More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2392 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1437  AMP-dependent synthetase and ligase  82.13 
 
 
1460 aa  2388    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
1549 aa  3102    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.750359  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2423  AMP-dependent synthetase and ligase  80.4 
 
 
1549 aa  2471    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2510  AMP-dependent synthetase and ligase  80.21 
 
 
1549 aa  2469    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.57 
 
 
597 aa  238  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  31.72 
 
 
602 aa  238  7e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  30.38 
 
 
605 aa  231  6e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  30.29 
 
 
604 aa  231  7e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  30.73 
 
 
612 aa  231  7e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  30.32 
 
 
601 aa  231  9e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  30.53 
 
 
604 aa  230  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  29.72 
 
 
630 aa  229  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  29.33 
 
 
600 aa  228  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  31.23 
 
 
612 aa  228  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  30.59 
 
 
603 aa  226  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  31.14 
 
 
606 aa  226  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  30.42 
 
 
607 aa  226  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  29.77 
 
 
622 aa  226  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  31.6 
 
 
606 aa  226  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  29.78 
 
 
604 aa  225  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  28.74 
 
 
597 aa  224  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  28.84 
 
 
602 aa  223  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  30.98 
 
 
606 aa  223  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  30.12 
 
 
622 aa  223  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  29.1 
 
 
593 aa  223  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  28.28 
 
 
590 aa  222  5e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  31.33 
 
 
580 aa  221  6e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  28.34 
 
 
607 aa  221  7.999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  30.12 
 
 
600 aa  221  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  30.32 
 
 
610 aa  221  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  29.39 
 
 
607 aa  220  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  28.37 
 
 
596 aa  220  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  31.15 
 
 
580 aa  219  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  30.34 
 
 
633 aa  219  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  29.95 
 
 
603 aa  219  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0747  AMP-dependent synthetase and ligase  29.97 
 
 
602 aa  219  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  32.33 
 
 
632 aa  217  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  29.86 
 
 
597 aa  217  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  29.86 
 
 
597 aa  217  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  29.86 
 
 
597 aa  216  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2970  AMP-dependent synthetase and ligase  30.1 
 
 
546 aa  216  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383632  normal  0.0772174 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  29.39 
 
 
599 aa  216  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  29.87 
 
 
599 aa  216  3.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  28.99 
 
 
601 aa  215  7e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  30.85 
 
 
592 aa  214  7e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  29.88 
 
 
603 aa  214  7.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  30.08 
 
 
606 aa  214  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  28.5 
 
 
602 aa  213  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1388  AMP-dependent synthetase and ligase  30.02 
 
 
602 aa  213  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  31.86 
 
 
509 aa  214  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.429001  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  30.09 
 
 
591 aa  213  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  28.48 
 
 
649 aa  213  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  27.67 
 
 
599 aa  213  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  28.22 
 
 
615 aa  213  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  28.31 
 
 
600 aa  213  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.13 
 
 
602 aa  213  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  27.62 
 
 
607 aa  212  5e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  28.4 
 
 
601 aa  212  6e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0475  AMP-dependent synthetase and ligase  31.35 
 
 
567 aa  212  6e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.958743 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  27.27 
 
 
603 aa  211  7e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  27.73 
 
 
610 aa  211  7e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  27.23 
 
 
592 aa  211  8e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  31.11 
 
 
612 aa  211  8e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  28.35 
 
 
598 aa  211  9e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  29.22 
 
 
597 aa  211  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  29.63 
 
 
606 aa  210  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  27.09 
 
 
592 aa  209  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.7 
 
 
601 aa  209  5e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  27.39 
 
 
610 aa  208  5e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  29.9 
 
 
602 aa  208  6e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  28.19 
 
 
604 aa  208  7e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0949  AMP-binding enzyme  25.92 
 
 
603 aa  207  9e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  27.91 
 
 
610 aa  207  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  27.91 
 
 
598 aa  206  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  27.89 
 
 
610 aa  206  2e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  27.46 
 
 
595 aa  207  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  28.6 
 
 
605 aa  206  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  30.48 
 
 
608 aa  206  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  26.52 
 
 
602 aa  206  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  28.15 
 
 
599 aa  206  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  29.6 
 
 
616 aa  206  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  29.16 
 
 
604 aa  204  7e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  28.4 
 
 
611 aa  205  7e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  27.44 
 
 
609 aa  205  7e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  29.32 
 
 
626 aa  204  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01120  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  27.62 
 
 
606 aa  204  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  29.33 
 
 
599 aa  204  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3402  AMP binding protein  28.36 
 
 
601 aa  204  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3532  AMP-dependent synthetase and ligase  28.36 
 
 
601 aa  204  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  28.59 
 
 
617 aa  204  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  25.8 
 
 
592 aa  203  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  26.42 
 
 
594 aa  203  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0595  AMP-dependent synthetase and ligase  29.31 
 
 
601 aa  202  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  28.4 
 
 
597 aa  202  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3751  AMP-dependent synthetase and ligase  31.2 
 
 
647 aa  201  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.673702 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2933  AMP binding protein  28.81 
 
 
588 aa  201  7.999999999999999e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.617922  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  28.96 
 
 
609 aa  201  9e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  28.07 
 
 
599 aa  201  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  27.32 
 
 
610 aa  200  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  28.68 
 
 
587 aa  200  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>