More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0871 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_0860  short chain dehydrogenase  99.31 
 
 		 291 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0854  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 291 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0871  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 291 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3466  short chain dehydrogenase  71.68 
 
 		 294 aa  404  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.241299 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10558  short chain dehydrogenase  62.81 
 
 		 294 aa  343  1e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0196339 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0026  short chain dehydrogenase  64.73 
 
 		 319 aa  334  1e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122051  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0944  short chain dehydrogenase  62.02 
 
 		 294 aa  330  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0732  short chain dehydrogenase  61.37 
 
 		 291 aa  324  1e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.403449  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0726  short chain dehydrogenase  61.37 
 
 		 291 aa  324  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.352329 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0746  short chain dehydrogenase  61.37 
 
 		 291 aa  324  1e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.095749 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.99 
 
 		 275 aa  217  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  44.36 
 
 		 661 aa  210  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  44.4 
 
 		 671 aa  198  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  44 
 
 		 665 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.36 
 
 		 305 aa  187  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623354  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  44.35 
 
 		 664 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.25 
 
 		 292 aa  186  5e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0182353  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0491  short chain dehydrogenase  42.16 
 
 		 668 aa  185  7e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442129 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.02 
 
 		 295 aa  185  7e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.366872  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  43.78 
 
 		 659 aa  185  8e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1299  fatty acyl-CoA reductase protein  46.46 
 
 		 295 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2917  short chain dehydrogenase  43.29 
 
 		 665 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0126943  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0002  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.53 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.690765 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.2 
 
 		 280 aa  156  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11576  fatty acyl-CoA reductase  41.11 
 
 		 341 aa  155  7e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3608  Male sterility domain protein  44.34 
 
 		 637 aa  152  7e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.619777  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13425  short chain dehydrogenase  36.63 
 
 		 650 aa  149  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1750  Male sterility domain protein  40 
 
 		 642 aa  145  8.000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1527  short chain dehydrogenase  42.67 
 
 		 653 aa  142  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  40.52 
 
 		 671 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1104  Male sterility domain protein  41.22 
 
 		 701 aa  128  9.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972313  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6897  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 290 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2596  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 244 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.73 
 
 		 265 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.87 
 
 		 230 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.83 
 
 		 264 aa  96.7  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1497  NAD/NADP dependent oxidoreductase  39.53 
 
 		 246 aa  96.3  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.445063  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 		 258 aa  95.9  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5032  gluconate 5-dehydrogenase  36.08 
 
 		 252 aa  95.5  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.47 
 
 		 264 aa  94.7  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 		 344 aa  94.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.753226  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11068  oxidoreductase  32.65 
 
 		 301 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.205536 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6091  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.06 
 
 		 260 aa  93.2  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50583  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.99 
 
 		 262 aa  93.2  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133593  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.12 
 
 		 238 aa  92.8  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 		 263 aa  93.2  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.170949  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 		 267 aa  92.8  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9124  gluconate 5-dehydrogenase  33.67 
 
 		 256 aa  92.8  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.991877  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 		 266 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.49 
 
 		 239 aa  92.4  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420603  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 		 262 aa  92  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 		 253 aa  92  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 		 244 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.82 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 242 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.49 
 
 		 251 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 		 246 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0420142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200417  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.574158  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.95 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.99 
 
 		 241 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.69 
 
 		 247 aa  91.3  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.269971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  33.5 
 
 		 544 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0353  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 		 262 aa  90.5  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 		 256 aa  90.5  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.226851  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 250 aa  90.9  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4511  gluconate 5-dehydrogenase  33.67 
 
 		 254 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.65 
 
 		 239 aa  90.5  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.175599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4043  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 		 254 aa  89.7  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 		 257 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01927  putative oxidoreductase  35.23 
 
 		 252 aa  90.1  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.160278  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 242 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 		 247 aa  90.1  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 		 347 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6414  gluconate 5-dehydrogenase  34.18 
 
 		 254 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118789  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.22 
 
 		 253 aa  89.4  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260507  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 		 257 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 		 264 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.06 
 
 		 253 aa  89.4  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.129193  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.93 
 
 		 244 aa  89.4  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000989308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 		 224 aa  89.4  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 		 248 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332665  normal  0.273672 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0925  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.73 
 
 		 251 aa  89  9e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.568448  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 		 243 aa  89  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000379715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.229091  hitchhiker  0.0024535 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 253 aa  88.2  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00235361 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.61 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.400321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.73 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1904  gluconate 5-dehydrogenase  29.85 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000312184  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7167  short chain dehydrogenase  34.02 
 
 		 249 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0726  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 		 366 aa  87.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.642345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7068  SDR family dehydrogenase/reductase  35.57 
 
 		 257 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3473  short chain dehydrogenase  31.07 
 
 		 259 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.639698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>