224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5015 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5015  Male sterility domain-containing protein  100 
 
 		 667 aa  1295    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435156  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7117  putative NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  46.47 
 
 		 580 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0187299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4650  male sterility domain protein  50.28 
 
 		 353 aa  312  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458104  normal  0.580556 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4497  hypothetical protein  32.2 
 
 		 369 aa  165  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.209765  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3842  hypothetical protein  29.91 
 
 		 365 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1929  hypothetical protein  29.8 
 
 		 365 aa  150  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3829  hypothetical protein  29.23 
 
 		 362 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3193  mxaA domain protein  25.64 
 
 		 618 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2045  mxaA domain protein  27.06 
 
 		 618 aa  130  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3032  hypothetical protein  27.7 
 
 		 354 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638017  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3227  hypothetical protein  23.61 
 
 		 618 aa  128  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0125277  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3235  mxaA domain protein  27.06 
 
 		 618 aa  126  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00294865  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0896  MxaA domain-containing protein  23.04 
 
 		 627 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0954  MxaA domain-containing protein  23.04 
 
 		 627 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0855  nucleotide sugar epimerase  26.34 
 
 		 618 aa  124  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.625581  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2925  hypothetical protein  26.61 
 
 		 618 aa  124  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142893  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2969  nucleotide sugar epimerase  25.05 
 
 		 618 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3211  mxaA domain protein  25.05 
 
 		 617 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4094  Male sterility domain protein  30 
 
 		 359 aa  94.7  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.796216  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1667  hypothetical protein  29.18 
 
 		 358 aa  88.6  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0262372  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4728  hypothetical protein  30.3 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  26.69 
 
 		 661 aa  81.3  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  32.11 
 
 		 937 aa  78.6  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1327  Male sterility domain protein  29.13 
 
 		 356 aa  73.6  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38219  normal  0.51823 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2551  hypothetical protein  29.86 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0234245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.78 
 
 		 383 aa  72.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2778  male sterility domain protein  35.71 
 
 		 383 aa  72  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1750  Male sterility domain protein  30.63 
 
 		 642 aa  72  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  28.53 
 
 		 671 aa  71.6  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2871  Male sterility domain protein  35.71 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  27.81 
 
 		 664 aa  70.1  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3013  hypothetical protein  26.83 
 
 		 366 aa  69.3  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0103839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4147  hypothetical protein  28.38 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.68 
 
 		 330 aa  67  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  27.3 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  26.32 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  25.07 
 
 		 329 aa  63.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.25 
 
 		 346 aa  63.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178304  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2917  short chain dehydrogenase  30.74 
 
 		 665 aa  62.4  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0126943  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.79 
 
 		 330 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0529  dihydrokaempferol 4-reductase  26.57 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  25.14 
 
 		 665 aa  61.2  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  26.42 
 
 		 659 aa  60.8  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2676  hypothetical protein  31.84 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0511814 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3148  Male sterility domain protein  28.32 
 
 		 354 aa  60.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2731  Male sterility domain protein  28.32 
 
 		 392 aa  60.1  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.885706  hitchhiker  0.00797999 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.21 
 
 		 333 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.18 
 
 		 355 aa  60.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0884  hopanoid-associated sugar epimerase  25.41 
 
 		 329 aa  59.7  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000222195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5128  Male sterility domain protein  30.35 
 
 		 358 aa  59.3  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2522  Male sterility domain protein  28.87 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  23.71 
 
 		 329 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4933  Male sterility domain protein  32.37 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  0.407936 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3031  O-antigen biosynthetic gene WbjF  27.11 
 
 		 320 aa  59.3  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  23.71 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.03 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3608  Male sterility domain protein  29.9 
 
 		 637 aa  58.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.619777  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.21 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3361  hopanoid-associated sugar epimerase  24.86 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  26.33 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.87 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000297127  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0864  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.2 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.76 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3229  Male sterility-like  29.74 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.18 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44311  hypothetical protein  29.8 
 
 		 385 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1104  Male sterility domain protein  27.65 
 
 		 701 aa  55.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972313  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.76 
 
 		 329 aa  56.2  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0364  Male sterility domain protein  32.2 
 
 		 493 aa  56.2  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5388  amino acid adenylation domain-containing protein  27.03 
 
 		 997 aa  55.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3771  hypothetical protein  29.34 
 
 		 385 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  25.5 
 
 		 340 aa  54.7  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 		 302 aa  54.3  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  26.28 
 
 		 329 aa  53.5  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  37.96 
 
 		 340 aa  53.9  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3239  hopanoid-associated sugar epimerase  26.73 
 
 		 332 aa  53.5  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109011 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.99 
 
 		 334 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.43 
 
 		 320 aa  53.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3175  hypothetical protein  36.63 
 
 		 260 aa  53.5  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567712  normal  0.0913717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  30.32 
 
 		 1498 aa  53.5  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  24.66 
 
 		 340 aa  52  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 		 260 aa  52.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.27 
 
 		 332 aa  52.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527428  normal  0.235169 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.19 
 
 		 355 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.61 
 
 		 328 aa  51.6  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 		 260 aa  51.6  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5601  oxidoreductase domain protein  29.17 
 
 		 746 aa  51.6  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13818  dTDP-glucose-4,6-dehydratase  27 
 
 		 326 aa  51.2  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.26 
 
 		 334 aa  50.8  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3212  hypothetical protein  25.69 
 
 		 374 aa  50.8  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0204352 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.34 
 
 		 333 aa  50.8  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.956027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  35.92 
 
 		 324 aa  50.4  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6351  hopanoid-associated sugar epimerase  28.24 
 
 		 345 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  22.22 
 
 		 338 aa  50.1  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.32 
 
 		 332 aa  50.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.19855 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1781  hopanoid-associated sugar epimerase  25.84 
 
 		 329 aa  50.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.889296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2122  hypothetical protein  25.84 
 
 		 329 aa  50.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.744824  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23450  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  25.09 
 
 		 317 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292756  hitchhiker  0.00536132 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0491  short chain dehydrogenase  25.27 
 
 		 668 aa  50.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>