino acid adenylation domain-containing protein  40.82 
 
 
1104 aa  652    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.543215 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  35.63 
 
 
1556 aa  694    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  41.31 
 
 
6072 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3419  amino acid adenylation domain protein  37.22 
 
 
3453 aa  665    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5751  amino acid adenylation domain protein  39.9 
 
 
1578 aa  676    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  40.09 
 
 
4502 aa  667    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  41.19 
 
 
5213 aa  694    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  40.23 
 
 
4882 aa  643    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  38.93 
 
 
3002 aa  650    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  39.22 
 
 
4332 aa  638    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  39.96 
 
 
4317 aa  656    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  38.39 
 
 
2571 aa  681    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  38.05 
 
 
2156 aa  686    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  35.63 
 
 
1556 aa  694    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1970  amino acid adenylation domain-containing protein  43.27 
 
 
1137 aa  721    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0949143 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3972  amino acid adenylation domain-containing protein  40.36 
 
 
1126 aa  654    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.47287  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  39.26 
 
 
5596 aa  645    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3418  amino acid adenylation domain protein  36.21 
 
 
4354 aa  645    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.696209 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  39.02 
 
 
1550 aa  714    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  38.14 
 
 
4960 aa  681    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  35.53 
 
 
3086 aa  681    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  35.53 
 
 
3086 aa  680    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4891  amino acid adenylation domain-containing protein  40.96 
 
 
1104 aa  644    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0706407  normal  0.0725779 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  35.82 
 
 
3291 aa  688    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  38.91 
 
 
2201 aa  639    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  41.12 
 
 
4991 aa  644    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25560  Non-ribosomal peptide synthase, PvdD-like protein  40.59 
 
 
2878 aa  639    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2097  amino acid adenylation domain-containing protein  33.46 
 
 
1992 aa  643    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164393  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  41.11 
 
 
5149 aa  649    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  41.18 
 
 
2448 aa  655    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  40.46 
 
 
2370 aa  672    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2415  amino acid adenylation domain-containing protein  40.19 
 
 
1127 aa  694    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  39.72 
 
 
2125 aa  672    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5064  amino acid adenylation domain protein  40.49 
 
 
4449 aa  640    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2329  amino acid adenylation domain protein  34.37 
 
 
2752 aa  656    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  41.48 
 
 
4383 aa  636    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  41.31 
 
 
3352 aa  670    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  39.76 
 
 
4317 aa  652    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  34.69 
 
 
1833 aa  647    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  38.92 
 
 
3942 aa  638    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  38.39 
 
 
4960 aa  678    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  38.54 
 
 
4968 aa  687    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  41.21 
 
 
6006 aa  667    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  38.39 
 
 
2571 aa  681    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1965  amino acid adenylation domain-containing protein  41.53 
 
 
2439 aa  643    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.229236 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  41.31 
 
 
6081 aa  670    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  41.33 
 
 
1769 aa  639    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  33.21 
 
 
2054 aa  634  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  35.33 
 
 
1786 aa  635  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  38.73 
 
 
3291 aa  635  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  38.55 
 
 
3348 aa  634  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  38.57 
 
 
2174 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  39.71 
 
 
2151 aa  631  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  39.53 
 
 
2189 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  40.62 
 
 
8646 aa  631  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  38.28 
 
 
4336 aa  627  1e-178  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  39.36 
 
 
3021 aa  627  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1793  amino acid adenylation  38.48 
 
 
1370 aa  627  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0250793 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  38.39 
 
 
4336 aa  626  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  35.91 
 
 
7168 aa  626  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  38.58 
 
 
1369 aa  629  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  39.6 
 
 
4342 aa  629  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>