More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2917 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2917  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 665 aa  1357    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0126943  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  48.58 
 
 		 661 aa  644    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  58.17 
 
 		 659 aa  770    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0491  short chain dehydrogenase  47.92 
 
 		 668 aa  624  1e-177  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442129 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  46.57 
 
 		 665 aa  615  1e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  47.31 
 
 		 664 aa  616  1e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  46.89 
 
 		 671 aa  612  9.999999999999999e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3608  Male sterility domain protein  48.29 
 
 		 637 aa  552  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.619777  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  48.36 
 
 		 671 aa  544  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1527  short chain dehydrogenase  46.54 
 
 		 653 aa  520  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13425  short chain dehydrogenase  44.62 
 
 		 650 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1750  Male sterility domain protein  45.62 
 
 		 642 aa  504  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1104  Male sterility domain protein  43.71 
 
 		 701 aa  468  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972313  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11576  fatty acyl-CoA reductase  47.32 
 
 		 341 aa  277  5e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.79 
 
 		 292 aa  276  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0182353  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.96 
 
 		 305 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623354  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.74 
 
 		 295 aa  265  2e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.366872  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1299  fatty acyl-CoA reductase protein  44.49 
 
 		 295 aa  254  4.0000000000000004e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0026  short chain dehydrogenase  50.21 
 
 		 319 aa  217  7e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122051  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0944  short chain dehydrogenase  51.77 
 
 		 294 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0002  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.12 
 
 		 273 aa  207  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.690765 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0726  short chain dehydrogenase  45.23 
 
 		 291 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.352329 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0732  short chain dehydrogenase  45.23 
 
 		 291 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.403449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0746  short chain dehydrogenase  45.23 
 
 		 291 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.095749 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10558  short chain dehydrogenase  46.67 
 
 		 294 aa  188  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0196339 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.44 
 
 		 280 aa  183  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3466  short chain dehydrogenase  44.21 
 
 		 294 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.241299 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0860  short chain dehydrogenase  43.72 
 
 		 291 aa  173  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.73 
 
 		 275 aa  171  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0854  short chain dehydrogenase  43.29 
 
 		 291 aa  171  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0871  short chain dehydrogenase  43.29 
 
 		 291 aa  171  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4094  Male sterility domain protein  31.99 
 
 		 359 aa  161  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.796216  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1327  Male sterility domain protein  32.71 
 
 		 356 aa  154  5e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38219  normal  0.51823 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1667  hypothetical protein  33.6 
 
 		 358 aa  150  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0262372  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4728  hypothetical protein  30.11 
 
 		 354 aa  147  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 264 aa  137  7.000000000000001e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6897  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 		 290 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.98 
 
 		 258 aa  123  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2778  male sterility domain protein  30.77 
 
 		 383 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2871  Male sterility domain protein  30.77 
 
 		 381 aa  122  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.09 
 
 		 383 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11068  oxidoreductase  34.74 
 
 		 301 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.205536 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2676  hypothetical protein  30.34 
 
 		 373 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0511814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2595  thioester reductase  32.62 
 
 		 506 aa  114  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.410224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.77 
 
 		 342 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 		 339 aa  112  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.54 
 
 		 264 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.12 
 
 		 264 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.12 
 
 		 264 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  31.12 
 
 		 264 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0364  Male sterility domain protein  31.99 
 
 		 493 aa  110  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.12 
 
 		 264 aa  110  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 347 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 		 260 aa  109  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3685  short chain dehydrogenase  31.69 
 
 		 346 aa  109  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3912  thioester reductase domain-containing protein  29.93 
 
 		 505 aa  109  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  31.12 
 
 		 264 aa  110  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  31.12 
 
 		 264 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.17 
 
 		 249 aa  108  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 		 264 aa  108  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0992  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  30.83 
 
 		 264 aa  107  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.12 
 
 		 264 aa  107  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0726  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.1 
 
 		 366 aa  107  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.642345  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1451.1  hypothetical protein  31.05 
 
 		 4580 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0434  polyketide synthase  31.13 
 
 		 4157 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1856  polyketide non-ribosomal peptide synthase  31.13 
 
 		 4123 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0845  hypothetical protein  30.79 
 
 		 4101 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2161  hypothetical protein  31.05 
 
 		 4098 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  32.48 
 
 		 242 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2093  polyketide synthase, putative  31.13 
 
 		 4048 aa  105  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0530  putative polyketide synthase PksM  31.05 
 
 		 4122 aa  106  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4244  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  30.42 
 
 		 264 aa  106  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0353  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.27 
 
 		 262 aa  105  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 		 261 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0265  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.13 
 
 		 248 aa  105  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  32.48 
 
 		 242 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 		 317 aa  104  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00194851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.78 
 
 		 281 aa  104  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.39 
 
 		 244 aa  103  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1902  short chain dehydrogenase  37.36 
 
 		 269 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0327948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  32.1 
 
 		 937 aa  103  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.38 
 
 		 267 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.33 
 
 		 254 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.35 
 
 		 238 aa  102  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 		 257 aa  102  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.76225  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.35 
 
 		 239 aa  101  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2536  short chain dehydrogenase  29.91 
 
 		 241 aa  101  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.08 
 
 		 262 aa  101  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.35 
 
 		 239 aa  100  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.35 
 
 		 239 aa  100  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.35 
 
 		 239 aa  100  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.35 
 
 		 239 aa  100  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.35 
 
 		 242 aa  100  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.35 
 
 		 242 aa  100  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.35 
 
 		 242 aa  100  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.35 
 
 		 242 aa  100  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.35 
 
 		 242 aa  100  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 		 245 aa  100  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.553727  normal  0.0273902 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.68 
 
 		 247 aa  99.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3702  thioester reductase domain protein  29.39 
 
 		 398 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>