More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0684 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00553  enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP-dependent  79.21 
 
 
1293 aa  2037    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0283628  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3040  amino acid adenylation domain protein  79.06 
 
 
1293 aa  2033    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3427  enterobactin synthase subunit F  56.92 
 
 
1325 aa  1445    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168919  normal  0.066928 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1119  enterobactin synthase subunit F  76.64 
 
 
1290 aa  2014    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00542  hypothetical protein  79.21 
 
 
1293 aa  2037    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0422505  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3058  enterobactin synthase subunit F  79.13 
 
 
1293 aa  2038    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184112  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2272  enterobactin synthase subunit F  38.92 
 
 
1296 aa  704    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0155539  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0684  enterobactin synthase subunit F  100 
 
 
1294 aa  2639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.885796 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0606  enterobactin synthase subunit F  78.75 
 
 
1293 aa  2028    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3056  enterobactin synthase subunit F  53.61 
 
 
1310 aa  1367    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0606  enterobactin synthase subunit F  79.06 
 
 
1293 aa  2031    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630178  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0641  enterobactin synthase subunit F  98.84 
 
 
1294 aa  2609    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01401  enterobactin synthase subunit F  34.36 
 
 
1317 aa  734    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0700  enterobactin synthase subunit F  98.76 
 
 
1294 aa  2607    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.651012  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3733  amino acid adenylation domain protein  43.7 
 
 
2855 aa  897    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0488  enterobactin synthase subunit F  78.83 
 
 
1293 aa  2023    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0671  enterobactin synthase subunit F  78.75 
 
 
1293 aa  2029    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1322  amino acid adenylation domain protein  44.28 
 
 
2877 aa  938    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1494  amino acid adenylation domain protein  44.03 
 
 
2846 aa  930    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2564  enterobactin synthase subunit F  37.59 
 
 
1304 aa  681    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.276813  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0627  enterobactin synthase subunit F  98.69 
 
 
1294 aa  2607    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0636  enterobactin synthase subunit F  79.13 
 
 
1293 aa  2038    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0746  enterobactin synthase subunit F  98.61 
 
 
1294 aa  2608    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0642  amino acid adenylation domain protein  34.78 
 
 
1282 aa  626  1e-177  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.163069  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  37.37 
 
 
1449 aa  611  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1617  amino acid adenylation domain-containing protein  30.41 
 
 
1336 aa  587  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  33.21 
 
 
2386 aa  579  1e-164  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  32.39 
 
 
2385 aa  572  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3715  amino acid adenylation domain protein  36.45 
 
 
4520 aa  572  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  32.14 
 
 
2385 aa  570  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  32.01 
 
 
2386 aa  571  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  31.92 
 
 
2385 aa  567  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  32.11 
 
 
2385 aa  567  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  32.68 
 
 
1334 aa  565  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.54 
 
 
2385 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  32.02 
 
 
2385 aa  566  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.19 
 
 
2385 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  32.02 
 
 
2385 aa  566  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.73 
 
 
2385 aa  558  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  34.92 
 
 
6676 aa  557  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  34.07 
 
 
4531 aa  546  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  36.63 
 
 
4882 aa  542  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3734  amino acid adenylation domain protein  35.88 
 
 
2691 aa  540  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  33.11 
 
 
3432 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  34.79 
 
 
9498 aa  532  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  33.11 
 
 
1336 aa  529  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3732  amino acid adenylation domain protein  37.38 
 
 
6113 aa  523  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  35.39 
 
 
1769 aa  523  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  35.07 
 
 
3348 aa  522  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  34.98 
 
 
3291 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  34.91 
 
 
6006 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1859  amino acid adenylation domain-containing protein  38.79 
 
 
2596 aa  521  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1646  putative peptide synthetase  34.98 
 
 
1483 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0618  putative peptide synthetase  34.98 
 
 
1483 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.099304  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1733  putative peptide synthetase  34.98 
 
 
1528 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  37.81 
 
 
7541 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  32.31 
 
 
3308 aa  516  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1938  putative peptide synthetase  34.98 
 
 
1520 aa  516  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  35.49 
 
 
6889 aa  511  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  33.93 
 
 
1498 aa  511  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  35.14 
 
 
5953 aa  505  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  34.55 
 
 
2883 aa  506  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  35.69 
 
 
8646 aa  501  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  35.11 
 
 
5596 aa  500  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  33.05 
 
 
2875 aa  499  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1866  amino acid adenylation  39.25 
 
 
1074 aa  498  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.996538  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  34.29 
 
 
1753 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2017  amino acid adenylation domain protein  30.31 
 
 
1419 aa  493  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0369158  normal  0.503018 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3855  amino acid adenylation  37.17 
 
 
888 aa  493  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  33.06 
 
 
1839 aa  493  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  34.36 
 
 
6403 aa  491  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  33.54 
 
 
4336 aa  488  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1117  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.87 
 
 
1082 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0269  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.06 
 
 
1082 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21190  enterochelin sythetase component F (Serine-activating enzyme) (Seryl-AMP ligase)  33.09 
 
 
1330 aa  489  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1287  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.87 
 
 
1082 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  30.98 
 
 
4960 aa  489  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0118  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.87 
 
 
1071 aa  488  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0308  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.87 
 
 
1082 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1791  non-ribosomal peptide synthase  33.87 
 
 
1082 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  33.84 
 
 
3629 aa  484  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  30.85 
 
 
4960 aa  484  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20780  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  33.81 
 
 
3539 aa  484  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.040794 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1704  non-ribosomal peptide synthase  33.96 
 
 
1082 aa  486  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  35.66 
 
 
5328 aa  485  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  31.49 
 
 
4968 aa  483  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  34.93 
 
 
2151 aa  478  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  38.21 
 
 
5422 aa  479  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  34.52 
 
 
4317 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  36.07 
 
 
2350 aa  474  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6558  non-ribosomal peptide synthase  33.46 
 
 
4106 aa  475  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5064  amino acid adenylation domain protein  39.45 
 
 
4449 aa  474  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  34.36 
 
 
4336 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  35.58 
 
 
2845 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  33.94 
 
 
4502 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3744  amino acid adenylation domain protein  33.93 
 
 
1110 aa  470  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696362  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  36.6 
 
 
4383 aa  468  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21020  putative non-ribosomal peptide synthetase  34.26 
 
 
2352 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  35.06 
 
 
2154 aa  466  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3051  amino acid adenylation domain-containing protein  33.98 
 
 
1457 aa  463  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690626  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>