84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1785 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4125  hypothetical protein  91.09 
 
 
404 aa  706    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4137  Male sterility-like  95.54 
 
 
404 aa  735    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3651  hypothetical protein  91.32 
 
 
403 aa  714    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.827803 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3288  hypothetical protein  96.04 
 
 
404 aa  741    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.120126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
403 aa  798    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4229  hypothetical protein  96.04 
 
 
404 aa  741    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4376  hypothetical protein  79.8 
 
 
412 aa  568  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1737  hypothetical protein  63.59 
 
 
395 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0887086  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1142  hypothetical protein  64 
 
 
395 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2261  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  64.34 
 
 
395 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.715981  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1515  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  64 
 
 
395 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.149273  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0098  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  64 
 
 
395 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.992501  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1021  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  64 
 
 
395 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.107249  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0936  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  64 
 
 
395 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44311  hypothetical protein  34.22 
 
 
385 aa  179  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3771  hypothetical protein  34.39 
 
 
385 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3212  hypothetical protein  31.65 
 
 
374 aa  174  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0204352 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1411  Male sterility domain protein  32.37 
 
 
367 aa  172  9e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0948255  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1462  putative signal peptide protein  31.93 
 
 
367 aa  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.653103 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1165  Male sterility domain  32.1 
 
 
367 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.387484 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1347  Male sterility domain  32.37 
 
 
367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.416798  normal  0.0755507 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3085  hypothetical protein  30.85 
 
 
369 aa  157  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2515  hypothetical protein  30.59 
 
 
369 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0098  hemolysin F  29.44 
 
 
369 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0392616  hitchhiker  0.000000811123 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2419  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.79 
 
 
369 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3227  Male sterility domain protein  28.12 
 
 
369 aa  150  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0566277  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.01 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.01 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.09 
 
 
320 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.667307 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.87 
 
 
321 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.45 
 
 
318 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
318 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.84 
 
 
320 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05610  aminoadipate reductase large subunit (Eurofung)  26.47 
 
 
1421 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0476531 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  27.21 
 
 
1498 aa  57.4  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  25.82 
 
 
937 aa  57  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.97 
 
 
321 aa  54.7  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3148  Male sterility domain protein  31.53 
 
 
354 aa  54.3  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3638  UDP-glucose 4-epimerase, putative  27.52 
 
 
326 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.76 
 
 
321 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4933  Male sterility domain protein  30.26 
 
 
437 aa  53.9  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  0.407936 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3129  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.76 
 
 
321 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.97 
 
 
320 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  23.48 
 
 
321 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.99 
 
 
321 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4292  amino acid adenylation domain-containing protein  27.93 
 
 
1188 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375384  normal  0.670751 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  27.73 
 
 
332 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.48 
 
 
321 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.48 
 
 
321 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.48 
 
 
321 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.48 
 
 
321 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  23.97 
 
 
661 aa  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0364  Male sterility domain protein  26.99 
 
 
493 aa  50.8  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  25.35 
 
 
1449 aa  50.4  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  26.67 
 
 
664 aa  50.4  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.447449 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08105  NRPS-like enzyme, putative (JCVI)  22.66 
 
 
1077 aa  50.4  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.250944 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1754  UDP-glucose 4-epimerase, putative  26.23 
 
 
326 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0706021  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3187  amino acid adenylation domain-containing protein  27.59 
 
 
1188 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4973  amino acid adenylation  27.59 
 
 
1188 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432296  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4728  hypothetical protein  26.9 
 
 
354 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.28 
 
 
336 aa  48.9  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111318  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  26.95 
 
 
671 aa  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.13 
 
 
320 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.31 
 
 
355 aa  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2104  thioester reductase domain-containing protein  25.36 
 
 
523 aa  46.2  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.86 
 
 
327 aa  46.6  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  25.27 
 
 
665 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2616  AMP-dependent synthetase and ligase  36.5 
 
 
904 aa  46.2  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.14755  normal  0.232695 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  24.32 
 
 
1067 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3810  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.66 
 
 
345 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.37 
 
 
329 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3229  Male sterility-like  29.87 
 
 
351 aa  44.3  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.76 
 
 
345 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  21.99 
 
 
1454 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3516  amino acid adenylation domain-containing protein  23.86 
 
 
995 aa  44.3  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2522  Male sterility domain protein  29.53 
 
 
410 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2555  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.19 
 
 
336 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44189  predicted protein  26.48 
 
 
1560 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11140  putative nonribosomal peptide synthetase  24.34 
 
 
991 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0225  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein/3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  27.32 
 
 
330 aa  44.3  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54920  putative non-ribosomal peptide synthetase  41.67 
 
 
1487 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0523722  unclonable  4.46113e-20 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.51 
 
 
313 aa  43.5  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000549333 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.57 
 
 
321 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.824049  hitchhiker  0.00256302 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.35 
 
 
320 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0253949  normal  0.427643 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>