More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2097 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2097  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 
347 aa  715    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1669  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  86.39 
 
 
357 aa  619  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0734  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  65.66 
 
 
335 aa  456  1e-127  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.290638  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0305  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.69 
 
 
342 aa  340  2e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2639  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.44 
 
 
356 aa  338  7e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.997652  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.44 
 
 
354 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901656 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3235  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.86 
 
 
352 aa  333  3e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1489  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.67 
 
 
354 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204421 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2404  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.81 
 
 
323 aa  331  1e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0494  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.85 
 
 
355 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.774907  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0957  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.4 
 
 
357 aa  328  9e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.177421 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0481  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.26 
 
 
355 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0056  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.16 
 
 
318 aa  318  7e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4128  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.9 
 
 
352 aa  317  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0972084  hitchhiker  0.00000000618238 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4138  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.78 
 
 
330 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000244942 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1136  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  50.15 
 
 
360 aa  317  2e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0311464 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1447  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.17 
 
 
329 aa  316  4e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1375  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.35 
 
 
322 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0186  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.69 
 
 
320 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2411  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.93 
 
 
332 aa  311  9e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.261098 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1337  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.73 
 
 
322 aa  311  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.73 
 
 
322 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895742 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1269  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.73 
 
 
323 aa  311  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.281724  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3680  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.23 
 
 
341 aa  310  2e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00834015  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1117  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.42 
 
 
322 aa  310  2e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.42 
 
 
322 aa  310  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2679  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50 
 
 
332 aa  310  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0614199  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1137  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.42 
 
 
322 aa  309  4e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1230  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.42 
 
 
322 aa  309  4e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0260  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.77 
 
 
327 aa  309  5e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1685  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.95 
 
 
342 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0441  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.41 
 
 
379 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0602  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.41 
 
 
379 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.159192  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3035  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.07 
 
 
362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2139  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.85 
 
 
356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0595  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.37 
 
 
334 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.38 
 
 
336 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.42 
 
 
323 aa  306  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.416009  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2382  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.74 
 
 
331 aa  305  6e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407349  hitchhiker  0.00787022 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2121  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.25 
 
 
345 aa  305  7e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147251  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2593  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.27 
 
 
362 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08920  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50 
 
 
331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0563626  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.23 
 
 
336 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2884  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.9 
 
 
341 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.543075  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4288  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.76 
 
 
336 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4425  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.45 
 
 
336 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1350  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.8 
 
 
363 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.505877  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0503  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.57 
 
 
351 aa  303  3.0000000000000004e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0802438  normal  0.0327306 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1237  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.49 
 
 
354 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03169  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.57 
 
 
351 aa  303  4.0000000000000003e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4468  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.89 
 
 
337 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1568  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  49.08 
 
 
340 aa  301  8.000000000000001e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2563  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.06 
 
 
331 aa  301  9e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3431  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.22 
 
 
337 aa  301  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2044  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.65 
 
 
333 aa  300  2e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1683  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.98 
 
 
363 aa  301  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.429769  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0926  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.99 
 
 
366 aa  299  4e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770588  normal  0.575373 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0682  dTDP-glucose 4,6-dehydratase protein  47.92 
 
 
354 aa  299  5e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3383  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.76 
 
 
338 aa  299  5e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2008  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.85 
 
 
366 aa  298  7e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3079  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.68 
 
 
342 aa  298  7e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.544275  unclonable  0.000000030667 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2735  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.22 
 
 
354 aa  297  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1611  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.91 
 
 
350 aa  297  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0939  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.67 
 
 
348 aa  297  2e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0712  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.66 
 
 
354 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1780  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.15 
 
 
355 aa  297  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629198  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13501  dTDP-glucose 4,6-dehydratase rmlB  50.47 
 
 
331 aa  297  2e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.281235  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3861  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.22 
 
 
350 aa  296  3e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.646368 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1124  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.04 
 
 
323 aa  296  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0644506  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0277  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.9 
 
 
352 aa  296  3e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.674919  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13118  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.22 
 
 
350 aa  296  4e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.399683  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0512  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.84 
 
 
339 aa  296  4e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0619  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.7 
 
 
355 aa  296  5e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129356 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3296  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.38 
 
 
332 aa  295  6e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0222371  normal  0.147451 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68170  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  48.66 
 
 
352 aa  295  7e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0640014  decreased coverage  0.00283529 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0253  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.71 
 
 
352 aa  295  8e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.430028  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3843  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.67 
 
 
346 aa  295  8e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0256  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  43.58 
 
 
334 aa  294  1e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00101554  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1282  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.44 
 
 
357 aa  294  1e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.306583  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2799  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.83 
 
 
336 aa  295  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0141685  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5900  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  48.66 
 
 
352 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6652  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.45 
 
 
338 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0795  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  44.12 
 
 
359 aa  293  2e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.91 
 
 
352 aa  294  2e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06090  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.73 
 
 
330 aa  293  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262708  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4115  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.76 
 
 
346 aa  294  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560376  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0939  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.14 
 
 
323 aa  293  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2366  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.8 
 
 
358 aa  293  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.501885  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8193  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.31 
 
 
338 aa  293  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2317  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.65 
 
 
367 aa  293  3e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.150256 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5789  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.26 
 
 
331 aa  293  3e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0435819 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6250  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.15 
 
 
338 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.030258  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6417  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.45 
 
 
338 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15920  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.5 
 
 
351 aa  293  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2336  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.18 
 
 
357 aa  292  5e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.930883  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0824  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  44.41 
 
 
359 aa  292  6e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0878  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.5 
 
 
353 aa  292  6e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2319  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.05 
 
 
353 aa  292  7e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.251448 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3969  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.65 
 
 
353 aa  292  8e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00429727  normal  0.623158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6347  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.69 
 
 
330 aa  291  9e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>