138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2731 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2731  Male sterility domain protein  100 
 
 
392 aa  783    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.885706  hitchhiker  0.00797999 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2676  hypothetical protein  38.46 
 
 
373 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0511814 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2871  Male sterility domain protein  42.23 
 
 
381 aa  225  9e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.64 
 
 
383 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2778  male sterility domain protein  41.94 
 
 
383 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1667  hypothetical protein  32.57 
 
 
358 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0262372  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  31.22 
 
 
671 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4728  hypothetical protein  31.69 
 
 
354 aa  146  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0491  short chain dehydrogenase  31.62 
 
 
668 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0442129 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  30.96 
 
 
664 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  28.65 
 
 
665 aa  140  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4094  Male sterility domain protein  30.3 
 
 
359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.796216  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  25.83 
 
 
661 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1750  Male sterility domain protein  30.4 
 
 
642 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  27.07 
 
 
659 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  30.87 
 
 
671 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1104  Male sterility domain protein  28.85 
 
 
701 aa  104  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972313  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1327  Male sterility domain protein  27.95 
 
 
356 aa  103  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38219  normal  0.51823 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  31.06 
 
 
937 aa  102  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1527  short chain dehydrogenase  31.25 
 
 
653 aa  99  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3608  Male sterility domain protein  27.27 
 
 
637 aa  96.7  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.619777  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0364  Male sterility domain protein  28.62 
 
 
493 aa  91.3  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3912  thioester reductase domain-containing protein  24.74 
 
 
505 aa  90.1  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501975  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4147  hypothetical protein  29 
 
 
366 aa  89.7  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497178  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2104  thioester reductase domain-containing protein  29.31 
 
 
523 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3013  hypothetical protein  29.23 
 
 
366 aa  87  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0103839  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13425  short chain dehydrogenase  27.87 
 
 
650 aa  87  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4933  Male sterility domain protein  32.14 
 
 
437 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  0.407936 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2917  short chain dehydrogenase  27.51 
 
 
665 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0126943  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2522  Male sterility domain protein  28.46 
 
 
410 aa  81.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2595  thioester reductase  27.6 
 
 
506 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.410224  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3148  Male sterility domain protein  29.15 
 
 
354 aa  77.4  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  22.37 
 
 
1454 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7306  peptide synthetase  27.71 
 
 
1506 aa  70.1  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.370247  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5128  Male sterility domain protein  27.27 
 
 
358 aa  69.7  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  26.06 
 
 
2376 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  25 
 
 
2374 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3702  thioester reductase domain protein  23.77 
 
 
398 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3755  thioester reductase domain protein  25.17 
 
 
398 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.801599 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  23.93 
 
 
1270 aa  65.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1805  amino acid adenylation domain-containing protein  24.74 
 
 
1413 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.323791  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2551  hypothetical protein  30.86 
 
 
351 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0234245  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4292  amino acid adenylation domain-containing protein  29.17 
 
 
1188 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375384  normal  0.670751 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4973  amino acid adenylation  29.17 
 
 
1188 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432296  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3187  amino acid adenylation domain-containing protein  29.17 
 
 
1188 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4890  amino acid adenylation domain-containing protein  29.53 
 
 
1500 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.365672 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.08 
 
 
301 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5015  Male sterility domain-containing protein  25.08 
 
 
667 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435156  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  28.52 
 
 
2113 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  24.83 
 
 
1067 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.67 
 
 
326 aa  60.5  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0127971 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  26.39 
 
 
1449 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4416  amino acid adenylation domain-containing protein  26.21 
 
 
1485 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.52 
 
 
299 aa  57.8  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2093  polyketide synthase, putative  26.37 
 
 
4048 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7636  AMP-dependent synthetase and ligase  25 
 
 
1444 aa  57  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3229  Male sterility-like  28.93 
 
 
351 aa  56.6  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0530  putative polyketide synthase PksM  26.04 
 
 
4122 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05610  aminoadipate reductase large subunit (Eurofung)  26.51 
 
 
1421 aa  55.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0476531 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1856  polyketide non-ribosomal peptide synthase  26.04 
 
 
4123 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2161  hypothetical protein  25.69 
 
 
4098 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0434  polyketide synthase  26.04 
 
 
4157 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0845  hypothetical protein  25.69 
 
 
4101 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.59 
 
 
352 aa  55.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1451.1  hypothetical protein  25.69 
 
 
4580 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5808  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.04 
 
 
330 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.44 
 
 
296 aa  55.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  23.53 
 
 
1498 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3516  amino acid adenylation domain-containing protein  25.09 
 
 
995 aa  54.7  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5457  ornithine acetyl transferase inhibitor  25.08 
 
 
1149 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.28 
 
 
280 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3227  hypothetical protein  20.26 
 
 
618 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0125277  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 
680 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2086  linear gramicidin synthetase subunit D  25.19 
 
 
1002 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0368  amino acid adenylation domain-containing protein  21.68 
 
 
1194 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2553  dehydrogenase domain-containing protein  26.61 
 
 
369 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118589  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3396  putative non-ribosomal peptide synthetase  21.59 
 
 
809 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
336 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.94 
 
 
336 aa  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111318  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2186  non-ribosomal peptide synthase MxaA  30.98 
 
 
1436 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026407  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2925  hypothetical protein  20.26 
 
 
618 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142893  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2045  mxaA domain protein  21.02 
 
 
618 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3211  mxaA domain protein  21.15 
 
 
617 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5388  amino acid adenylation domain-containing protein  22.71 
 
 
997 aa  49.7  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82388  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47104  non ribosomal peptide synthase  21.63 
 
 
1367 aa  49.7  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08105  NRPS-like enzyme, putative (JCVI)  22.87 
 
 
1077 aa  49.7  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.250944 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3235  mxaA domain protein  20.7 
 
 
618 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00294865  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1800  oxidoreductase Rmd  30.48 
 
 
298 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0661573 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2969  nucleotide sugar epimerase  20.26 
 
 
618 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.61 
 
 
324 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.87 
 
 
320 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5287  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.71 
 
 
350 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.73 
 
 
327 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0855  nucleotide sugar epimerase  20.27 
 
 
618 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.625581  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.44 
 
 
298 aa  47  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.9 
 
 
309 aa  47  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1067  Male sterility-like protein  24.14 
 
 
685 aa  47.4  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.87 
 
 
331 aa  47.4  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.53 
 
 
327 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.3 
 
 
309 aa  47  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.760567  normal  0.885082 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>