More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2548 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2548  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
357 aa  739    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.211068 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5287  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.25 
 
 
350 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.59 
 
 
337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.537903 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2764  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.24 
 
 
359 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.208081  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2856  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.43 
 
 
359 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.745602  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2948  Male sterility domain protein  29.43 
 
 
359 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0517571  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  25.68 
 
 
680 aa  125  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.15 
 
 
333 aa  104  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0315  oxidoreductase domain-containing protein  22.7 
 
 
694 aa  98.2  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596905  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.75 
 
 
333 aa  95.5  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0280203  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 
352 aa  93.2  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.08 
 
 
334 aa  92.4  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.1 
 
 
334 aa  91.7  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.53 
 
 
320 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein/3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  28.75 
 
 
330 aa  89.7  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.85 
 
 
321 aa  89.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2608  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.57 
 
 
329 aa  89.7  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.336008  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.85 
 
 
321 aa  89.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.55 
 
 
321 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.35 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.481935 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.85 
 
 
334 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.225556  normal  0.379661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.32 
 
 
330 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.116288 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2639  UDP-glucose 4-epimerase  26.3 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.37 
 
 
321 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.7 
 
 
321 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 
370 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.247545 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.78 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4340  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.44 
 
 
371 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.123025 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.63 
 
 
320 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.667307 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  25.51 
 
 
324 aa  79  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.6 
 
 
346 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178304  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.62 
 
 
333 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297924  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  24.92 
 
 
318 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.28 
 
 
330 aa  78.6  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4109  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.66 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4185  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.66 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0437586  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4635  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.93 
 
 
375 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.75 
 
 
321 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.91 
 
 
336 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 
333 aa  77  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4056  dehydrogenase, putative  27.94 
 
 
330 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.85 
 
 
388 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.791984  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 
296 aa  76.6  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 
329 aa  76.3  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1984  UDP-glucose 4-epimerase  28.36 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2075  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.11 
 
 
366 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0864456  normal  0.131531 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.36 
 
 
313 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000549333 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.23 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.95 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469702  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 
501 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.73 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0581323  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002734  UDP-glucose 4-epimerase  25.74 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106036  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.32 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.32 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.45 
 
 
315 aa  73.9  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0943322  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.09 
 
 
336 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111318  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2024  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.97 
 
 
317 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0133215  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2555  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.17 
 
 
336 aa  73.6  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.38 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0798  hypothetical protein  27.48 
 
 
318 aa  73.2  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17440  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.18 
 
 
330 aa  72.8  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147754  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0228  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  23.39 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.194906  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11128  cholesterol dehydrogenase  28.11 
 
 
370 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2220  Male sterility-like protein  25.68 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589015  normal  0.345847 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0220  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  23.89 
 
 
338 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 
370 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.51 
 
 
309 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2099  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.3 
 
 
330 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0931539  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 
326 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  30.57 
 
 
340 aa  72  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0549  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.22 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.08 
 
 
510 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0579282  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.48 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2645  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.2 
 
 
326 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
311 aa  72  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.53 
 
 
370 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.826654 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.23 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.17 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11357  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4083  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.14 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.51 
 
 
366 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.71 
 
 
324 aa  70.9  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.552356  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0827  hypothetical protein  27.2 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0036  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.66 
 
 
316 aa  70.5  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0174817 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1122  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.03 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0864  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.76 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.2 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232422 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.42 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2769  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.7 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3001  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  23.56 
 
 
328 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.46 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2938  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  23.56 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0539  hypothetical protein  28.17 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
329 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>