166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2419 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2515  hypothetical protein  98.64 
 
 		 369 aa  760    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3085  hypothetical protein  98.37 
 
 		 369 aa  759    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2419  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  100 
 
 		 369 aa  769    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3212  hypothetical protein  69.38 
 
 		 374 aa  529  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0204352 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0098  hemolysin F  62.33 
 
 		 369 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0392616  hitchhiker  0.000000811123 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3227  Male sterility domain protein  56.91 
 
 		 369 aa  448  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0566277  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44311  hypothetical protein  47.43 
 
 		 385 aa  339  5e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3771  hypothetical protein  46.34 
 
 		 385 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1411  Male sterility domain protein  38.34 
 
 		 367 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0948255  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1347  Male sterility domain  37 
 
 		 367 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.416798  normal  0.0755507 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1165  Male sterility domain  38.36 
 
 		 367 aa  243  5e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1462  putative signal peptide protein  38.56 
 
 		 367 aa  237  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.653103 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1737  hypothetical protein  35.25 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0887086  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1142  hypothetical protein  34.51 
 
 		 395 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0098  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.51 
 
 		 395 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.992501  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1515  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.51 
 
 		 395 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.149273  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1021  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.24 
 
 		 395 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.107249  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0936  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.24 
 
 		 395 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2261  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.24 
 
 		 395 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.715981  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4229  hypothetical protein  29.87 
 
 		 404 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3288  hypothetical protein  29.87 
 
 		 404 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.120126 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4125  hypothetical protein  29.71 
 
 		 404 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4137  Male sterility-like  29.6 
 
 		 404 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.68 
 
 		 403 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3651  hypothetical protein  29.49 
 
 		 403 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.827803 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4376  hypothetical protein  31.93 
 
 		 412 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4933  Male sterility domain protein  27.46 
 
 		 437 aa  81.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  0.407936 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  24.84 
 
 		 937 aa  72.4  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4094  Male sterility domain protein  27.95 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.796216  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  24.33 
 
 		 661 aa  65.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2551  hypothetical protein  26.87 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0234245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  27.21 
 
 		 1454 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3148  Male sterility domain protein  28.36 
 
 		 354 aa  62.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5128  Male sterility domain protein  27.94 
 
 		 358 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.15 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4168  Male sterility domain  33.33 
 
 		 764 aa  60.1  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05348  conserved hypothetical protein  28.3 
 
 		 413 aa  59.7  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0521089  normal  0.0191103 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.15 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0364  Male sterility domain protein  26.46 
 
 		 493 aa  59.3  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1805  amino acid adenylation domain-containing protein  27.5 
 
 		 1413 aa  59.7  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.323791  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2676  hypothetical protein  23.06 
 
 		 373 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0511814 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  29.05 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2092  AMP-dependent synthetase and ligase  32.21 
 
 		 1406 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261871  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2522  Male sterility domain protein  24.8 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0793  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  27.69 
 
 		 331 aa  57  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  24.61 
 
 		 671 aa  57  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3912  thioester reductase domain-containing protein  25.9 
 
 		 505 aa  56.6  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501975  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.18 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4416  amino acid adenylation domain-containing protein  28.36 
 
 		 1485 aa  56.6  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13425  short chain dehydrogenase  23.61 
 
 		 650 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  29.08 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  26.98 
 
 		 1270 aa  56.2  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.18 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10102  peptide synthetase nrp  29.89 
 
 		 2512 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1104  Male sterility domain protein  24.61 
 
 		 701 aa  56.2  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972313  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3227  hypothetical protein  23.94 
 
 		 618 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0125277  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  23.77 
 
 		 659 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  26.56 
 
 		 333 aa  55.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2104  thioester reductase domain-containing protein  26.69 
 
 		 523 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.82 
 
 		 327 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44189  predicted protein  29.26 
 
 		 1560 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4147  hypothetical protein  24.9 
 
 		 366 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3013  hypothetical protein  26.19 
 
 		 366 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0103839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  26 
 
 		 2374 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0896  MxaA domain-containing protein  23.94 
 
 		 627 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0954  MxaA domain-containing protein  23.94 
 
 		 627 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  23.94 
 
 		 664 aa  54.3  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2045  mxaA domain protein  25.35 
 
 		 618 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4890  amino acid adenylation domain-containing protein  26.79 
 
 		 1500 aa  54.7  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.365672 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.79 
 
 		 326 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.4 
 
 		 322 aa  53.9  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000335133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3235  mxaA domain protein  23.94 
 
 		 618 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00294865  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04827  NRPS-like enzyme, putative (JCVI)  28.32 
 
 		 1051 aa  53.1  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0589  sugar epimerase family protein  23.66 
 
 		 321 aa  53.1  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2595  thioester reductase  25.27 
 
 		 506 aa  53.1  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.410224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7306  peptide synthetase  25.28 
 
 		 1506 aa  53.1  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.370247  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05610  aminoadipate reductase large subunit (Eurofung)  22.5 
 
 		 1421 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0476531 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.13 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.89 
 
 		 331 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.76 
 
 		 319 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.4 
 
 		 315 aa  52.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10861  hypothetical protein  25.88 
 
 		 2199 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  23.32 
 
 		 2376 aa  52.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3193  mxaA domain protein  24.41 
 
 		 618 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0855  nucleotide sugar epimerase  23.47 
 
 		 618 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.625581  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1750  Male sterility domain protein  25.45 
 
 		 642 aa  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68020  L-aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase, large subunit  23.7 
 
 		 1394 aa  51.6  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224506  normal  0.0608631 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.09 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03495  nonribosomal peptide synthase, putative (Eurofung)  26.13 
 
 		 1480 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00170  aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase, putative  26.8 
 
 		 1409 aa  51.2  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.682323  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.15 
 
 		 318 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  hitchhiker  0.0000234209 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2338  peptide synthetase  30.43 
 
 		 2387 aa  50.4  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  23.18 
 
 		 1067 aa  50.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 		 361 aa  50.4  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5489  amino acid adenylation domain-containing protein  23.88 
 
 		 2439 aa  50.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934581 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  26.24 
 
 		 1449 aa  50.1  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28436  predicted protein  27.27 
 
 		 360 aa  50.1  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.981299  normal  0.211421 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.27 
 
 		 319 aa  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14531  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  25.76 
 
 		 332 aa  49.7  0.00008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.699739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>