More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5388 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1023  amino acid adenylation domain-containing protein  50.25 
 
 		 992 aa  928    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3516  amino acid adenylation domain-containing protein  54.95 
 
 		 995 aa  1010    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5388  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 		 997 aa  2032    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11140  putative nonribosomal peptide synthetase  50.35 
 
 		 991 aa  936    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2086  linear gramicidin synthetase subunit D  52.22 
 
 		 1002 aa  963    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  31.37 
 
 		 1454 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  33.08 
 
 		 1498 aa  405  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4416  amino acid adenylation domain-containing protein  32.94 
 
 		 1485 aa  393  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4890  amino acid adenylation domain-containing protein  31.91 
 
 		 1500 aa  382  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.365672 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7306  peptide synthetase  33.23 
 
 		 1506 aa  373  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.370247  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  31.56 
 
 		 1449 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  34.6 
 
 		 4960 aa  364  6e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  34.76 
 
 		 4960 aa  363  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0368  amino acid adenylation domain-containing protein  28.75 
 
 		 1194 aa  362  3e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2186  non-ribosomal peptide synthase MxaA  33.07 
 
 		 1436 aa  360  6e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1805  amino acid adenylation domain-containing protein  30.01 
 
 		 1413 aa  358  2.9999999999999997e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.323791  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  34.85 
 
 		 4968 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0443  linear gramicidin synthetase subunit C  28.98 
 
 		 1193 aa  350  1e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4292  amino acid adenylation domain-containing protein  33.33 
 
 		 1188 aa  348  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375384  normal  0.670751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  35.06 
 
 		 9175 aa  347  5e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.233499 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08105  NRPS-like enzyme, putative (JCVI)  29.15 
 
 		 1077 aa  343  8e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.250944 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4881  linear gramicidin synthetase subunit C  28.89 
 
 		 1193 aa  343  8e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4973  amino acid adenylation  33.41 
 
 		 1188 aa  343  9e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432296  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3187  amino acid adenylation domain-containing protein  33.41 
 
 		 1188 aa  343  9e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10861  hypothetical protein  29.08 
 
 		 2199 aa  339  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  29.27 
 
 		 2054 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5489  amino acid adenylation domain-containing protein  27.61 
 
 		 2439 aa  333  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934581 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  36.19 
 
 		 6676 aa  317  8e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  37.65 
 
 		 2370 aa  316  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5457  ornithine acetyl transferase inhibitor  29.55 
 
 		 1149 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  35.4 
 
 		 4531 aa  313  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2386  amino acid adenylation domain protein  33.16 
 
 		 1893 aa  313  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2109  nonribosomal peptide synthetase  28.98 
 
 		 1145 aa  312  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  34.42 
 
 		 6661 aa  312  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5011  amino acid adenylation:thioester reductase  28.9 
 
 		 1148 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116457 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3419  amino acid adenylation domain protein  34.31 
 
 		 3453 aa  309  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2576  amino acid adenylation  36.13 
 
 		 3165 aa  308  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0126  amino acid adenylation:thioester reductase  28.97 
 
 		 1129 aa  308  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.488136  normal  0.545759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  37.13 
 
 		 8646 aa  305  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54920  putative non-ribosomal peptide synthetase  28.63 
 
 		 1487 aa  304  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0523722  unclonable  4.46113e-20 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  37.48 
 
 		 4383 aa  302  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  35.41 
 
 		 5422 aa  303  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  33.6 
 
 		 2033 aa  302  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  36.2 
 
 		 6889 aa  300  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2095  amino acid adenylation domain-containing protein  33.81 
 
 		 3395 aa  299  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.800691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1574  amino acid adenylation domain-containing protein  35.04 
 
 		 1714 aa  298  4e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2829  non-ribosomal peptide synthetase SyfA  35.15 
 
 		 3168 aa  297  7e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  28.37 
 
 		 1270 aa  297  8e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  31.16 
 
 		 2156 aa  296  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2088  amino acid adenylation domain-containing protein  33.73 
 
 		 2894 aa  296  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  35.7 
 
 		 7310 aa  295  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  33.55 
 
 		 4572 aa  294  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2054  amino acid adenylation  38.13 
 
 		 3102 aa  293  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  31.44 
 
 		 2156 aa  293  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  37.36 
 
 		 5372 aa  292  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  32.45 
 
 		 1556 aa  292  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  37.66 
 
 		 5698 aa  292  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  33.5 
 
 		 1550 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  35.3 
 
 		 5926 aa  291  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  31.09 
 
 		 2156 aa  291  4e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1875  amino acid adenylation domain-containing protein  34.94 
 
 		 1990 aa  290  7e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  33.06 
 
 		 3498 aa  290  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  35.52 
 
 		 4882 aa  289  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  33.06 
 
 		 7168 aa  289  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  35.42 
 
 		 5929 aa  289  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3891  amino acid adenylation domain protein  36.01 
 
 		 1256 aa  289  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  32.99 
 
 		 3308 aa  288  4e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  32.55 
 
 		 4468 aa  288  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  33.71 
 
 		 2176 aa  287  5e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  34.32 
 
 		 2571 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  34.32 
 
 		 2571 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2005  putative syringomycin synthetase  36.13 
 
 		 6271 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  31.91 
 
 		 1556 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2161  hypothetical protein  36.27 
 
 		 6274 aa  286  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  35.7 
 
 		 7712 aa  285  3.0000000000000004e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  33.68 
 
 		 1142 aa  284  5.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  33.33 
 
 		 2419 aa  284  7.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4084  amino acid adenylation domain-containing protein  34.6 
 
 		 1114 aa  283  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5619  amino acid adenylation domain-containing protein  32.44 
 
 		 1518 aa  282  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3416  amino acid adenylation domain protein  31.99 
 
 		 1020 aa  281  6e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0257508  normal  0.239752 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  36.01 
 
 		 2626 aa  280  7e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00170  aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase, putative  25.81 
 
 		 1409 aa  280  8e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.682323  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2211  amino acid adenylation  34.45 
 
 		 2136 aa  280  8e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2025  putative syringomycin synthetase  36.13 
 
 		 6272 aa  280  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1877  amino acid adenylation domain-containing protein  33.16 
 
 		 1525 aa  280  9e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  35.62 
 
 		 3639 aa  280  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  32.35 
 
 		 2867 aa  280  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  36.52 
 
 		 8914 aa  279  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2875  linear gramicidin synthetase subunit C  32.21 
 
 		 1518 aa  279  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0188  amino acid adenylation domain-containing protein  37.56 
 
 		 1638 aa  278  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2274  LtxA  60.09 
 
 		 226 aa  278  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.518726  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4054  amino acid adenylation domain-containing protein  38.52 
 
 		 1690 aa  278  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.631395  normal  0.292713 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2364  peptide synthetase, putative  34.67 
 
 		 3650 aa  278  5e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1084  non-ribosomal peptide synthetase modules and related proteins-like protein  28.96 
 
 		 2638 aa  277  6e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9641  peptide synthetase  34.43 
 
 		 3761 aa  277  7e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12405  peptide synthetase mbtE  35.85 
 
 		 1731 aa  277  8e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.517103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4085  amino acid adenylation domain-containing protein  35.04 
 
 		 2606 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4486  amino acid adenylation domain protein  35.05 
 
 		 1691 aa  276  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3845  amino acid adenylation domain-containing protein  35.49 
 
 		 1721 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.549835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  35.25 
 
 		 7785 aa  276  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>