More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1863 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1863  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
341 aa  698    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2563  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.64 
 
 
331 aa  349  4e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2411  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.77 
 
 
332 aa  347  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.261098 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3787  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.25 
 
 
334 aa  347  2e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1189  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.39 
 
 
331 aa  345  5e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0549681  normal  0.0736212 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08920  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.64 
 
 
331 aa  344  1e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0563626  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2679  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.6 
 
 
332 aa  342  5.999999999999999e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0614199  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0595  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.06 
 
 
334 aa  340  2e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2382  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.94 
 
 
331 aa  340  2e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407349  hitchhiker  0.00787022 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1568  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  52.75 
 
 
340 aa  339  4e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5007  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.15 
 
 
335 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1198  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.55 
 
 
348 aa  335  7e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13501  dTDP-glucose 4,6-dehydratase rmlB  52.6 
 
 
331 aa  334  2e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.281235  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1421  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.86 
 
 
345 aa  330  2e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.829571  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1222  dTDP-glucose-4,6-dehydratase  48.12 
 
 
348 aa  328  6e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02730  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.2 
 
 
334 aa  324  1e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.502125  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1365  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.59 
 
 
335 aa  324  1e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.137011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1093  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.86 
 
 
335 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1066  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.86 
 
 
335 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1082  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.86 
 
 
335 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455649  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0305  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.11 
 
 
342 aa  317  1e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3296  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.48 
 
 
332 aa  317  3e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0222371  normal  0.147451 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0204  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.09 
 
 
350 aa  315  8e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2044  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.73 
 
 
333 aa  309  5e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0494  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  43.79 
 
 
355 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.774907  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1489  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  43.1 
 
 
354 aa  296  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204421 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0481  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  43.79 
 
 
355 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1177  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  43.1 
 
 
363 aa  292  5e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.792141 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2639  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.12 
 
 
356 aa  291  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.997652  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0107  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  43.54 
 
 
367 aa  290  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0050  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.32 
 
 
351 aa  290  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0957  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  43.06 
 
 
357 aa  289  4e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.177421 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1683  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  42.42 
 
 
363 aa  288  9e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.429769  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4468  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  43.06 
 
 
337 aa  288  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2540  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  43.01 
 
 
359 aa  285  9e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2456  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.51 
 
 
353 aa  284  1.0000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4215  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  42.7 
 
 
355 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4005  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  42.7 
 
 
355 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4058  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  42.37 
 
 
358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1375  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  42.69 
 
 
322 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4299  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  42.42 
 
 
355 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1136  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  46.06 
 
 
360 aa  282  5.000000000000001e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0311464 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2182  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  43.06 
 
 
354 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0103955  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2990  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  42.3 
 
 
352 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3465  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  42.03 
 
 
360 aa  282  7.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.848345  normal  0.362131 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1081  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  42.94 
 
 
357 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4251  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  43.26 
 
 
355 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207369  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4133  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  43.26 
 
 
355 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4152  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  41.57 
 
 
355 aa  281  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4148  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  43.26 
 
 
355 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2097  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.58 
 
 
347 aa  281  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4310  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  43.26 
 
 
355 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.847685  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001808  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  43.77 
 
 
355 aa  280  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1269  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  42.22 
 
 
323 aa  280  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.281724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1337  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  42.09 
 
 
322 aa  280  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120656  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1669  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.58 
 
 
357 aa  280  3e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4029  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.13 
 
 
355 aa  280  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  43.24 
 
 
354 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901656 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0186  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.13 
 
 
355 aa  280  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1405  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  42.9 
 
 
354 aa  280  3e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1397  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  42.66 
 
 
358 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03666  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  41.01 
 
 
355 aa  279  4e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4198  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  43.27 
 
 
355 aa  279  4e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0701  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.09 
 
 
360 aa  279  4e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.004629  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03615  hypothetical protein  41.01 
 
 
355 aa  279  4e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4202  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  42.98 
 
 
355 aa  279  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  42.09 
 
 
322 aa  279  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895742 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1117  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  41.92 
 
 
322 aa  279  5e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  42.09 
 
 
322 aa  279  5e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2890  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  41.71 
 
 
356 aa  279  5e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3285  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  41.91 
 
 
353 aa  279  5e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5221  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  41.57 
 
 
355 aa  279  6e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175839  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1399  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  43.1 
 
 
339 aa  278  7e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0294946 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1137  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  41.79 
 
 
322 aa  278  9e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1230  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  41.79 
 
 
322 aa  278  9e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4188  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  40.73 
 
 
355 aa  278  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3167  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  43.06 
 
 
343 aa  278  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3030  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  41.62 
 
 
359 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.179842 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1350  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.13 
 
 
363 aa  278  1e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.505877  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4006  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  42.57 
 
 
355 aa  277  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2653  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  41.9 
 
 
360 aa  277  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0516  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  43.84 
 
 
355 aa  277  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0180  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  42.03 
 
 
363 aa  276  3e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812162  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0243  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  42.03 
 
 
363 aa  276  3e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1401  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  41.83 
 
 
365 aa  276  3e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0069994 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  41.62 
 
 
323 aa  276  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.416009  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1398  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  41.99 
 
 
365 aa  276  5e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.24 
 
 
336 aa  275  6e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3035  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  40.94 
 
 
362 aa  275  6e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1318  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  41.37 
 
 
359 aa  275  6e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0342732 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2719  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  42.29 
 
 
358 aa  275  6e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.719616  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01947  dTDP-glucose 4,6 dehydratase, NAD(P)-binding  41.58 
 
 
361 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01936  hypothetical protein  41.58 
 
 
361 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4128  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  40.73 
 
 
352 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0972084  hitchhiker  0.00000000618238 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3935  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  41.48 
 
 
358 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.259992 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0628  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.83 
 
 
357 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2663  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  41.69 
 
 
362 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1601  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  41.99 
 
 
361 aa  273  3e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2332  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  42.35 
 
 
361 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000326666  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3018  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  41.3 
 
 
371 aa  272  5.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>