More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3296 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3296  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 
332 aa  679    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0222371  normal  0.147451 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2411  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  75.3 
 
 
332 aa  518  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.261098 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2679  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  74.1 
 
 
332 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0614199  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02730  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  75.38 
 
 
334 aa  503  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.502125  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2382  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  72.21 
 
 
331 aa  478  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407349  hitchhiker  0.00787022 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1189  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  72.73 
 
 
331 aa  475  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0549681  normal  0.0736212 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0595  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  69.18 
 
 
334 aa  472  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2563  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  68.28 
 
 
331 aa  471  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1222  dTDP-glucose-4,6-dehydratase  68.45 
 
 
348 aa  473  1e-132  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1198  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  66.96 
 
 
348 aa  468  1.0000000000000001e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1568  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  68.18 
 
 
340 aa  466  9.999999999999999e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13501  dTDP-glucose 4,6-dehydratase rmlB  70.69 
 
 
331 aa  462  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.281235  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08920  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  67.58 
 
 
331 aa  457  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0563626  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0204  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  64.31 
 
 
350 aa  448  1e-125  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1421  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  64.6 
 
 
345 aa  449  1e-125  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.829571  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1365  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  68.07 
 
 
335 aa  449  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.137011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1093  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  67.16 
 
 
335 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1066  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  67.46 
 
 
335 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1082  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  67.46 
 
 
335 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455649  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2044  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  67.87 
 
 
333 aa  444  1e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5007  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  65.37 
 
 
335 aa  434  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3787  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  63.72 
 
 
334 aa  429  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1055  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  64.75 
 
 
295 aa  365  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1177  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.7 
 
 
363 aa  351  1e-95  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.792141 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1863  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.48 
 
 
341 aa  317  3e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.37 
 
 
322 aa  310  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1337  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.06 
 
 
322 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.06 
 
 
322 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895742 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1117  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.89 
 
 
322 aa  309  4e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565824  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0494  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.85 
 
 
355 aa  308  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.774907  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0481  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.15 
 
 
355 aa  308  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0305  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.9 
 
 
342 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1269  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.75 
 
 
323 aa  308  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.281724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1137  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.75 
 
 
322 aa  308  8e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1230  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.75 
 
 
322 aa  308  8e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2799  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.69 
 
 
336 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0141685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1375  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.06 
 
 
322 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0957  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.18 
 
 
357 aa  306  3e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.177421 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4468  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50 
 
 
337 aa  306  3e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2639  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.1 
 
 
356 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.997652  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.44 
 
 
323 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.416009  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6347  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.46 
 
 
330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1447  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.76 
 
 
329 aa  302  6.000000000000001e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0260  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.08 
 
 
327 aa  301  8.000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2404  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50 
 
 
323 aa  298  6e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4289  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.53 
 
 
353 aa  298  7e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.337575 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06090  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.77 
 
 
330 aa  296  3e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262708  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0795  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  47.45 
 
 
359 aa  296  4e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4310  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.53 
 
 
355 aa  295  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.847685  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4133  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.53 
 
 
355 aa  295  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4148  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.53 
 
 
355 aa  295  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4251  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.53 
 
 
355 aa  295  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207369  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1489  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.29 
 
 
354 aa  295  9e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204421 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0824  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  47.75 
 
 
359 aa  294  1e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0050  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.9 
 
 
351 aa  294  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1669  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.14 
 
 
357 aa  295  1e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03666  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.53 
 
 
355 aa  293  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4188  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.53 
 
 
355 aa  293  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03615  hypothetical protein  45.53 
 
 
355 aa  293  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0837  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.38 
 
 
361 aa  293  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.378615  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00991  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  46.18 
 
 
360 aa  293  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4202  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.24 
 
 
355 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0734  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.98 
 
 
335 aa  293  3e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.290638  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2097  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.53 
 
 
347 aa  293  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0243  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  45.86 
 
 
363 aa  293  4e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4152  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.53 
 
 
355 aa  293  4e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4211  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.24 
 
 
331 aa  293  4e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0180  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  45.86 
 
 
363 aa  293  4e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812162  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1405  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.57 
 
 
354 aa  292  4e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0701  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.76 
 
 
360 aa  292  6e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.004629  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0107  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.02 
 
 
367 aa  292  7e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0752  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.7 
 
 
360 aa  291  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1683  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.47 
 
 
363 aa  291  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.429769  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0516  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  45.85 
 
 
355 aa  291  1e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.92 
 
 
354 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901656 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4029  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.85 
 
 
355 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4005  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.24 
 
 
355 aa  290  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4215  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.24 
 
 
355 aa  290  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2131  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.16 
 
 
358 aa  290  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0186  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.85 
 
 
355 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4299  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.24 
 
 
355 aa  290  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1318  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  44.44 
 
 
359 aa  290  3e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0342732 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3465  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.04 
 
 
360 aa  290  3e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.848345  normal  0.362131 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5396  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.75 
 
 
360 aa  289  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0619  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.25 
 
 
355 aa  289  5.0000000000000004e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129356 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1239  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.42 
 
 
364 aa  288  6e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5221  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.31 
 
 
355 aa  288  7e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175839  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0231  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.17 
 
 
318 aa  288  7e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592131  normal  0.59425 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0899  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.55 
 
 
355 aa  288  7e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4439400000000002e-32 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1124  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.91 
 
 
323 aa  288  7e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0644506  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4198  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.96 
 
 
355 aa  288  8e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0926  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.96 
 
 
366 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770588  normal  0.575373 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4166  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.8 
 
 
361 aa  287  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.167438  normal  0.0625555 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2473  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.54 
 
 
358 aa  287  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3285  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.86 
 
 
353 aa  287  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4935  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.45 
 
 
360 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2711  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.13 
 
 
356 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3502  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.04 
 
 
363 aa  286  4e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.602458 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2366  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.34 
 
 
358 aa  286  4e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.501885  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4128  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.61 
 
 
352 aa  286  4e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0972084  hitchhiker  0.00000000618238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>