More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1239 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1239  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 		 364 aa  764    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0305  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.32 
 
 		 342 aa  318  1e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0712  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.55 
 
 		 354 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.7 
 
 		 354 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.901656 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2639  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.77 
 
 		 356 aa  311  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.997652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0481  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.56 
 
 		 355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0494  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.56 
 
 		 355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.774907  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1489  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.41 
 
 		 354 aa  309  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204421 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0682  dTDP-glucose 4,6-dehydratase protein  48.55 
 
 		 354 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06090  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.4 
 
 		 330 aa  306  3e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262708  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0957  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.68 
 
 		 357 aa  306  3e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.177421 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2735  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.38 
 
 		 354 aa  305  6e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0878  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.67 
 
 		 353 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3803  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.26 
 
 		 350 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0260  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.09 
 
 		 327 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0619  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.25 
 
 		 355 aa  302  5.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129356 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2319  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.25 
 
 		 353 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.251448 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2719  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.08 
 
 		 358 aa  301  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.719616  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0595  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.41 
 
 		 334 aa  301  1e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4812  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.89 
 
 		 355 aa  300  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2139  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.26 
 
 		 356 aa  300  4e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1350  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.35 
 
 		 363 aa  300  4e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.505877  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1568  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  46.99 
 
 		 340 aa  300  4e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2679  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.15 
 
 		 332 aa  299  7e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0614199  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1685  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.04 
 
 		 342 aa  298  8e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0640  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.41 
 
 		 353 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6347  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.42 
 
 		 330 aa  298  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3727  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.67 
 
 		 353 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1714  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.67 
 
 		 353 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3383  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.61 
 
 		 338 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3969  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.25 
 
 		 353 aa  296  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00429727  normal  0.623158 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1405  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.66 
 
 		 354 aa  296  3e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4198  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.74 
 
 		 355 aa  296  4e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0389  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.8 
 
 		 353 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0628  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.39 
 
 		 357 aa  296  4e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0871  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.8 
 
 		 353 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.83298  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4166  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.26 
 
 		 361 aa  296  4e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.167438  normal  0.0625555 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2473  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.21 
 
 		 358 aa  296  5e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2762  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.4 
 
 		 352 aa  295  6e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1237  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.71 
 
 		 354 aa  295  7e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0761  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.67 
 
 		 353 aa  295  9e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0842  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.51 
 
 		 353 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0136971 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1785  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.26 
 
 		 366 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00820304 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0253  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.09 
 
 		 352 aa  294  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.430028  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03169  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.55 
 
 		 351 aa  294  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2456  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.45 
 
 		 353 aa  294  2e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4211  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.28 
 
 		 331 aa  293  3e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3163  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.02 
 
 		 400 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0923  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.02 
 
 		 400 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2100  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.54 
 
 		 357 aa  293  4e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2753  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.02 
 
 		 400 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.419146  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01947  dTDP-glucose 4,6 dehydratase, NAD(P)-binding  46.06 
 
 		 361 aa  292  5e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01936  hypothetical protein  46.06 
 
 		 361 aa  292  5e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3141  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.38 
 
 		 353 aa  292  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1990  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.38 
 
 		 353 aa  292  6e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0338476  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1852  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.38 
 
 		 353 aa  292  6e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.677884  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1469  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.8 
 
 		 397 aa  292  6e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.793194  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2563  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.06 
 
 		 331 aa  292  6e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2596  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.93 
 
 		 353 aa  292  6e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3105  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.38 
 
 		 353 aa  292  6e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311481  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03666  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.61 
 
 		 355 aa  292  7e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03615  hypothetical protein  45.61 
 
 		 355 aa  292  7e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2411  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.45 
 
 		 332 aa  292  7e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.261098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4005  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.61 
 
 		 355 aa  292  8e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4215  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.61 
 
 		 355 aa  292  8e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5221  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.61 
 
 		 355 aa  292  8e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175839  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4188  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.61 
 
 		 355 aa  291  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0441  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  43.8 
 
 		 379 aa  291  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2593  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.45 
 
 		 362 aa  291  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2131  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.23 
 
 		 358 aa  291  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1318  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  44.2 
 
 		 359 aa  291  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0342732 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0751  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.24 
 
 		 353 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0602  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  43.8 
 
 		 379 aa  291  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.159192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1379  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  43.53 
 
 		 359 aa  291  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000705991 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4299  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.61 
 
 		 355 aa  291  1e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2097  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.16 
 
 		 347 aa  290  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0926  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.15 
 
 		 366 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770588  normal  0.575373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5007  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.19 
 
 		 335 aa  290  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4152  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.61 
 
 		 355 aa  291  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1601  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  45.51 
 
 		 361 aa  290  4e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08920  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.41 
 
 		 331 aa  289  4e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0563626  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4115  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.27 
 
 		 346 aa  290  4e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2540  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  43.65 
 
 		 359 aa  290  4e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4138  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  43.92 
 
 		 330 aa  290  4e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000244942 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2008  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.29 
 
 		 366 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3861  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.3 
 
 		 350 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.646368 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2366  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.33 
 
 		 358 aa  289  6e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.501885  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2332  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  45.51 
 
 		 361 aa  289  6e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000326666  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1618  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.98 
 
 		 359 aa  289  6e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2653  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.19 
 
 		 360 aa  289  6e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1560  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45 
 
 		 354 aa  288  7e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3296  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.42 
 
 		 332 aa  288  7e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0222371  normal  0.147451 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4006  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.89 
 
 		 355 aa  288  8e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0503  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.55 
 
 		 351 aa  288  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0802438  normal  0.0327306 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6255  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.11 
 
 		 353 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0120  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.45 
 
 		 353 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1616  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.22 
 
 		 361 aa  287  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0945868  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0264  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.96 
 
 		 353 aa  287  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.850535  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1189  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.45 
 
 		 331 aa  287  2e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0549681  normal  0.0736212 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2631  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.16 
 
 		 360 aa  288  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>