More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2564 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00553  enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP-dependent  37.05 
 
 		 1293 aa  659    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0283628  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3040  amino acid adenylation domain protein  36.9 
 
 		 1293 aa  655    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3056  enterobactin synthase subunit F  35.34 
 
 		 1310 aa  674    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0700  enterobactin synthase subunit F  37.38 
 
 		 1294 aa  683    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.651012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3058  enterobactin synthase subunit F  37.13 
 
 		 1293 aa  662    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3427  enterobactin synthase subunit F  37.3 
 
 		 1325 aa  679    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168919  normal  0.066928 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0627  enterobactin synthase subunit F  37.18 
 
 		 1294 aa  679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0606  enterobactin synthase subunit F  37.13 
 
 		 1293 aa  660    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  36.29 
 
 		 1334 aa  657    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0684  enterobactin synthase subunit F  37.67 
 
 		 1294 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.885796 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1119  enterobactin synthase subunit F  37.21 
 
 		 1290 aa  671    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0746  enterobactin synthase subunit F  37.44 
 
 		 1294 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0488  enterobactin synthase subunit F  37.02 
 
 		 1293 aa  659    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2272  enterobactin synthase subunit F  52.95 
 
 		 1296 aa  1151    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0155539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0606  enterobactin synthase subunit F  36.94 
 
 		 1293 aa  655    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0636  enterobactin synthase subunit F  36.97 
 
 		 1293 aa  657    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2564  enterobactin synthase subunit F  100 
 
 		 1304 aa  2565    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.276813  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01401  enterobactin synthase subunit F  38.3 
 
 		 1317 aa  840    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  41.76 
 
 		 1449 aa  659    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0641  enterobactin synthase subunit F  37.29 
 
 		 1294 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0671  enterobactin synthase subunit F  36.97 
 
 		 1293 aa  658    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00542  hypothetical protein  37.05 
 
 		 1293 aa  659    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0422505  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0642  amino acid adenylation domain protein  37.92 
 
 		 1282 aa  689    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.163069  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1617  amino acid adenylation domain-containing protein  33.41 
 
 		 1336 aa  628  1e-178  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.47 
 
 		 2385 aa  623  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  35.56 
 
 		 2386 aa  625  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.33 
 
 		 2385 aa  623  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.85 
 
 		 2385 aa  624  1e-177  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.53 
 
 		 2385 aa  622  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.37 
 
 		 2385 aa  620  1e-176  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  35.56 
 
 		 2385 aa  619  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.17 
 
 		 2385 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.17 
 
 		 2385 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  35.1 
 
 		 2385 aa  612  1e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  35.44 
 
 		 2386 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3715  amino acid adenylation domain protein  39.7 
 
 		 4520 aa  590  1e-167  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1322  amino acid adenylation domain protein  36.6 
 
 		 2877 aa  592  1e-167  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  38.35 
 
 		 9498 aa  582  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3855  amino acid adenylation  39.49 
 
 		 888 aa  579  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2017  amino acid adenylation domain protein  36.01 
 
 		 1419 aa  576  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0369158  normal  0.503018 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1494  amino acid adenylation domain protein  35.91 
 
 		 2846 aa  575  1.0000000000000001e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  38.36 
 
 		 1498 aa  568  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  35.72 
 
 		 4531 aa  555  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  36.08 
 
 		 6676 aa  555  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3733  amino acid adenylation domain protein  41.3 
 
 		 2855 aa  555  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  34.94 
 
 		 1336 aa  552  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  37.97 
 
 		 3348 aa  549  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  38.32 
 
 		 6889 aa  549  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1646  putative peptide synthetase  37.79 
 
 		 1483 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  35.01 
 
 		 3308 aa  545  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0618  putative peptide synthetase  37.79 
 
 		 1483 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.099304  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  37.63 
 
 		 3291 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1733  putative peptide synthetase  37.79 
 
 		 1528 aa  543  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1938  putative peptide synthetase  37.79 
 
 		 1520 aa  543  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  37.26 
 
 		 6006 aa  528  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  37.69 
 
 		 5953 aa  524  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  35.22 
 
 		 1753 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  34.24 
 
 		 3432 aa  524  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  36.2 
 
 		 1839 aa  523  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1965  amino acid adenylation domain-containing protein  38.08 
 
 		 2439 aa  526  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229236 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  39.04 
 
 		 3710 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  46.27 
 
 		 1769 aa  518  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1866  amino acid adenylation  40.53 
 
 		 1074 aa  513  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.996538  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  38.96 
 
 		 4489 aa  514  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  36.19 
 
 		 2151 aa  510  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  38.56 
 
 		 8646 aa  512  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  35.28 
 
 		 5596 aa  511  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  36.51 
 
 		 4502 aa  510  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3739  amino acid adenylation domain protein  34.9 
 
 		 1193 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133452  normal  0.0805981 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  35.11 
 
 		 2875 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6558  non-ribosomal peptide synthase  36.35 
 
 		 4106 aa  509  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138815 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5751  amino acid adenylation domain protein  34.58 
 
 		 1578 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21190  enterochelin sythetase component F (Serine-activating enzyme) (Seryl-AMP ligase)  35.35 
 
 		 1330 aa  509  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3685  amino acid adenylation domain protein  34.9 
 
 		 1193 aa  509  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  37.02 
 
 		 4882 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3734  amino acid adenylation domain protein  36.03 
 
 		 2691 aa  506  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  36.91 
 
 		 2154 aa  504  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1859  amino acid adenylation domain-containing protein  36.21 
 
 		 2596 aa  505  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  34.16 
 
 		 2883 aa  503  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3731  amino acid adenylation domain-containing protein  38.65 
 
 		 1130 aa  500  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201667  normal  0.167868 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  33.08 
 
 		 1369 aa  498  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  36.68 
 
 		 3404 aa  499  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3744  amino acid adenylation domain protein  38.18 
 
 		 1110 aa  490  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696362  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  37.13 
 
 		 1776 aa  493  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1805  amino acid adenylation domain-containing protein  35.89 
 
 		 1413 aa  492  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.323791  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  35.99 
 
 		 3470 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1117  nonribosomal peptide synthetase DhbF  36.19 
 
 		 1082 aa  489  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0269  nonribosomal peptide synthetase DhbF  36.1 
 
 		 1082 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1287  nonribosomal peptide synthetase DhbF  36.19 
 
 		 1082 aa  489  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  37.9 
 
 		 2350 aa  488  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0118  nonribosomal peptide synthetase DhbF  36.19 
 
 		 1071 aa  489  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0308  nonribosomal peptide synthetase DhbF  36.19 
 
 		 1082 aa  489  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1791  non-ribosomal peptide synthase  36.1 
 
 		 1082 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  37.05 
 
 		 6403 aa  485  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  36.21 
 
 		 5654 aa  485  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  35.48 
 
 		 4037 aa  485  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1888  amino acid adenylation domain protein  33.1 
 
 		 1315 aa  486  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0349547  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1704  non-ribosomal peptide synthase  36.1 
 
 		 1082 aa  485  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  37.1 
 
 		 5328 aa  486  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  38.92 
 
 		 7541 aa  481  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.247204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>