159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_A0098 on replicon NC_010488
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010488  EcSMS35_A0098  hemolysin F  100 
 
 		 369 aa  765    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0392616  hitchhiker  0.000000811123 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3212  hypothetical protein  67.48 
 
 		 374 aa  512  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0204352 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2515  hypothetical protein  62.87 
 
 		 369 aa  488  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3085  hypothetical protein  62.87 
 
 		 369 aa  489  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2419  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  62.33 
 
 		 369 aa  481  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3227  Male sterility domain protein  56.91 
 
 		 369 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0566277  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44311  hypothetical protein  50.14 
 
 		 385 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3771  hypothetical protein  49.32 
 
 		 385 aa  354  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1165  Male sterility domain  38.01 
 
 		 367 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387484 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1411  Male sterility domain protein  38.24 
 
 		 367 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0948255  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1347  Male sterility domain  37.43 
 
 		 367 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.416798  normal  0.0755507 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1462  putative signal peptide protein  37.17 
 
 		 367 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.653103 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1737  hypothetical protein  34.43 
 
 		 395 aa  180  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0887086  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1021  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.7 
 
 		 395 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.107249  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0936  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.7 
 
 		 395 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2261  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.7 
 
 		 395 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.715981  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1142  hypothetical protein  32.7 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0098  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.7 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.992501  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1515  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.7 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.149273  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4229  hypothetical protein  29.1 
 
 		 404 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3288  hypothetical protein  29.1 
 
 		 404 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.120126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.44 
 
 		 403 aa  155  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3651  hypothetical protein  28.65 
 
 		 403 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.827803 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4137  Male sterility-like  28.84 
 
 		 404 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4125  hypothetical protein  28.57 
 
 		 404 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4376  hypothetical protein  28.5 
 
 		 412 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  27.49 
 
 		 671 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4890  amino acid adenylation domain-containing protein  31.15 
 
 		 1500 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.365672 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  27.65 
 
 		 1454 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4933  Male sterility domain protein  30.47 
 
 		 437 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  0.407936 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4416  amino acid adenylation domain-containing protein  31.58 
 
 		 1485 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13425  short chain dehydrogenase  25.17 
 
 		 650 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  28.14 
 
 		 937 aa  72.4  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2522  Male sterility domain protein  30 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  26 
 
 		 661 aa  70.9  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2676  hypothetical protein  29.38 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0511814 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2093  polyketide synthase, putative  28.62 
 
 		 4048 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3148  Male sterility domain protein  27.17 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4728  hypothetical protein  24.42 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1856  polyketide non-ribosomal peptide synthase  28.62 
 
 		 4123 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3912  thioester reductase domain-containing protein  24 
 
 		 505 aa  65.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501975  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0434  polyketide synthase  28.62 
 
 		 4157 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7306  peptide synthetase  26.44 
 
 		 1506 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.370247  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2595  thioester reductase  26.67 
 
 		 506 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.410224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0530  putative polyketide synthase PksM  28.25 
 
 		 4122 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1451.1  hypothetical protein  28.25 
 
 		 4580 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2161  hypothetical protein  28.25 
 
 		 4098 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0845  hypothetical protein  28.25 
 
 		 4101 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5128  Male sterility domain protein  26.01 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4094  Male sterility domain protein  24.71 
 
 		 359 aa  62  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.796216  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4147  hypothetical protein  26.1 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3608  Male sterility domain protein  25.86 
 
 		 637 aa  61.2  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.619777  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3013  hypothetical protein  25.59 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0103839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4292  amino acid adenylation domain-containing protein  30 
 
 		 1188 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375384  normal  0.670751 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  25 
 
 		 664 aa  59.7  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.447449 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05348  conserved hypothetical protein  28.04 
 
 		 413 aa  59.3  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0521089  normal  0.0191103 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.37 
 
 		 320 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4973  amino acid adenylation  30 
 
 		 1188 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432296  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3187  amino acid adenylation domain-containing protein  30 
 
 		 1188 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  27.17 
 
 		 1449 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  24.92 
 
 		 2376 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.44 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4881  linear gramicidin synthetase subunit C  24.35 
 
 		 1193 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5489  amino acid adenylation domain-containing protein  26.59 
 
 		 2439 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934581 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0443  linear gramicidin synthetase subunit C  25.09 
 
 		 1193 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  23.87 
 
 		 665 aa  57.4  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2112  HAD family hydrolase  23.42 
 
 		 750 aa  57  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1667  hypothetical protein  30.2 
 
 		 358 aa  57  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0262372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  27.17 
 
 		 1498 aa  57  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2548  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.74 
 
 		 357 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.211068 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.08 
 
 		 327 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05610  aminoadipate reductase large subunit (Eurofung)  24.43 
 
 		 1421 aa  56.2  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0476531 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  25.1 
 
 		 671 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0368  amino acid adenylation domain-containing protein  26.1 
 
 		 1194 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2551  hypothetical protein  25.62 
 
 		 351 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0234245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1750  Male sterility domain protein  25.99 
 
 		 642 aa  54.7  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1327  Male sterility domain protein  25.1 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38219  normal  0.51823 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.08 
 
 		 330 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1805  amino acid adenylation domain-containing protein  25.3 
 
 		 1413 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.323791  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  25.18 
 
 		 1270 aa  54.7  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  23.11 
 
 		 659 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0364  Male sterility domain protein  26.76 
 
 		 493 aa  53.9  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  26.02 
 
 		 1067 aa  53.9  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0491  short chain dehydrogenase  25 
 
 		 668 aa  53.9  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442129 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.46 
 
 		 352 aa  53.1  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4168  Male sterility domain  30.13 
 
 		 764 aa  52.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68020  L-aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase, large subunit  21.76 
 
 		 1394 aa  51.6  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224506  normal  0.0608631 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  24.46 
 
 		 2374 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08105  NRPS-like enzyme, putative (JCVI)  20.74 
 
 		 1077 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.250944 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.25 
 
 		 383 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2092  AMP-dependent synthetase and ligase  25.9 
 
 		 1406 aa  51.2  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261871  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 		 334 aa  51.2  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.19 
 
 		 333 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 		 326 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1067  Male sterility-like protein  26.51 
 
 		 685 aa  50.8  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.83 
 
 		 333 aa  50.8  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0280203  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1104  Male sterility domain protein  26.42 
 
 		 701 aa  50.8  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972313  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  23.6 
 
 		 340 aa  50.8  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2871  Male sterility domain protein  24.25 
 
 		 381 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  22.58 
 
 		 333 aa  50.1  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>