More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2563 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2563  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 
331 aa  681    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08920  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  86.1 
 
 
331 aa  605  9.999999999999999e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0563626  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2382  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  75.53 
 
 
331 aa  545  1e-154  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407349  hitchhiker  0.00787022 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0595  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  74.02 
 
 
334 aa  526  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2411  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  71.3 
 
 
332 aa  501  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.261098 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02730  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  72.21 
 
 
334 aa  503  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.502125  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1189  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  71.3 
 
 
331 aa  499  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0549681  normal  0.0736212 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1066  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  71.64 
 
 
335 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2679  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  70.69 
 
 
332 aa  500  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0614199  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1082  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  71.64 
 
 
335 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455649  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1093  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  71.04 
 
 
335 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5007  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  69.85 
 
 
335 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13501  dTDP-glucose 4,6-dehydratase rmlB  71.6 
 
 
331 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.281235  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3787  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  69.42 
 
 
334 aa  488  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1365  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  70.91 
 
 
335 aa  488  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.137011 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1198  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  66.37 
 
 
348 aa  482  1e-135  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1421  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  66.96 
 
 
345 aa  477  1e-133  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.829571  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1222  dTDP-glucose-4,6-dehydratase  65.77 
 
 
348 aa  477  1e-133  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3296  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  68.28 
 
 
332 aa  471  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0222371  normal  0.147451 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1568  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  63.44 
 
 
340 aa  471  1e-132  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2044  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  69.91 
 
 
333 aa  469  1.0000000000000001e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0204  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.91 
 
 
350 aa  459  9.999999999999999e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1055  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  67.81 
 
 
295 aa  398  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1177  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.85 
 
 
363 aa  358  6e-98  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.792141 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1863  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.64 
 
 
341 aa  349  4e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0305  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.47 
 
 
342 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4188  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50 
 
 
355 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03666  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50 
 
 
355 aa  325  9e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03615  hypothetical protein  50 
 
 
355 aa  325  9e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0701  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.88 
 
 
360 aa  324  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.004629  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4251  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.56 
 
 
355 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207369  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4152  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50 
 
 
355 aa  323  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4148  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.56 
 
 
355 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4133  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.56 
 
 
355 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4310  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.56 
 
 
355 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.847685  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4005  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50 
 
 
355 aa  323  4e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0050  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.98 
 
 
351 aa  322  4e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4215  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50 
 
 
355 aa  323  4e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4299  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50 
 
 
355 aa  322  4e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2639  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.15 
 
 
356 aa  322  5e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.997652  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.6 
 
 
322 aa  322  6e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895742 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1117  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.3 
 
 
322 aa  322  7e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.6 
 
 
322 aa  322  8e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1337  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.3 
 
 
322 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120656  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2182  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.56 
 
 
354 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0103955  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1137  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.3 
 
 
322 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1230  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.3 
 
 
322 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4202  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.98 
 
 
355 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1269  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.3 
 
 
323 aa  320  3e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.281724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1375  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.3 
 
 
322 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5221  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50 
 
 
355 aa  318  7.999999999999999e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175839  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0481  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.26 
 
 
355 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0494  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.96 
 
 
355 aa  316  4e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.774907  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00991  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  47.89 
 
 
360 aa  315  6e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2540  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  49.28 
 
 
359 aa  315  6e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4198  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.98 
 
 
355 aa  315  7e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.68 
 
 
323 aa  315  8e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.416009  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4468  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.6 
 
 
337 aa  315  8e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1318  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  48.7 
 
 
359 aa  315  8e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0342732 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1489  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.93 
 
 
354 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204421 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.55 
 
 
354 aa  312  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901656 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1669  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.31 
 
 
357 aa  312  5.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2404  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.23 
 
 
323 aa  311  6.999999999999999e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4006  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.81 
 
 
355 aa  312  6.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0957  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.72 
 
 
357 aa  311  9e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.177421 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0734  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.29 
 
 
335 aa  311  1e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.290638  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0516  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  48.82 
 
 
355 aa  310  2e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4029  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.82 
 
 
355 aa  309  5e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0186  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.82 
 
 
355 aa  309  5e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3994  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.02 
 
 
355 aa  308  6.999999999999999e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.353509  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1685  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.72 
 
 
342 aa  308  8e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0231  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.58 
 
 
318 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592131  normal  0.59425 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0419  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.3 
 
 
350 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0243  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  47.06 
 
 
363 aa  307  1.0000000000000001e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3030  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  48.7 
 
 
359 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.179842 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0180  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  47.06 
 
 
363 aa  307  1.0000000000000001e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812162  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3465  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.65 
 
 
360 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.848345  normal  0.362131 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1350  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.43 
 
 
363 aa  306  3e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.505877  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1398  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  46.51 
 
 
365 aa  306  3e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4289  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.54 
 
 
353 aa  305  6e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.337575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4058  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.96 
 
 
358 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2890  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  48.25 
 
 
356 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1472  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  47.38 
 
 
356 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.239272  normal  0.402949 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3018  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  46 
 
 
371 aa  304  1.0000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3285  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.35 
 
 
353 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3861  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.37 
 
 
350 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.646368 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2830  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.47 
 
 
367 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00106167  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1282  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.12 
 
 
357 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.306583  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6347  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.85 
 
 
330 aa  302  4.0000000000000003e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06090  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.5 
 
 
330 aa  302  5.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262708  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2859  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.87 
 
 
354 aa  301  7.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0536365  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2653  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.37 
 
 
360 aa  301  9e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3188  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  46.41 
 
 
375 aa  301  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1601  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  45.66 
 
 
361 aa  301  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3680  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.47 
 
 
341 aa  301  1e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00834015  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2719  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.26 
 
 
358 aa  301  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.719616  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001808  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.76 
 
 
355 aa  301  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0186  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.15 
 
 
320 aa  301  1e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0590  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.54 
 
 
307 aa  301  1e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2097  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.06 
 
 
347 aa  301  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>