More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0465 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0465  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 		 1047 aa  2148    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.774823  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1805  amino acid adenylation domain-containing protein  38.45 
 
 		 1413 aa  640    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.323791  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2017  amino acid adenylation domain protein  36.92 
 
 		 1419 aa  622  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0369158  normal  0.503018 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21190  enterochelin sythetase component F (Serine-activating enzyme) (Seryl-AMP ligase)  39.51 
 
 		 1330 aa  611  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1686  amino acid adenylation domain-containing protein  36.19 
 
 		 1304 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  31.03 
 
 		 2385 aa  491  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.28 
 
 		 2385 aa  486  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  31.03 
 
 		 2385 aa  488  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.38 
 
 		 2385 aa  488  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.1 
 
 		 2385 aa  488  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.04 
 
 		 2385 aa  484  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  31.05 
 
 		 2386 aa  486  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.94 
 
 		 2385 aa  482  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.75 
 
 		 2385 aa  481  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.94 
 
 		 2385 aa  482  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  30.11 
 
 		 2386 aa  473  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  32.39 
 
 		 1498 aa  460  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1617  amino acid adenylation domain-containing protein  29.69 
 
 		 1336 aa  434  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01401  enterobactin synthase subunit F  29.63 
 
 		 1317 aa  425  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0269  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.52 
 
 		 1082 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  30.4 
 
 		 1334 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1117  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.27 
 
 		 1082 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1791  non-ribosomal peptide synthase  30.24 
 
 		 1082 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1287  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.27 
 
 		 1082 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1704  non-ribosomal peptide synthase  30.24 
 
 		 1082 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0118  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.27 
 
 		 1071 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0308  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.27 
 
 		 1082 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6558  non-ribosomal peptide synthase  30.85 
 
 		 4106 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138815 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18400  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  29.8 
 
 		 5750 aa  396  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  29.49 
 
 		 3086 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2564  enterobactin synthase subunit F  31.19 
 
 		 1304 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.276813  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  29.49 
 
 		 3086 aa  389  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  31.06 
 
 		 3710 aa  388  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3427  enterobactin synthase subunit F  30.12 
 
 		 1325 aa  389  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168919  normal  0.066928 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  31.84 
 
 		 3629 aa  381  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0746  enterobactin synthase subunit F  29.26 
 
 		 1294 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0641  enterobactin synthase subunit F  28.92 
 
 		 1294 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  28.81 
 
 		 1454 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0684  enterobactin synthase subunit F  29.1 
 
 		 1294 aa  376  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.885796 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09680  AMP-dependent synthetase and ligase family protein  30.81 
 
 		 1292 aa  375  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540279  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  28.11 
 
 		 2164 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4519  amino acid adenylation domain-containing protein  31.81 
 
 		 1478 aa  375  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.669 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0627  enterobactin synthase subunit F  28.82 
 
 		 1294 aa  376  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0700  enterobactin synthase subunit F  29.06 
 
 		 1294 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.651012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  29.35 
 
 		 1449 aa  375  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3056  enterobactin synthase subunit F  28.97 
 
 		 1310 aa  368  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  27.89 
 
 		 1556 aa  360  7e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0606  enterobactin synthase subunit F  29.52 
 
 		 1293 aa  359  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1494  amino acid adenylation domain protein  30.73 
 
 		 2846 aa  358  2.9999999999999997e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3058  enterobactin synthase subunit F  29.9 
 
 		 1293 aa  355  2e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  26.59 
 
 		 2151 aa  355  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0671  enterobactin synthase subunit F  29.63 
 
 		 1293 aa  355  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  27.71 
 
 		 1556 aa  355  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1119  enterobactin synthase subunit F  27.8 
 
 		 1290 aa  353  1e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0488  enterobactin synthase subunit F  29.54 
 
 		 1293 aa  352  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  29.08 
 
 		 1786 aa  351  4e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0606  enterobactin synthase subunit F  29.58 
 
 		 1293 aa  349  1e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  28.46 
 
 		 1801 aa  347  8e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00553  enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP-dependent  29.43 
 
 		 1293 aa  346  1e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0283628  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3040  amino acid adenylation domain protein  29.43 
 
 		 1293 aa  346  1e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0636  enterobactin synthase subunit F  29.43 
 
 		 1293 aa  346  1e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00542  hypothetical protein  29.43 
 
 		 1293 aa  346  1e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0422505  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20780  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  30.18 
 
 		 3539 aa  345  2e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.040794 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2272  enterobactin synthase subunit F  30.43 
 
 		 1296 aa  343  9e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0155539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4086  amino acid adenylation domain-containing protein  30.28 
 
 		 2155 aa  343  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  28.01 
 
 		 3337 aa  340  5.9999999999999996e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3744  amino acid adenylation domain protein  30.37 
 
 		 1110 aa  339  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696362  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2201  non-ribosomal peptide synthetase/polyketide synthase  28.76 
 
 		 2106 aa  337  5.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5064  amino acid adenylation domain protein  29.32 
 
 		 4449 aa  337  9e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1830  amino acid adenylation  29.48 
 
 		 1138 aa  336  2e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5619  amino acid adenylation domain-containing protein  26.24 
 
 		 1518 aa  335  2e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  29.58 
 
 		 3432 aa  334  4e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2875  linear gramicidin synthetase subunit C  26.17 
 
 		 1518 aa  334  6e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  29.02 
 
 		 6889 aa  333  8e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5065  amino acid adenylation domain protein  29.47 
 
 		 2333 aa  333  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  27.65 
 
 		 2571 aa  333  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  27.65 
 
 		 2571 aa  333  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2461  linear gramicidin synthetase subunit C  26.28 
 
 		 1518 aa  332  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3734  amino acid adenylation domain protein  27.96 
 
 		 2691 aa  332  3e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  27.62 
 
 		 6676 aa  330  9e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  30.12 
 
 		 1776 aa  330  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2186  non-ribosomal peptide synthase MxaA  29.83 
 
 		 1436 aa  329  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  30.63 
 
 		 4502 aa  328  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2147  pyoverdine sidechain peptide synthetase I, epsilon-Lys module  30.13 
 
 		 1104 aa  328  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.240441  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1749  amino acid adenylation domain protein  29.42 
 
 		 1199 aa  327  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.82306  normal  0.0351239 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  28.7 
 
 		 2189 aa  326  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1784  amino acid adenylation domain-containing protein  26.14 
 
 		 4080 aa  325  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  28.25 
 
 		 3308 aa  325  3e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1322  amino acid adenylation domain protein  28.84 
 
 		 2877 aa  325  4e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1883  non-ribosomal peptide synthetase  29.05 
 
 		 1314 aa  323  8e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20791  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3715  amino acid adenylation domain protein  29.19 
 
 		 4520 aa  322  1.9999999999999998e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  26.16 
 
 		 2033 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  27.01 
 
 		 9498 aa  321  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  31.04 
 
 		 4136 aa  321  5e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3740  amino acid adenylation domain protein  27.12 
 
 		 2395 aa  320  6e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.209532 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3733  amino acid adenylation domain protein  27.93 
 
 		 2855 aa  321  6e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  28.17 
 
 		 3498 aa  320  7e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3737  amino acid adenylation domain protein  27.12 
 
 		 3824 aa  320  7e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0118377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  28.54 
 
 		 2174 aa  320  9e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3683  amino acid adenylation domain protein  27.12 
 
 		 2664 aa  319  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>