More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0488 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00553  enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP-dependent  98.3 
 
 
1293 aa  2593    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0283628  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3040  amino acid adenylation domain protein  98.14 
 
 
1293 aa  2588    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3733  amino acid adenylation domain protein  44.96 
 
 
2855 aa  895    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0746  enterobactin synthase subunit F  78.75 
 
 
1294 aa  2095    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3058  enterobactin synthase subunit F  98.07 
 
 
1293 aa  2586    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184112  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0636  enterobactin synthase subunit F  98.14 
 
 
1293 aa  2591    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01401  enterobactin synthase subunit F  35.55 
 
 
1317 aa  773    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0641  enterobactin synthase subunit F  78.44 
 
 
1294 aa  2081    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3056  enterobactin synthase subunit F  54.79 
 
 
1310 aa  1405    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1322  amino acid adenylation domain protein  44.09 
 
 
2877 aa  944    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0606  enterobactin synthase subunit F  96.91 
 
 
1293 aa  2490    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1119  enterobactin synthase subunit F  76.49 
 
 
1290 aa  2007    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00542  hypothetical protein  98.3 
 
 
1293 aa  2593    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0422505  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0606  enterobactin synthase subunit F  97.29 
 
 
1293 aa  2499    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630178  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0671  enterobactin synthase subunit F  97.68 
 
 
1293 aa  2507    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0684  enterobactin synthase subunit F  78.83 
 
 
1294 aa  2077    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.885796 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0700  enterobactin synthase subunit F  78.59 
 
 
1294 aa  2089    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.651012  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3427  enterobactin synthase subunit F  58.56 
 
 
1325 aa  1499    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168919  normal  0.066928 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0488  enterobactin synthase subunit F  100 
 
 
1293 aa  2635    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2272  enterobactin synthase subunit F  37.81 
 
 
1296 aa  702    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0155539  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0627  enterobactin synthase subunit F  78.59 
 
 
1294 aa  2092    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2564  enterobactin synthase subunit F  37.38 
 
 
1304 aa  679    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.276813  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1494  amino acid adenylation domain protein  43.83 
 
 
2846 aa  944    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0642  amino acid adenylation domain protein  35.37 
 
 
1282 aa  620  1e-176  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.163069  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  33.96 
 
 
2386 aa  602  1e-170  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  36.63 
 
 
1449 aa  602  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  32.48 
 
 
2386 aa  596  1e-169  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.27 
 
 
2385 aa  594  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.61 
 
 
2385 aa  592  1e-167  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  32.95 
 
 
2385 aa  587  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  33.71 
 
 
2385 aa  588  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  33.19 
 
 
1334 aa  586  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1617  amino acid adenylation domain-containing protein  31.4 
 
 
1336 aa  588  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.43 
 
 
2385 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  32.93 
 
 
2385 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.43 
 
 
2385 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  32.38 
 
 
2385 aa  580  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  32.19 
 
 
2385 aa  581  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3715  amino acid adenylation domain protein  36.18 
 
 
4520 aa  564  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3734  amino acid adenylation domain protein  36.27 
 
 
2691 aa  544  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  31.24 
 
 
1336 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  34.38 
 
 
6006 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  36.37 
 
 
4882 aa  535  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  33.64 
 
 
6676 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  34.8 
 
 
1498 aa  531  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  35.01 
 
 
3291 aa  533  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  33.14 
 
 
3432 aa  528  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1646  putative peptide synthetase  34.64 
 
 
1483 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3732  amino acid adenylation domain protein  31.8 
 
 
6113 aa  528  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0618  putative peptide synthetase  34.64 
 
 
1483 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.099304  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  34.73 
 
 
3348 aa  530  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1733  putative peptide synthetase  34.64 
 
 
1528 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1938  putative peptide synthetase  34.64 
 
 
1520 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  32.92 
 
 
4531 aa  526  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1859  amino acid adenylation domain-containing protein  37.22 
 
 
2596 aa  520  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  34.78 
 
 
1769 aa  523  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  34.69 
 
 
9498 aa  519  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  35.29 
 
 
3629 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  36.09 
 
 
8646 aa  519  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  35.05 
 
 
7541 aa  515  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  34.36 
 
 
2883 aa  514  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  32.74 
 
 
2875 aa  510  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  34.4 
 
 
6889 aa  509  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1791  non-ribosomal peptide synthase  34.11 
 
 
1082 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1866  amino acid adenylation  39.82 
 
 
1074 aa  509  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.996538  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  32.69 
 
 
3308 aa  507  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1117  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.92 
 
 
1082 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5064  amino acid adenylation domain protein  42.49 
 
 
4449 aa  506  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0269  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.11 
 
 
1082 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1287  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.92 
 
 
1082 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1704  non-ribosomal peptide synthase  34.2 
 
 
1082 aa  505  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0118  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.92 
 
 
1071 aa  505  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0308  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.92 
 
 
1082 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  35.11 
 
 
5953 aa  503  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20780  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  33.7 
 
 
3539 aa  494  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.040794 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2017  amino acid adenylation domain protein  30.61 
 
 
1419 aa  496  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0369158  normal  0.503018 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21020  putative non-ribosomal peptide synthetase  35.15 
 
 
2352 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  35.36 
 
 
5328 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  35.07 
 
 
2151 aa  491  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  34.63 
 
 
1753 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  35.73 
 
 
2154 aa  487  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21190  enterochelin sythetase component F (Serine-activating enzyme) (Seryl-AMP ligase)  32.45 
 
 
1330 aa  488  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  33 
 
 
1839 aa  485  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  32.93 
 
 
4336 aa  480  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  34.97 
 
 
5596 aa  483  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  33.94 
 
 
4037 aa  481  1e-134  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0982  amino acid adenylation domain protein  30.19 
 
 
2006 aa  479  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  35.31 
 
 
2845 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  34.97 
 
 
4747 aa  478  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1865  amino acid adenylation  30.85 
 
 
1344 aa  473  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6558  non-ribosomal peptide synthase  36.95 
 
 
4106 aa  476  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138815 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3855  amino acid adenylation  36.6 
 
 
888 aa  473  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  37.37 
 
 
5422 aa  476  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  30.25 
 
 
4968 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3744  amino acid adenylation domain protein  34.66 
 
 
1110 aa  473  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696362  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  34.53 
 
 
6403 aa  468  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4039  amino acid adenylation domain-containing protein  35.22 
 
 
3224 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  37.23 
 
 
4383 aa  469  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  36.44 
 
 
4489 aa  464  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1965  amino acid adenylation domain-containing protein  44.83 
 
 
2439 aa  465  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.229236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>