More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3396 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3396  putative non-ribosomal peptide synthetase  100 
 
 		 809 aa  1660    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1805  amino acid adenylation domain-containing protein  35.45 
 
 		 1413 aa  394  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.323791  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  31.65 
 
 		 1454 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  30.6 
 
 		 1498 aa  277  6e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  29.54 
 
 		 1449 aa  265  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4416  amino acid adenylation domain-containing protein  30.25 
 
 		 1485 aa  265  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4890  amino acid adenylation domain-containing protein  29.69 
 
 		 1500 aa  262  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.365672 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7306  peptide synthetase  29.26 
 
 		 1506 aa  252  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.370247  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2186  non-ribosomal peptide synthase MxaA  28.94 
 
 		 1436 aa  246  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1023  amino acid adenylation domain-containing protein  29.06 
 
 		 992 aa  232  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4519  amino acid adenylation domain-containing protein  32.09 
 
 		 1478 aa  229  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.669 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11140  putative nonribosomal peptide synthetase  29.32 
 
 		 991 aa  227  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5489  amino acid adenylation domain-containing protein  27.39 
 
 		 2439 aa  226  9e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934581 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  27.85 
 
 		 1270 aa  224  4.9999999999999996e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5011  amino acid adenylation:thioester reductase  27.64 
 
 		 1148 aa  224  7e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2109  nonribosomal peptide synthetase  27.37 
 
 		 1145 aa  220  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4973  amino acid adenylation  28.33 
 
 		 1188 aa  220  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432296  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3187  amino acid adenylation domain-containing protein  28.33 
 
 		 1188 aa  220  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4292  amino acid adenylation domain-containing protein  28.9 
 
 		 1188 aa  218  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375384  normal  0.670751 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00170  aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase, putative  26.61 
 
 		 1409 aa  216  9.999999999999999e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.682323  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68020  L-aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase, large subunit  26.71 
 
 		 1394 aa  214  4.9999999999999996e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224506  normal  0.0608631 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2017  amino acid adenylation domain protein  39.28 
 
 		 1419 aa  214  5.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0369158  normal  0.503018 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08105  NRPS-like enzyme, putative (JCVI)  30.75 
 
 		 1077 aa  213  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.250944 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0368  amino acid adenylation domain-containing protein  26.56 
 
 		 1194 aa  212  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  29.85 
 
 		 2054 aa  211  6e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0443  linear gramicidin synthetase subunit C  26.85 
 
 		 1193 aa  209  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4881  linear gramicidin synthetase subunit C  26.64 
 
 		 1193 aa  207  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3516  amino acid adenylation domain-containing protein  27.89 
 
 		 995 aa  204  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5457  ornithine acetyl transferase inhibitor  27.12 
 
 		 1149 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0164  thioester reductase domain-containing protein  29.25 
 
 		 2391 aa  198  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1084  non-ribosomal peptide synthetase modules and related proteins-like protein  25.74 
 
 		 2638 aa  198  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0169  thioester reductase domain-containing protein  29.25 
 
 		 2391 aa  198  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05610  aminoadipate reductase large subunit (Eurofung)  27.16 
 
 		 1421 aa  196  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0476531 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21190  enterochelin sythetase component F (Serine-activating enzyme) (Seryl-AMP ligase)  36.78 
 
 		 1330 aa  194  7e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10102  peptide synthetase nrp  27.45 
 
 		 2512 aa  193  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5388  amino acid adenylation domain-containing protein  27.66 
 
 		 997 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2086  linear gramicidin synthetase subunit D  27.01 
 
 		 1002 aa  191  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  27.01 
 
 		 1067 aa  188  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0126  amino acid adenylation:thioester reductase  26.11 
 
 		 1129 aa  182  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.488136  normal  0.545759 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54920  putative non-ribosomal peptide synthetase  25.79 
 
 		 1487 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0523722  unclonable  4.46113e-20 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10861  hypothetical protein  27.06 
 
 		 2199 aa  182  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3912  thioester reductase domain-containing protein  26.65 
 
