More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1667 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1667  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  717    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0262372  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4728  hypothetical protein  53.63 
 
 		 354 aa  354  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1327  Male sterility domain protein  53.2 
 
 		 356 aa  326  3e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38219  normal  0.51823 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4094  Male sterility domain protein  45.96 
 
 		 359 aa  279  5e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.796216  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2676  hypothetical protein  42.12 
 
 		 373 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0511814 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.12 
 
 		 383 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2871  Male sterility domain protein  42.12 
 
 		 381 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  39.95 
 
 		 671 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2778  male sterility domain protein  41.83 
 
 		 383 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3608  Male sterility domain protein  35.91 
 
 		 637 aa  178  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.619777  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  34.05 
 
 		 665 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  32.98 
 
 		 671 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1527  short chain dehydrogenase  37.73 
 
 		 653 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0491  short chain dehydrogenase  34.58 
 
 		 668 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442129 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  33.06 
 
 		 664 aa  166  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1104  Male sterility domain protein  37.74 
 
 		 701 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972313  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4933  Male sterility domain protein  38.84 
 
 		 437 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  0.407936 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  34.06 
 
 		 659 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2731  Male sterility domain protein  32.57 
 
 		 392 aa  152  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.885706  hitchhiker  0.00797999 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  30.41 
 
 		 661 aa  150  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1750  Male sterility domain protein  33.79 
 
 		 642 aa  149  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2917  short chain dehydrogenase  33.24 
 
 		 665 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0126943  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2522  Male sterility domain protein  37.16 
 
 		 410 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13425  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 650 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0364  Male sterility domain protein  34.29 
 
 		 493 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  34.56 
 
 		 937 aa  111  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3013  hypothetical protein  36.08 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0103839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4147  hypothetical protein  37.86 
 
 		 366 aa  110  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3148  Male sterility domain protein  35.78 
 
 		 354 aa  106  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3912  thioester reductase domain-containing protein  28.78 
 
 		 505 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501975  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08105  NRPS-like enzyme, putative (JCVI)  30.27 
 
 		 1077 aa  99  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.250944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2232  amino acid adenylation domain protein  32.75 
 
 		 1395 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.214627 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2045  mxaA domain protein  24.15 
 
 		 618 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2595  thioester reductase  28.28 
 
 		 506 aa  93.2  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.410224  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3227  hypothetical protein  24.15 
 
 		 618 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0125277  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2104  thioester reductase domain-containing protein  26.65 
 
 		 523 aa  90.5  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  33.68 
 
 		 2107 aa  90.5  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  28.67 
 
 		 1454 aa  89.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2925  hypothetical protein  24.46 
 
 		 618 aa  90.1  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142893  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5015  Male sterility domain-containing protein  29.46 
 
 		 667 aa  89.7  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435156  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3211  mxaA domain protein  24.46 
 
 		 617 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3235  mxaA domain protein  23.94 
 
 		 618 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00294865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2969  nucleotide sugar epimerase  24.46 
 
 		 618 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2551  hypothetical protein  32.72 
 
 		 351 aa  89  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0234245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3755  thioester reductase domain protein  29.86 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.801599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3702  thioester reductase domain protein  29.86 
 
 		 398 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3193  mxaA domain protein  23.64 
 
 		 618 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0855  nucleotide sugar epimerase  23.64 
 
 		 618 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.625581  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0896  MxaA domain-containing protein  23.64 
 
 		 627 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0954  MxaA domain-containing protein  23.64 
 
 		 627 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  28.73 
 
 		 2374 aa  84.7  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4497  hypothetical protein  27.33 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.209765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  30.47 
 
 		 1498 aa  83.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4650  male sterility domain protein  27.17 
 
 		 353 aa  82.8  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458104  normal  0.580556 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5128  Male sterility domain protein  33.07 
 
 		 358 aa  82.8  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2092  AMP-dependent synthetase and ligase  32.67 
 
 		 1406 aa  82  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261871  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  30.27 
 
 		 1449 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5489  amino acid adenylation domain-containing protein  32.85 
 
 		 2439 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934581 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  31.43 
 
 		 1270 aa  80.9  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7636  AMP-dependent synthetase and ligase  34.29 
 
 		 1444 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3829  hypothetical protein  26.29 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  28.62 
 
 		 1067 aa  76.6  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2186  non-ribosomal peptide synthase MxaA  30.03 
 
 		 1436 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1067  Male sterility-like protein  32.5 
 
 		 685 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  32.02 
 
 		 2113 aa  74.3  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1856  polyketide non-ribosomal peptide synthase  27.67 
 
 		 4123 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4890  amino acid adenylation domain-containing protein  32.23 
 
 		 1500 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.365672 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2161  hypothetical protein  27.67 
 
 		 4098 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0434  polyketide synthase  27.67 
 
 		 4157 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1451.1  hypothetical protein  27.67 
 
 		 4580 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0845  hypothetical protein  27.67 
 
 		 4101 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0530  putative polyketide synthase PksM  27.67 
 
 		 4122 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11140  putative nonribosomal peptide synthetase  26.06 
 
 		 991 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4416  amino acid adenylation domain-containing protein  32.23 
 
 		 1485 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  28.69 
 
 		 2376 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.05 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4292  amino acid adenylation domain-containing protein  36.89 
 
 		 1188 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375384  normal  0.670751 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4973  amino acid adenylation  30.77 
 
 		 1188 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432296  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5388  amino acid adenylation domain-containing protein  25.76 
 
 		 997 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3187  amino acid adenylation domain-containing protein  30.77 
 
 		 1188 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47104  non ribosomal peptide synthase  28.97 
 
 		 1367 aa  70.1  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1023  amino acid adenylation domain-containing protein  26.08 
 
 		 992 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1805  amino acid adenylation domain-containing protein  31.03 
 
 		 1413 aa  69.3  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.323791  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54920  putative non-ribosomal peptide synthetase  30.85 
 
 		 1487 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0523722  unclonable  4.46113e-20 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.18 
 
 		 308 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05610  aminoadipate reductase large subunit (Eurofung)  30.14 
 
 		 1421 aa  68.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0476531 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2093  polyketide synthase, putative  27.4 
 
 		 4048 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.53 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0280203  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00170  aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase, putative  30.41 
 
 		 1409 aa  67.4  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.682323  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.33 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.537903 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2553  dehydrogenase domain-containing protein  28.4 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  33.51 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3229  Male sterility-like  32.77 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3396  putative non-ribosomal peptide synthetase  28.5 
 
 		 809 aa  64.3  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0351849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2271  thioester reductase  29.41 
 
 		 1174 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2318  thioester reductase domain-containing protein  29.41 
 
 		 1174 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.662408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.75 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2310  thioester reductase domain-containing protein  29.08 
 
 		 1174 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.992099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>