More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2382 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2382  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 
331 aa  678    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407349  hitchhiker  0.00787022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08920  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  78.48 
 
 
331 aa  553  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0563626  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2563  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  75.53 
 
 
331 aa  545  1e-154  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1189  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  75.83 
 
 
331 aa  513  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0549681  normal  0.0736212 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0595  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  71.87 
 
 
334 aa  498  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2679  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  71.69 
 
 
332 aa  498  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0614199  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2411  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  71.69 
 
 
332 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.261098 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1198  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  67.76 
 
 
348 aa  485  1e-136  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02730  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  71.52 
 
 
334 aa  483  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.502125  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3787  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  69.42 
 
 
334 aa  482  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3296  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  72.21 
 
 
332 aa  478  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0222371  normal  0.147451 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1568  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  68.18 
 
 
340 aa  474  1e-133  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1066  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  69.55 
 
 
335 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1222  dTDP-glucose-4,6-dehydratase  67.16 
 
 
348 aa  476  1e-133  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1082  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  69.55 
 
 
335 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455649  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1093  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  69.25 
 
 
335 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5007  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  68.36 
 
 
335 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1365  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  68.79 
 
 
335 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.137011 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0204  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  65.48 
 
 
350 aa  464  1e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1421  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  65.97 
 
 
345 aa  459  9.999999999999999e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.829571  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13501  dTDP-glucose 4,6-dehydratase rmlB  67.67 
 
 
331 aa  456  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.281235  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2044  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  68.39 
 
 
333 aa  449  1e-125  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1055  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  69.07 
 
 
295 aa  394  1e-108  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1177  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.86 
 
 
363 aa  358  8e-98  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.792141 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1863  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.94 
 
 
341 aa  340  2e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0305  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.16 
 
 
342 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4468  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.02 
 
 
337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0734  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.84 
 
 
335 aa  318  6e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.290638  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2404  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.23 
 
 
323 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.6 
 
 
322 aa  311  9e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1117  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.3 
 
 
322 aa  311  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565824  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.6 
 
 
322 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895742 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1337  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.3 
 
 
322 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120656  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1269  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.46 
 
 
323 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.281724  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2639  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.66 
 
 
356 aa  309  4e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.997652  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4148  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.27 
 
 
355 aa  309  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1137  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.3 
 
 
322 aa  309  5e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4310  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.27 
 
 
355 aa  309  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.847685  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1230  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.3 
 
 
322 aa  309  5e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4133  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.27 
 
 
355 aa  309  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4251  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.27 
 
 
355 aa  309  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207369  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03666  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.98 
 
 
355 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1375  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.3 
 
 
322 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4202  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.98 
 
 
355 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03615  hypothetical protein  47.98 
 
 
355 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4188  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.4 
 
 
355 aa  306  3e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0481  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.37 
 
 
355 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.15 
 
 
323 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.416009  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4152  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.4 
 
 
355 aa  305  6e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3994  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.58 
 
 
355 aa  305  6e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.353509  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2097  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.74 
 
 
347 aa  305  7e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1489  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.63 
 
 
354 aa  305  8.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204421 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0494  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.07 
 
 
355 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.774907  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4299  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.11 
 
 
355 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4005  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.11 
 
 
355 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4215  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.11 
 
 
355 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2540  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  46.18 
 
 
359 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6347  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.46 
 
 
330 aa  301  8.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0050  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.21 
 
 
351 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0260  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.77 
 
 
327 aa  301  8.000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5221  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.11 
 
 
355 aa  301  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175839  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1669  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.11 
 
 
357 aa  300  2e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1685  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.55 
 
 
342 aa  299  5e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0516  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  47.41 
 
 
355 aa  299  5e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1318  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  45.04 
 
 
359 aa  298  7e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0342732 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0186  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.41 
 
 
355 aa  298  9e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4029  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.41 
 
 
355 aa  298  9e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4058  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.48 
 
 
358 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2182  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.42 
 
 
354 aa  298  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0103955  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4198  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.82 
 
 
355 aa  296  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1397  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.07 
 
 
358 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1447  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.36 
 
 
329 aa  296  3e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.69 
 
 
336 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0107  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.57 
 
 
367 aa  296  4e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4006  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.55 
 
 
355 aa  296  4e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2232  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.34 
 
 
318 aa  295  8e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0180  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  45.27 
 
 
363 aa  294  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812162  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0243  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  45.27 
 
 
363 aa  294  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3285  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.88 
 
 
353 aa  295  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2890  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  46 
 
 
356 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0957  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.84 
 
 
357 aa  293  2e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.177421 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3030  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  45.61 
 
 
359 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.179842 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3935  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.79 
 
 
358 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.259992 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3465  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.76 
 
 
360 aa  294  2e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.848345  normal  0.362131 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001808  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.11 
 
 
355 aa  292  4e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0186  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.53 
 
 
320 aa  292  5e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1081  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.88 
 
 
357 aa  292  6e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4289  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.26 
 
 
353 aa  292  6e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.337575 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2762  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.82 
 
 
352 aa  292  6e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1398  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  44.57 
 
 
365 aa  291  7e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3680  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.09 
 
 
341 aa  292  7e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00834015  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2900  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  44.6 
 
 
358 aa  291  8e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2317  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.25 
 
 
367 aa  291  8e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.150256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2131  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.77 
 
 
358 aa  291  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1472  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  45.43 
 
 
356 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.239272  normal  0.402949 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2830  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.14 
 
 
367 aa  291  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00106167  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1379  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  44.76 
 
 
359 aa  291  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000705991 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0231  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.1 
 
 
318 aa  290  2e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592131  normal  0.59425 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0701  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.06 
 
 
360 aa  291  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.004629  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2884  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.52 
 
 
341 aa  290  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.543075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>