 		 505 aa  181  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501975  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03495  nonribosomal peptide synthase, putative (Eurofung)  27.79 
 
 		 1480 aa  181  4.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2201  non-ribosomal peptide synthetase/polyketide synthase  36.44 
 
 		 2106 aa  180  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2104  thioester reductase domain-containing protein  27.44 
 
 		 523 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  34.9 
 
 		 1556 aa  178  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  34.9 
 
 		 1556 aa  177  9e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5065  amino acid adenylation domain protein  34.73 
 
 		 2333 aa  176  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0465  amino acid adenylation domain protein  39.02 
 
 		 1047 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.774823  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  35.59 
 
 		 3086 aa  174  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  35.59 
 
 		 3086 aa  174  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  33.8 
 
 		 7122 aa  174  7.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2595  thioester reductase  29.06 
 
 		 506 aa  170  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.410224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  34.66 
 
 		 3235 aa  170  9e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  34.31 
 
 		 2571 aa  170  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  34.31 
 
 		 2571 aa  170  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  33.43 
 
 		 2164 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2338  peptide synthetase  27.05 
 
 		 2387 aa  168  4e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  33.14 
 
 		 4960 aa  167  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2381  amino acid adenylation domain protein  32.29 
 
 		 4196 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  34.11 
 
 		 4960 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1874  amino acid adenylation domain-containing protein  33.61 
 
 		 1553 aa  164  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47104  non ribosomal peptide synthase  26.15 
 
 		 1367 aa  164  7e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1780  amino acid adenylation domain-containing protein  31.52 
 
 		 1922 aa  164  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276348  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  32.09 
 
 		 4968 aa  163  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1970  amino acid adenylation domain-containing protein  33.33 
 
 		 1137 aa  163  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0949143 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  33.51 
 
 		 2156 aa  163  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2413  amino acid adenylation domain-containing protein  34.26 
 
 		 1569 aa  163  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  32.79 
 
 		 3639 aa  162  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  33.77 
 
 		 2156 aa  162  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6834  non-ribosomal peptide synthetase  32.95 
 
 		 1053 aa  162  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445692  normal  0.613796 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  34.04 
 
 		 2156 aa  161  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  32.7 
 
 		 2033 aa  161  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  32.77 
 
 		 7168 aa  161  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  29.97 
 
 		 1550 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1858  amino acid adenylation domain-containing protein  30.61 
 
 		 1528 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3345  non-ribosomal peptide synthetase  33.89 
 
 		 1059 aa  159  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0251 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1830  amino acid adenylation  34.6 
 
 		 1138 aa  159  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2554  bacitracin synthetase 1  29.69 
 
 		 2338 aa  158  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000340307 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2735  bacitracin synthetase 1  29.69 
 
 		 2336 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56804e-17 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1957  amino acid adenylation  34.99 
 
 		 1136 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  28.02 
 
 		 5654 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5752  amino acid adenylation domain protein  32.43 
 
 		 1069 aa  157  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  30.55 
 
 		 2867 aa  157  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  31.88 
 
 		 2138 aa  157  9e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  30.55 
 
 		 3308 aa  156  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  31.35 
 
 		 9175 aa  156  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2147  pyoverdine sidechain peptide synthetase I, epsilon-Lys module  35.1 
 
 		 1104 aa  156  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.240441  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  30.52 
 
 		 3498 aa  156  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  30.81 
 
 		 3176 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  33.9 
 
 		 2419 aa  155  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3090  amino acid adenylation domain protein  32.78 
 
 		 1466 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4101  amino acid adenylation  32 
 
 		 1345 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.357734  normal  0.611275 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3577  amino acid adenylation domain protein  34.38 
 
 		 2412 aa  155  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  29.69 
 
 		 2345 aa  155  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  32.98 
 
 		 2137 aa  155  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3031  amino acid adenylation domain protein  32.51 
 
 		 1466 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  31.48 
 
 		 2151 aa  154  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  32.05 
 
 		 2250 aa  154  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1686  amino acid adenylation domain-containing protein  34.12 
 
 		 1304 aa  154  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>