More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1686 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_21190  enterochelin sythetase component F (Serine-activating enzyme) (Seryl-AMP ligase)  45.96 
 
 		 1330 aa  922    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2017  amino acid adenylation domain protein  40.04 
 
 		 1419 aa  733    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0369158  normal  0.503018 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1686  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 		 1304 aa  2570    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1805  amino acid adenylation domain-containing protein  39.71 
 
 		 1413 aa  627  1e-178  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.323791  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01401  enterobactin synthase subunit F  30.9 
 
 		 1317 aa  560  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1617  amino acid adenylation domain-containing protein  29.15 
 
 		 1336 aa  517  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0465  amino acid adenylation domain protein  36.05 
 
 		 1047 aa  516  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.774823  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.63 
 
 		 2385 aa  510  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  32.2 
 
 		 2386 aa  511  1e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  31.7 
 
 		 2385 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  31.97 
 
 		 2385 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.54 
 
 		 2385 aa  504  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.48 
 
 		 2385 aa  505  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.54 
 
 		 2385 aa  504  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.19 
 
 		 2385 aa  501  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.22 
 
 		 2385 aa  500  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.84 
 
 		 2385 aa  496  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  30.46 
 
 		 2386 aa  492  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2272  enterobactin synthase subunit F  33.66 
 
 		 1296 aa  464  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0155539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3427  enterobactin synthase subunit F  30.53 
 
 		 1325 aa  466  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168919  normal  0.066928 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0642  amino acid adenylation domain protein  31.64 
 
 		 1282 aa  459  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.163069  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2564  enterobactin synthase subunit F  33.46 
 
 		 1304 aa  459  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.276813  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  32.06 
 
 		 1334 aa  455  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3056  enterobactin synthase subunit F  29.74 
 
 		 1310 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0746  enterobactin synthase subunit F  29.94 
 
 		 1294 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0641  enterobactin synthase subunit F  30.09 
 
 		 1294 aa  442  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0700  enterobactin synthase subunit F  29.91 
 
 		 1294 aa  439  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.651012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0627  enterobactin synthase subunit F  29.89 
 
 		 1294 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  33.99 
 
 		 1498 aa  435  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0684  enterobactin synthase subunit F  29.86 
 
 		 1294 aa  432  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.885796 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1119  enterobactin synthase subunit F  29.47 
 
 		 1290 aa  424  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21160  Condensation domain protein  51.3 
 
 		 432 aa  422  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00553  enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP-dependent  29.65 
 
 		 1293 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0283628  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00542  hypothetical protein  29.65 
 
 		 1293 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0422505  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0636  enterobactin synthase subunit F  29.39 
 
 		 1293 aa  409  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  32.36 
 
 		 1449 aa  410  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3040  amino acid adenylation domain protein  29.57 
 
 		 1293 aa  404  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3058  enterobactin synthase subunit F  29.42 
 
 		 1293 aa  405  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0606  enterobactin synthase subunit F  29.47 
 
 		 1293 aa  404  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0671  enterobactin synthase subunit F  29.56 
 
 		 1293 aa  402  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0606  enterobactin synthase subunit F  29.33 
 
 		 1293 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0488  enterobactin synthase subunit F  29.57 
 
 		 1293 aa  402  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1117  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34 
 
 		 1082 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  34.88 
 
 		 3710 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0269  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.09 
 
 		 1082 aa  399  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0308  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34 
 
 		 1082 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1287  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34 
 
 		 1082 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0118  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34 
 
 		 1071 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1791  non-ribosomal peptide synthase  33.9 
 
 		 1082 aa  396  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1704  non-ribosomal peptide synthase  33.71 
 
 		 1082 aa  396  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  34.15 
 
 		 3629 aa  386  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  28.76 
 
 		 1556 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  28.65 
 
 		 1556 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1494  amino acid adenylation domain protein  31.51 
 
 		 2846 aa  382  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  27.48 
 
 		 3086 aa  376  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  29.42 
 
 		 1786 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  27.48 
 
 		 3086 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3733  amino acid adenylation domain protein  29.93 
 
 		 2855 aa  376  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5064  amino acid adenylation domain protein  32.89 
 
 		 4449 aa  376  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4519  amino acid adenylation domain-containing protein  35.2 
 
 		 1478 aa  369  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.669 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18400  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  33.36 
 
 		 5750 aa  367  1e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  31.24 
 
 		 4489 aa  363  1e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  26.43 
 
 		 2151 aa  361  5e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  27.72 
 
 		 2164 aa  360  7e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1830  amino acid adenylation  32.23 
 
 		 1138 aa  360  9.999999999999999e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20780  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  31.2 
 
 		 3539 aa  356  2e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.040794 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1680  amino acid adenylation domain-containing protein  30.29 
 
 		 1405 aa  356  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3715  amino acid adenylation domain protein  32.81 
 
 		 4520 aa  355  2.9999999999999997e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  29.75 
 
 		 6661 aa  354  8e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1883  non-ribosomal peptide synthetase  29.4 
 
 		 1314 aa  353  2e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20791  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1322  amino acid adenylation domain protein  30.38 
 
 		 2877 aa  350  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09680  AMP-dependent synthetase and ligase family protein  29.73 
 
 		 1292 aa  349  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540279  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  32.37 
 
 		 2626 aa  345  2.9999999999999997e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  30.67 
 
 		 1369 aa  344  5.999999999999999e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  33.95 
 
 		 2651 aa  344  7e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1888  amino acid adenylation domain protein  30.54 
 
 		 1315 aa  344  8e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0349547  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4838  amino acid adenylation  26.31 
 
 		 1436 aa  343  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0776089 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1793  amino acid adenylation  30.4 
 
 		 1370 aa  343  2e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0250793 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  30.24 
 
 		 3942 aa  342  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  29.18 
 
 		 6676 aa  341  7e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  30.35 
 
 		 8211 aa  341  7e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  33.69 
 
 		 5149 aa  340  9e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  31.28 
 
 		 6403 aa  339  1.9999999999999998e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  29 
 
 		 4531 aa  339  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3701  non-ribosomal peptide synthase  32.2 
 
 		 3962 aa  338  3.9999999999999995e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1865  amino acid adenylation  31.92 
 
 		 1344 aa  337  7e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2211  amino acid adenylation  31.26 
 
 		 2136 aa  335  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  30.69 
 
 		 2174 aa  335  5e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  29.95 
 
 		 6889 aa  334  6e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1746  amino acid adenylation domain protein  31.35 
 
 		 3532 aa  334  9e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000653127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  30.45 
 
 		 2370 aa  333  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3098  amino acid adenylation domain-containing protein  29.97 
 
 		 3524 aa  332  3e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03120  putative peptide synthetase protein  31.37 
 
 		 1418 aa  331  5.0000000000000004e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  31.38 
 
 		 1336 aa  331  6e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3987  amino acid adenylation domain protein  30.51 
 
 		 3786 aa  331  7e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  30.74 
 
 		 1801 aa  330  9e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  27.92 
 
 		 1093 aa  329  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  26.07 
 
 		 3291 aa  330  2.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  29.1 
 
 		 13537 aa  328  6e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  29.1 
 
 		 2875 aa  327  7e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>