More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3526 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 665 aa  1379    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  84.5 
 
 		 671 aa  1179    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  51.2 
 
 		 659 aa  692    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  59.1 
 
 		 661 aa  847    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  81.35 
 
 		 664 aa  1135    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0491  short chain dehydrogenase  80.65 
 
 		 668 aa  1124    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442129 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2917  short chain dehydrogenase  46.57 
 
 		 665 aa  605  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0126943  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  40.83 
 
 		 671 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3608  Male sterility domain protein  40.28 
 
 		 637 aa  450  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.619777  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1527  short chain dehydrogenase  41.73 
 
 		 653 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1104  Male sterility domain protein  41.18 
 
 		 701 aa  431  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972313  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1750  Male sterility domain protein  40.03 
 
 		 642 aa  429  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13425  short chain dehydrogenase  39.38 
 
 		 650 aa  415  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.9 
 
 		 292 aa  272  1e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0182353  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11576  fatty acyl-CoA reductase  43.47 
 
 		 341 aa  247  6e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.98 
 
 		 295 aa  246  9.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.366872  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1299  fatty acyl-CoA reductase protein  45.56 
 
 		 295 aa  237  4e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.71 
 
 		 305 aa  237  4e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623354  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0732  short chain dehydrogenase  44.96 
 
 		 291 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.403449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0746  short chain dehydrogenase  44.96 
 
 		 291 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.095749 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0726  short chain dehydrogenase  44.96 
 
 		 291 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.352329 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0944  short chain dehydrogenase  45.67 
 
 		 294 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0026  short chain dehydrogenase  43.7 
 
 		 319 aa  212  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122051  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0860  short chain dehydrogenase  44 
 
 		 291 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10558  short chain dehydrogenase  43.8 
 
 		 294 aa  196  9e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0196339 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0854  short chain dehydrogenase  44 
 
 		 291 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0871  short chain dehydrogenase  44 
 
 		 291 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3466  short chain dehydrogenase  44.4 
 
 		 294 aa  188  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.241299 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0002  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 		 273 aa  186  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.690765 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4094  Male sterility domain protein  32.6 
 
 		 359 aa  179  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.796216  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1667  hypothetical protein  34.05 
 
 		 358 aa  175  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0262372  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 		 275 aa  174  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.24 
 
 		 280 aa  174  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2676  hypothetical protein  31.18 
 
 		 373 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0511814 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1327  Male sterility domain protein  30.98 
 
 		 356 aa  162  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38219  normal  0.51823 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2871  Male sterility domain protein  33.33 
 
 		 381 aa  158  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 383 aa  158  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2778  male sterility domain protein  33.06 
 
 		 383 aa  157  8e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4728  hypothetical protein  29.16 
 
 		 354 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2731  Male sterility domain protein  28.65 
 
 		 392 aa  140  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.885706  hitchhiker  0.00797999 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  25.43 
 
 		 1270 aa  140  7e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6897  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.35 
 
 		 290 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.24 
 
 		 347 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2595  thioester reductase  29.95 
 
 		 506 aa  120  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.410224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.06 
 
 		 254 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3912  thioester reductase domain-containing protein  27.65 
 
 		 505 aa  113  9e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501975  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.01 
 
 		 251 aa  113  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 		 342 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  32.87 
 
 		 236 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.5 
 
 		 244 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 		 247 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.03 
 
 		 339 aa  112  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 317 aa  111  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00194851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 		 267 aa  111  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.27 
 
 		 272 aa  110  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0726  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 		 366 aa  110  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.642345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  31.34 
 
 		 242 aa  110  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  31.34 
 
 		 242 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2522  Male sterility domain protein  29.73 
 
 		 410 aa  109  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0031  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 		 340 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  31.18 
 
 		 937 aa  108  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 		 264 aa  108  4e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 		 239 aa  107  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.65 
 
 		 249 aa  106  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.55 
 
 		 340 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0147442  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 		 264 aa  106  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 		 286 aa  106  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.5 
 
 		 239 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.5 
 
 		 239 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0093  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.87 
 
 		 266 aa  105  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.23 
 
 		 279 aa  105  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.55 
 
 		 340 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2536  short chain dehydrogenase  33.51 
 
 		 241 aa  105  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 		 252 aa  104  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0348  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.17 
 
 		 244 aa  104  5e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 		 255 aa  104  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.05 
 
 		 278 aa  104  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.28 
 
 		 230 aa  103  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 		 344 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.753226  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.19 
 
 		 317 aa  103  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 		 241 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.79 
 
 		 256 aa  103  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3571  short chain dehydrogenase  29.75 
 
 		 256 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0445953  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  25.07 
 
 		 1454 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.78 
 
 		 354 aa  102  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.718494 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.28 
 
 		 264 aa  101  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  32.28 
 
 		 264 aa  101  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.47 
 
 		 255 aa  101  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.89 
 
 		 272 aa  101  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.28 
 
 		 264 aa  101  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 		 248 aa  101  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.574158  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  32.28 
 
 		 264 aa  101  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  33.16 
 
 		 264 aa  101  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.78 
 
 		 257 aa  101  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.76225  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.03 
 
 		 351 aa  101  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 244 aa  101  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1596  short chain dehydrogenase  37.64 
 
 		 245 aa  101  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.184756 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  28.35 
 
 		 2374 aa  100  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11068  oxidoreductase  30.37 
 
 		 301 aa  100  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.205536 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 		 260 aa  100  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>