More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2551 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2551  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  686    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0234245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3013  hypothetical protein  45.87 
 
 		 366 aa  270  4e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0103839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4147  hypothetical protein  44.99 
 
 		 366 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5128  Male sterility domain protein  33.74 
 
 		 358 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2871  Male sterility domain protein  35.64 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.64 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2778  male sterility domain protein  35.64 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2676  hypothetical protein  36.77 
 
 		 373 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0511814 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  31.18 
 
 		 937 aa  106  8e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1750  Male sterility domain protein  31.64 
 
 		 642 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1104  Male sterility domain protein  34.7 
 
 		 701 aa  103  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972313  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3229  Male sterility-like  35.47 
 
 		 351 aa  99  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3148  Male sterility domain protein  35.63 
 
 		 354 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4094  Male sterility domain protein  30.15 
 
 		 359 aa  97.1  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.796216  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1327  Male sterility domain protein  31.92 
 
 		 356 aa  97.4  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38219  normal  0.51823 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  31.06 
 
 		 671 aa  94  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4728  hypothetical protein  30.21 
 
 		 354 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4933  Male sterility domain protein  31.54 
 
 		 437 aa  92  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  0.407936 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2522  Male sterility domain protein  31.79 
 
 		 410 aa  90.5  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0364  Male sterility domain protein  28.61 
 
 		 493 aa  89.4  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1667  hypothetical protein  32.72 
 
 		 358 aa  89  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0262372  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3608  Male sterility domain protein  29.92 
 
 		 637 aa  87.4  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.619777  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  31.18 
 
 		 665 aa  86.7  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2917  short chain dehydrogenase  30.85 
 
 		 665 aa  86.3  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0126943  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  30.07 
 
 		 659 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3829  hypothetical protein  28.15 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  29.89 
 
 		 661 aa  83.2  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  30.92 
 
 		 671 aa  83.2  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1527  short chain dehydrogenase  31.66 
 
 		 653 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  31.44 
 
 		 664 aa  79.3  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2186  non-ribosomal peptide synthase MxaA  31.84 
 
 		 1436 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3912  thioester reductase domain-containing protein  22.25 
 
 		 505 aa  76.6  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501975  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0491  short chain dehydrogenase  29.81 
 
 		 668 aa  75.9  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442129 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5015  Male sterility domain-containing protein  29.86 
 
 		 667 aa  73.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435156  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1067  Male sterility-like protein  24.19 
 
 		 685 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  29.71 
 
 		 2113 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4890  amino acid adenylation domain-containing protein  28.57 
 
 		 1500 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.365672 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3755  thioester reductase domain protein  24.52 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.801599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  25.74 
 
 		 1498 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3702  thioester reductase domain protein  24.52 
 
 		 398 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  25.82 
 
 		 2374 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4416  amino acid adenylation domain-containing protein  28.01 
 
 		 1485 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4650  male sterility domain protein  28.98 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458104  normal  0.580556 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  27.01 
 
 		 1449 aa  70.1  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000549333 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1326  AMP-dependent synthetase and ligase  31.23 
 
 		 1538 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.683911  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2553  dehydrogenase domain-containing protein  29.61 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1165  long-chain-fatty-acid CoA ligase  28.83 
 
 		 1537 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1224  AMP-dependent synthetase and ligase  31.23 
 
 		 1538 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.64 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1929  hypothetical protein  26.46 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17440  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.86 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147754  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3842  hypothetical protein  25.25 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2731  Male sterility domain protein  30.86 
 
 		 392 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.885706  hitchhiker  0.00797999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.96 
 
 		 326 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.29 
 
 		 318 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.82 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0280203  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.22 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1805  amino acid adenylation domain-containing protein  27.01 
 
 		 1413 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.323791  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.41 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2232  amino acid adenylation domain protein  31.54 
 
 		 1395 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.214627 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  25 
 
 		 2376 aa  64.3  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1084  non-ribosomal peptide synthetase modules and related proteins-like protein  26.64 
 
 		 2638 aa  63.9  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3771  hypothetical protein  29.2 
 
 		 385 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2419  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  26.87 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68020  L-aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase, large subunit  27.65 
 
 		 1394 aa  63.2  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224506  normal  0.0608631 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.58 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.225556  normal  0.379661 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.08 
 
 		 337 aa  62  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1600  hypothetical protein  25.9 
 
 		 326 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.72 
 
 		 326 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2515  hypothetical protein  26.87 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  26.28 
 
 		 1454 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3085  hypothetical protein  26.87 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2075  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.27 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0864456  normal  0.131531 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.52 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0253949  normal  0.427643 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3032  hypothetical protein  24.6 
 
 		 354 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.65 
 
 		 335 aa  62  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.51 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1803  UDP-sugar epimerase  30.14 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.198516  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.37 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1182  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.88 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44311  hypothetical protein  27.94 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.28 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13250  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  36.27 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.986779  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7306  peptide synthetase  26.94 
 
 		 1506 aa  60.1  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.370247  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2104  thioester reductase domain-containing protein  24.73 
 
 		 523 aa  60.1  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1185  steroid dehydrogenase  29.31 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.809029 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.83 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111318  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.51 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.094979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54920  putative non-ribosomal peptide synthetase  26.32 
 
 		 1487 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0523722  unclonable  4.46113e-20 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.63 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  25.84 
 
 		 1270 aa  59.3  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.87 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0661585  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.17 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.27 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0171245  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1975  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.16 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2112  HAD family hydrolase  42.39 
 
 		 750 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1133  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.77 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.853451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1984  UDP-glucose 4-epimerase  29.17 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4635  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.19 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>